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Investigação de elementos induzidos pela resposta vacinal nos indivíduos submetidos aos testes clínicos com a vacina ChAdOx1 nCOV-19

Processo: 20/08943-5
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de dezembro de 2020 - 30 de novembro de 2025
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
Pesquisador responsável:Luiz Mário Ramos Janini
Beneficiário:Luiz Mário Ramos Janini
Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores principais:
Marcelo Ribeiro da Silva Briones ; Maria Isabel de Moraes Pinto
Pesquisadores associados:Carla Torres Braconi ; Daniela Santoro Rosa ; Eduardo Alexandrino Servolo de Medeiros ; Fernando Martins Antoneli Junior ; Gilles Landman ; Ieda Maria Longo Maugéri ; Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho Mello ; Juliana Terzi Maricato ; Lily Yin Weckx ; Marimélia Aparecida Porcionatto ; Mauro José Costa Salles ; Paulo Roberto Abrão Ferreira ; Ricardo Sobhie Diaz
Bolsa(s) vinculada(s):23/14749-5 - Genotipagem de HCV usando modelos baseados em redes neurais profundas com arquitetura "Transformer", BP.IC
23/10230-5 - Alterações no transcriptoma do sangue causadas pela vacina ChAdOx1 nCoV-19 em voluntários da UNIFESP e variantes genômicos e epigenômicos do SARS-CoV-2 no Estado de São Paulo, BP.PD
23/07287-5 - Avaliação do escape imunológico do SARS-CoV-2 por meio da análise da resposta imune de pacientes internados com COVID-19 moderada ou grave durante a onde de infecções pela variante Ômicron, BP.PD
+ mais bolsas vinculadas 23/08597-8 - Treinamento e aperfeiçoamento técnico no Biobanco UNIFESP: controle de qualidade de ácidos nucleicos extraídos a partir das amostras positivas para Sars- CoV-2, BP.TT
23/03792-7 - Avaliação do crescimento de diferentes variantes de SARS-CoV-2 em células permissivas: Vero CCL-81 e A549, BP.IC
23/03928-6 - Treinamento e aperfeiçoamento técnico no Biobanco UNIFESP: ampliação da coleção de amostras positivas para Sars-CoV-2, BP.TT
22/03496-6 - Perfil de citocinas e imunofenotipagem de linfócitos do sangue periférico e de células mieloides supressoras em indivíduos vacinados para SARS-CoV-2 durante episódios de sintomas respiratórios: correlação com vírus e intensidade de manifestaçoes clínicas., BP.TT
21/13111-1 - Mapeamento de variantes genômicos e epigenômicos do SARS-CoV-2 no Estado de São Paulo e alterações no transcriptoma do sangue associadas à vacina ChAdOx1 nCoV-19 em voluntários da UNIFESP, BP.PD
21/11236-1 - Alterações no transcriptoma do sangue causadas pela vacina ChAdOx1 nCoV-19 em voluntários da UNIFESP, BP.TT
21/05661-1 - Caracterização virológica de isolados brasileiros de SARS-CoV-2 e suas capacidades de neutralização por soro de indivíduos previamente infectados e/ou vacinados, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Virologia  Ensaio clínico  COVID-19  SARS-CoV-2  Infecções por Coronavirus  Vacinas contra COVID-19  Pandemias  Resposta imune  Biobancos e biorrepositórios 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biorrepositório | Coronavírus SARS-Cov2 | Covid-19 | ensaio clínico | Vacina ChAdOx1 nCov19 | Virologia

Resumo

Esta proposta de pesquisa consiste em um desdobramento do projeto internacional com amostras de indivíduos voluntários para o teste da vacina Oxford-UNIFESP ChAdOx1 nCoV-19. A proposta envolverá as 2.000 amostras de voluntários, e os períodos correspondentes, para estabelecer principalmente um repositório para toda a comunidade acadêmica do Estado de São Paulo. Este repositório será convertido em um biobanco após a conclusão do projeto, conforme declarado na legislação atual. Além disso, as amostras armazenadas no biorrepositório serão usadas para realizar análises dessas amostras que não se sobrepõem às "Medidas de resultados primários e secundários", conforme descrito na documentação do ensaio clínico disponível em ClinicalTrials.gov (Institutos Nacionais de Saúde, ID NCT04400838). O projeto será coordenado pelo Prof. Luiz Mario Ramos Janini e incluirá uma equipe de pesquisadores principais em diferentes áreas, referentes aos objetivos específicos e histórico de pesquisa da FAPESP. Os objetivos deste projeto são: (1) estabelecer um biorrepositório contendo todas as amostras obtidas de voluntários antes e depois da vacinação. Este biorrepositório estará disponível, de acordo com os procedimentos legais, para toda a comunidade científica do Estado de São Paulo, conforme determinado pelas diretrizes da FAPESP; (2) avaliar a capacidade de neutralização de soros de indivíduos vacinados contra cepas SARS-CoV-2 circulantes específicas do Brasil e outras cepas específicas de coronavírus para avaliação da imunidade cruzada; (3) caracterizar isolados brasileiros de SARS-CoV-2 e estudar a variação de sequência e os padrões evolutivos da proteína "Spike" específicos para avaliar o potencial de escape da vacina por modificação do alvo ou epítopos; (4) gerar e analisar perfis de citocinas de soros de voluntários antes e após a vacinação para avaliar a resposta inflamatória e efeitos associados; (5) analisar e comparar os transcriptomas sanguíneos de voluntários, por RNA-seq, antes e após a vacinação. Essa análise será quantitativa e qualitativa para avaliar o impacto da vacina nos níveis diferenciais de expressão gênica e avaliar a variação individual na resposta genética à vacina e (6) analisar o perfil de secretoma no sangue total dos voluntários, antes e após a vacinação, para avaliar o tipo de resposta imune predominante e possível "priming" por outro coronavírus. (AU)

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Publicações científicas (11)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CAMPOS, JOAO H. C.; MARICATO, JULIANA T.; BRACONI, CARLA T.; ANTONELI, FERNANDO; JANINI, LUIZ MARIO R.; BRIONES, MARCELO R. S.. Direct RNA Sequencing Reveals SARS-CoV-2 m6A Sites and Possible Differential DRACH Motif Methylation among Variants. Viruses-Basel, v. 13, n. 11, . (20/08943-5)
ANTONELI, F.; FURUYAMA, T. N.; CARVALHO, I. M. V. G.; BRIONES, M. R. S.; JANINI, L. M. R.. Temporal data series and logistic models reveal the dynamics of SARS-CoV-2 spike protein D614G variant in the COVID-19 pandemic. Genetics and Molecular Research, v. 20, n. 4, . (20/08943-5)
HAYASHI, JACKELINNE Y.; SIMIZO, ADRIANA; MIYAMOTO, JACKSON G.; COSTA, LUCAS V. S.; SOUZA, OLIVIA F.; CHIARELLI, TASSIA; BACAROV, NATALIA B. S.; HIDALGO, RAFAELA; GARCIA, LETICIA D.; SOANE, MICHEL M.; et al. Humoral and cellular responses to vaccination with homologous CoronaVac or ChAdOx1 and heterologous third dose with BNT162b2. Journal of Infection, v. 84, n. 6, p. 3-pg., . (20/08943-5, 17/20106-9)
ANDREATA-SANTOS, ROBERT; JANINI, LUIZ M. R.; DURAES-CARVALHO, RICARDO. From Alpha to Omicron SARS-CoV-2 variants: What their evolutionary signatures can tell us?. Journal of Medical Virology, . (21/03684-4, 19/01255-9, 21/05661-1, 20/08943-5)
FUNADA BARBOSA, MIKAELA RENATA; GARCIA, SUZI CRISTINA; BRUNI, ANTONIO DE CASTRO; MACHADO, FLAVIO SILVA; DE OLIVEIRA, ROBERTO XAVIER; DROPA, MILENA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, ELCIO; BRANDAO, CARLOS JESUS; OLIVEIRA DA SILVA, RENAN LOURENCO; et al. One-year surveillance of SARS-CoV-2 in wastewater from vulnerable urban communities in metropolitan Sao Paulo, Brazil. JOURNAL OF WATER AND HEALTH, v. N/A, p. 19-pg., . (20/08943-5)
ANDREATA-SANTOS, ROBERT; MACHADO, RAFAEL RAHAL GUARAGNA; DOS SANTOS ALVES, RUBENS PRINCE; SALES, NATIELY SILVA; SOARES, CAMILA PEREIRA; RODRIGUES, KARINE BITENCOURT; SILVA, MARIANGELA OLIVEIRA; FAVARO, MARIANNA TEIXEIRA DE PINHO; RODRIGUES-JESUS, MONICA JOSIANE; YAMAMOTO, MARCIO MASSAO; et al. Validation of Serological Methods for COVID-19 and Retrospective Screening of Health Employees and Visitors to the Sao Paulo University Hospital, Brazil. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 12, p. 8-pg., . (20/08943-5, 16/20045-7, 21/05661-1, 14/50890-5, 16/23560-0, 15/02352-7, 20/06409-1, 17/24769-2, 16/14344-1, 18/23680-0, 20/10700-3, 18/07629-5, 18/07142-9)
BARTOLOMEO, CYNTHIA SILVA; LEMES, ROBERTHA MARIANA RODRIGUES; MORAIS, RAFAEL LEITE; PERERIA, GABRIELA CRUZ; NUNES, TAMIRES ALVES; COSTA, ANGELICA JARDIM; MACIEL, RUI MONTEIRO DE BARROS; BRACONI, CARLA TORRES; MARICATO, JULIANA TERZI; JANINI, LUIZ MARIO RAMOS; et al. SARS-CoV-2 infection and replication kinetics in different human cell types: The role of autophagy, cellular metabolism and ACE2 expression. Life Sciences, v. 308, p. 13-pg., . (20/04709-8, 06/60402-1, 20/06153-7, 20/13480-4, 20/08943-5, 16/20796-2, 19/10922-9)
CAMPOS, JOAO H. C.; ALVES, GUSTAVO V.; MARICATO, JULIANA T.; BRACONI, CARLA T.; ANTONELI, FERNANDO M.; JANINI, LUIZ MARIO R.; BRIONES, MARCELO R. S.. The epitranscriptome of Vero cells infected with SARS-CoV-2 assessed by direct RNA sequencing reveals m6A pattern changes and DRACH motif biases in viral and cellular RNAs. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 12, p. 19-pg., . (20/08943-5, 21/13111-1)
RODRIGUES-JESUS, MONICA JOSIANE; FAVARO, MARIANNA TEIXEIRA DE PINHO; VENCESLAU-CARVALHO, ALEXIA ADRIANNE; DE CASTRO-AMARANTE, MARIA FERNANDA; ALMEIDA, BIANCA DA SILVA; SILVA, MARIANGELA DE OLIVEIRA; ANDREATA-SANTOS, ROBERT; BARBOSA, CECILIA GOMES; BRITO, SAMANTHA CARVALHO MAIA; FREITAS-JUNIOR, LUCIO H.; et al. Nano-multilamellar lipid vesicles promote the induction of SARS-CoV-2 immune responses by a protein-based vaccine formulation. Nanomedicine-Nanotechnology Biology and Medicine, v. 45, p. 11-pg., . (20/10700-3, 20/08943-5, 16/23560-0, 20/05204-7, 21/05661-1)
CAMPOS, JOAO H. C.; AGUILAR, ANA C. R.; ANTONELI, FERNANDO; TRUZZI, GISELLE; BRIONES, MARCELO R. S.; FERREIRA, RENATA C.; COELHO, FERNANDO M. S.. Whole-genome analysis of monozygotic Brazilian twins discordant for type 1 narcolepsy: a case report. BMC Neurology, v. 22, n. 1, p. 8-pg., . (20/08943-5, 21/13111-1)
JOAQUIM SILVA JUNIOR, JOSE VALTER; DURAES-CARVALHO, RICARDO; DE SOUZA, JOELMA RODRIGUES; RAMOS JANINI, LUIZ MARIO; WEIBLEN, RUDI; FLORES, EDUARDO FURTADO. Emergence of SARS-CoV-2 serotype(s): Is it a matter of time?. VIROLOGY, v. 585, p. 4-pg., . (19/01255-9, 20/08943-5, 21/03684-4)

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