Investigação de elementos induzidos pela resposta vacinal nos indivíduos submetidos aos testes clínicos com a vacina ChAdOx1 nCOV-19

• Processo: 20/08943-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de dezembro de 2020 - 30 de novembro de 2025
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
• Pesquisador responsável: Luiz Mário Ramos Janini
• Beneficiário: Luiz Mário Ramos Janini
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Marcelo Ribeiro da Silva Briones ; Maria Isabel de Moraes Pinto
• Pesquisadores associados: Carla Torres Braconi ; Daniela Santoro Rosa ; Eduardo Alexandrino Servolo de Medeiros ; Fernando Martins Antoneli Junior ; Gilles Landman ; Ieda Maria Longo Maugéri ; Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho Mello ; Juliana Terzi Maricato ; Lily Yin Weckx ; Marimélia Aparecida Porcionatto ; Mauro José Costa Salles ; Paulo Roberto Abrão Ferreira ; Ricardo Sobhie Diaz
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/03928-6 - Treinamento e aperfeiçoamento técnico no Biobanco UNIFESP: ampliação da coleção de amostras positivas para Sars-CoV-2, BP.TT; 22/03496-6 - Perfil de citocinas e imunofenotipagem de linfócitos do sangue periférico e de células mieloides supressoras em indivíduos vacinados para SARS-CoV-2 durante episódios de sintomas respiratórios: correlação com vírus e intensidade de manifestaçoes clínicas., BP.TT; 21/13111-1 - Mapeamento de variantes genômicos e epigenômicos do SARS-CoV-2 no Estado de São Paulo e alterações no transcriptoma do sangue associadas à vacina ChAdOx1 nCoV-19 em voluntários da UNIFESP, BP.PD; 21/11236-1 - Alterações no transcriptoma do sangue causadas pela vacina ChAdOx1 nCoV-19 em voluntários da UNIFESP, BP.TT; 21/05661-1 - Caracterização virológica de isolados brasileiros de SARS-CoV-2 e estudo da variação de sequência e os padrões evolutivos da proteína Spike específicos para avaliar o potencial de escape da vacina por modificação do alvo ou epítopos, BP.PD
• Assunto(s): Virologia Ensaio clínico COVID-19 SARS-CoV-2 Infecções por Coronavirus Vacinas contra COVID-19 Pandemias Resposta imune Biobancos e biorrepositórios
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biorrepositório | Coronavírus SARS-Cov2 | Covid-19 | ensaio clínico | Vacina ChAdOx1 nCov19 | Virologia

Resumo

Esta proposta de pesquisa consiste em um desdobramento do projeto internacional com amostras de indivíduos voluntários para o teste da vacina Oxford-UNIFESP ChAdOx1 nCoV-19. A proposta envolverá as 2.000 amostras de voluntários, e os períodos correspondentes, para estabelecer principalmente um repositório para toda a comunidade acadêmica do Estado de São Paulo. Este repositório será convertido em um biobanco após a conclusão do projeto, conforme declarado na legislação atual. Além disso, as amostras armazenadas no biorrepositório serão usadas para realizar análises dessas amostras que não se sobrepõem às "Medidas de resultados primários e secundários", conforme descrito na documentação do ensaio clínico disponível em ClinicalTrials.gov (Institutos Nacionais de Saúde, ID NCT04400838). O projeto será coordenado pelo Prof. Luiz Mario Ramos Janini e incluirá uma equipe de pesquisadores principais em diferentes áreas, referentes aos objetivos específicos e histórico de pesquisa da FAPESP. Os objetivos deste projeto são: (1) estabelecer um biorrepositório contendo todas as amostras obtidas de voluntários antes e depois da vacinação. Este biorrepositório estará disponível, de acordo com os procedimentos legais, para toda a comunidade científica do Estado de São Paulo, conforme determinado pelas diretrizes da FAPESP; (2) avaliar a capacidade de neutralização de soros de indivíduos vacinados contra cepas SARS-CoV-2 circulantes específicas do Brasil e outras cepas específicas de coronavírus para avaliação da imunidade cruzada; (3) caracterizar isolados brasileiros de SARS-CoV-2 e estudar a variação de sequência e os padrões evolutivos da proteína "Spike" específicos para avaliar o potencial de escape da vacina por modificação do alvo ou epítopos; (4) gerar e analisar perfis de citocinas de soros de voluntários antes e após a vacinação para avaliar a resposta inflamatória e efeitos associados; (5) analisar e comparar os transcriptomas sanguíneos de voluntários, por RNA-seq, antes e após a vacinação. Essa análise será quantitativa e qualitativa para avaliar o impacto da vacina nos níveis diferenciais de expressão gênica e avaliar a variação individual na resposta genética à vacina e (6) analisar o perfil de secretoma no sangue total dos voluntários, antes e após a vacinação, para avaliar o tipo de resposta imune predominante e possível "priming" por outro coronavírus. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CAMPOS, JOAO H. C.; MARICATO, JULIANA T.; BRACONI, CARLA T.; ANTONELI, FERNANDO; JANINI, LUIZ MARIO R.; BRIONES, MARCELO R. S.. Direct RNA Sequencing Reveals SARS-CoV-2 m6A Sites and Possible Differential DRACH Motif Methylation among Variants. Viruses-Basel, v. 13, n. 11, NOV 2021. (20/08943-5)

ANTONELI, F.; FURUYAMA, T. N.; CARVALHO, I. M. V. G.; BRIONES, M. R. S.; JANINI, L. M. R.. Temporal data series and logistic models reveal the dynamics of SARS-CoV-2 spike protein D614G variant in the COVID-19 pandemic. Genetics and Molecular Research, v. 20, n. 4, DEC 13 2021. (20/08943-5)

ANDREATA-SANTOS, ROBERT; JANINI, LUIZ M. R.; DURAES-CARVALHO, RICARDO. From Alpha to Omicron SARS-CoV-2 variants: What their evolutionary signatures can tell us?. Journal of Medical Virology, JAN 2022. (21/03684-4, 19/01255-9, 21/05661-1, 20/08943-5)