Expressão gênica de células estromais associada à resposta à quimioterapia neoadjuvante em câncer de mama localmente avançado.

• Processo: 19/27671-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2020
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Maria Aparecida Azevedo Koike Folgueira
• Beneficiário: Maria Aparecida Azevedo Koike Folgueira
• Instituição Sede: Instituto do Câncer do Estado de São Paulo Octavio Frias de Oliveira (ICESP). São Paulo , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: São Paulo
• Assunto(s): Oncologia Neoplasias mamárias Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Breast Cancer | Chemotherapy neoadjuvant | gene expression | Stromal cells | Oncologia

Resumo

Em câncer de mama, o compartimento estromal pode influenciar a resposta à quimioterapia. Nosso objetivo foi detectar uma assinatura de células estromais (usando uma abordagem direta de microdissecção de células estromais) associada à resposta à quimioterapia neoadjuvante (neoQT) em câncer de mama localmente avançado (CMLA). Amostras de tumor foram coletadas de 44 pacientes com CMLA (29 com receptor de estrogênio (ER) positivo e 15 ER negativo) antes do início de qualquer tratamento. A quimioterapia neoadjuvante consistiu em doxorrubicina e ciclofosfamida, seguida por paclitaxel. A resposta foi definida como downstaging para o máximo ypT1a-b/ypN0. As células estromais, compostas principalmente por fibroblastos e células imunológicas, foram microdissecadas de amostras de tumores congelados frescos e o perfil de expressão gênica foi determinado usando-se microarranjos Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression. Os níveis de expressão gênica foram comparados usando-se o software MeV (MultiExperiment Viewer), aplicando SAM (análise de significância de microarranjos). Para classificar as amostras de acordo com a resposta do tumor, foi utilizada a ordem das medianas com base nas declarações de confiança (MedOr) e para identificar conjuntos de genes correlacionados com o fenótipo de downstaging, análise de enriquecimento de conjuntos de genes (GSEA). Nove pacientes apresentaram downstaging da doença. Onze sequências (FDR 17) foram expressas diferencialmente, todas (exceto H2AFJ) mais expressas em tumores responsivos, incluindo PTCHD1 e genes envolvidos na fisiologia anormal das células T citotóxicas, TOX, LY75 e SH2D1A. Quatro pares de marcadores puderam classificar corretamente todas as amostras de tumor, de acordo com a resposta: PTCHD1/PDXDC2P, LOC100506731/NEURL4, SH2D1A/ENST00000478672 e TOX/H2AFJ. Os conjuntos de genes correlacionados com a resposta do tumor (FDR <0,01) estavam envolvidos principalmente em resposta imune ou em ativação de linfócitos, incluindo CD47, LCK, NCK1 , CD24, CD3E, ZAP70, FOXP3 e CD74, entre outros. Em câncer de mama localmente avançado, as células estromais podem apresentar características específicas da resposta imune, que podem estar associadas à resposta à quimioterapia. (AU)