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Sequencias genômicas de alta qualidade de oito cepas de Xylella fastidiosa isoladas de citros, café, ameixa e hibisco na América do Sul.

Processo: 20/11682-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de outubro de 2020 - 31 de março de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Aline Maria da Silva
Beneficiário:Aline Maria da Silva
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Clorose variegada dos citros  Genomas  Sequenciamento  Xylella fastidiosa 

Resumo

Xylella fastidiosa subsp. pauca, anteriormente restrita à América do Sul e encontrada principalmente em laranjeiras e cafeeiros, está associada a outros hospedeiros e em outras regiões geográficas. Neste trabalho, apresentamos sequências de alta qualidade do genoma de X. fastidiosa subsp. pauca, cepas J1a12, B111, U24D e XRB isoladas de laranjeiras no Brasil, cepa Fb7 isolada de uma laranjeira na Argentina e cepas 3124, Pr8x e Hib4 isoladas, respectivamente, de cafeeiro, ameixeira e hibisco no Brasil. O sequenciamento foi realizado usando as plataformas Roche 454-GS FLX, MiSeq-Illumina ou Pacific Biosciences. Esses genomas com montagens de alta qualidade serão úteis para futuros estudos sobre a diversidade genômica, evolução e biologia de X. fastidiosa. (AU)