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Diagnóstico da infecção pelo SARS-CoV2, em diferentes materiais biológicos, em pessoas infectadas por esse vírus

Processo:20/05623-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2021
Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2023
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Maria Cássia Jacintho Mendes Corrêa
Beneficiário:Maria Cássia Jacintho Mendes Corrêa
Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:São Paulo
Pesquisadores associados: Ana Luiza de Souza Bierrenbach ; Fabio Eudes Leal ; João Carlos da Silva Bizario ; Silvia Figueiredo Costa ; Tania Regina Tozetto Mendoza
Assunto(s):Infecções por Coronavirus  COVID-19  SARS-CoV-2  Materiais biológicos  Secreções corporais  Técnicas e procedimentos diagnósticos  Testes sorológicos  Pandemias 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Covid 19 | diagnóstico | Material biológico | Sars-Cov2 | Doenças Infecciosas e Parasitárias

Resumo

De forma geral o diagnóstico da infecção pelo SARS-CoV-2 em todo o mundo, ocorre na fase aguda da doença e por meio da identificação do vírus em amostras coletadas por swab de nasofaringe e eventualmente saliva. Pouco se conhece sobre a presença desse agente em outros materiais biológicos e em diferentes fases da doença. Da mesma forma, pouco se conhece sobre a associação da excreção desse agente nessas secreções e a resposta imune-humoral. O esclarecimento dessas informações poderia auxiliar na compreensão da história natural da doença e auxiliar no diagnóstico e manejo desses pacientes, esclarecendo importantes aspectos da transmissão interpessoal, hospitalar e comunitária deste agente. Objetivos 1 - Investigar a presença do SARS-CoV-2 em swab de naso faringe, saliva, urina, sangue e fezes, durante a fase aguda e de convalescença da infecção em pacientes imunocompetentes e imunodeprimidos; 2 - Investigar a presença do SARS-CoV-2 em saliva ou swab de naso-faringe de contactantes de pacientes com Covid-19; 3 - Correlacionar a presença do SARS-CoV 2 nesses materiais biológicos e os títulos de anticorpos neutralizantes e anticorpos do tipo IgG por ELISA; 4 - Investigar a taxa de permanência e infectividade do SARS-CoV-2 nesses pacientes durante a fase aguda e de convalescença da COVID-19. Metodologia - Trata-se de um estudo observacional, prospectivo, a ser desenvolvido em pacientes e contactantes assintomáticos desses pacientes, atendidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP, Instituto do Câncer do Estado de São Paulo (ICESP) e no município de São Caetano do Sul, com diagnóstico de infecção pelo SARS-CoV-2. Serão incluídos 125 pacientes, divididos em 3 grupos de pacientes: 1 - Pacientes sintomáticos sem diagnóstico de qualquer imunodepressão prévia (50 pacientes); 2 - Pacientes sintomáticos com diagnóstico de tumores sólidos ou candidatos a Transplante de Células-tronco Hematopoiéticas (25 pacientes); 3 - Contactantes assintomáticos destes pacientes (qualquer grupo - 50 pacientes). Coletas de sangue, urina, saliva, e swabs de naso faringe e anal serão realizadas durante 5 semanas seguidas, com intervalos de uma semana (dias 1, 7, 14, 21, 28) a iniciar até 72 horas do momento do diagnóstico em todos os pacientes dos grupos 1 e 2. Para pacientes do grupo 3, será coletada apenas saliva e swab de naso faringe no dia 1. Para a detecção de anticorpos anti-SARS CoV 2, serão utilizadas as técnicas sorológicas de ELISA e o ensaio de neutralização. Para identificação viral serão utilizadas técnicas de biologia molecular e cultivo viral. Ensaios quantitativos duplex (controle interno e gene N ou E) para SARS-CoV-2 serão realizados segundo protocolos adaptados, com os iniciadores e sondas para o ensaio de PCR em tempo real. O isolamento viral será realizado em laboratório de segurança nível 3 (NB-3), e as amostras serão submetidas a isolamento em células VeroE6, sabidamente susceptíveis a Coronavirus. (AU)

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Publicações científicas (7)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
MENDES CORREA, MARIA C.; LEAL, FABIO E.; VILLAS BOAS, LUCY S.; WITKIN, STEVEN S.; DE PAULA, ANDERSON; TOZETTO MENDONZA, TANIA R.; FERREIRA, NOELY E.; CURTY, GISLAINE; DE CARVALHO, PEDRO S.; BUSS, LEWIS F.; et al. Prolonged presence of replication-competent SARS-CoV-2 in mildly symptomatic individuals: A report of two cases. Journal of Medical Virology, v. 93, n. 9, p. 5603-5607, . (20/05623-0)
LUCY SANTOS VILLAS-BOAS; ANDERSON VICENTE DE PAULA; ALMIR RIBEIRO DA SILVA JR.; HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA PAIAO; TANIA REGINA TOZETTO-MENDOZA; ERIKA REGINA MANULI; FÁBIO EUDES LEAL; ANDREA DE BARROS COSCELLI FERRAZ; ESTER CERDEIRA SABINO; ANA LUIZA BIERRENBACH; et al. Absence of neutralizing antibodies against the Omicron SARS-CoV-2 variant in convalescent sera from individuals infected with the ancestral SARS-CoV-2 virus or its Gamma variant. Clinics, v. 77, . (20/05623-0)
MENDES-CORREA, MARIA CASSIA; SALOMAO, MATIAS CHIARASTELLI; GHILARDI, FABIO; TOZETTO-MENDOZA, TANIA REGINA; SANTOS VILLAS-BOAS, LUCY; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; PAIAO, HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LEAL, FABIO E.; FERRAZ, ANDREA DE BARROS COSCELLI; et al. SARS-CoV-2 Detection and Culture in Different Biological Specimens from Immunocompetent and Immunosuppressed COVID-19 Patients Infected with Two Different Viral Strains. Viruses-Basel, v. 15, n. 6, p. 12-pg., . (20/05623-0)
DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; MENDES-CORREA, MARIA C.; TOZETTO-MENDOZA, TANIA REGINA; VILLAS-BOAS, LUCY S.; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; PAIAO, HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA; LEAL, FABIO E.; FERREIRA, NOELY E.; HONORATO, LAYLA; LEAL, ELCIO; et al. Detailed characterization of Redondovirus in saliva of SARS-CoV-2-infected individuals in Sao Paulo, Brazil. PLoS One, v. 18, n. 8, p. 10-pg., . (20/05623-0)
HONORATO, LAYLA; FERREIRA, NOELY EVANGELISTA; DOMINGUES, RENAN BARROS; SENNE, CARLOS; LEITE, FERNANDO BRUNALE VILELA DE MOURA; DOS SANTOS, MARCIO VEGA; FERNANDES, GUSTAVO BRUNIERA PERES; PAIAO, HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA; VILAS BOAS, LUCY SANTOS; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; et al. Evaluation of enterovirus concentration, species identification, and cerebrospinal fluid parameters in patients of different ages with aseptic meningitis in Sao Paulo, Brazil. Journal of Medical Virology, v. 96, n. 2, p. 8-pg., . (20/05623-0)
TOZETTO-MENDOZA, TANIA R. R.; MENDES-CORREA, MARIA CASSIA; LINHARES, IARA MORENO; RAYMUNDI, VANESSA DE CASSIA; PAIAO, HEUDER GUSTAVO DE OLIVEIRA; BARBOSA, ERICK MATHEUS GARCIA; LUNA-MUSCHI, ALESSANDRA; HONORATO, LAYLA; CORREA, GIOVANNA FRANCISCO; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; et al. Association between development of severe COVID-19 and a polymorphism in the CIAS1 gene that codes for an inflammasome component. SCIENTIFIC REPORTS, v. 13, n. 1, p. 5-pg., . (20/05623-0)
MARIA CASSIA MENDES-CORREA; FÁBIO DE ROSE GHILARDI; MATIAS CHIARASTELLI SALOMÃO; LUCY SANTOS VILLAS-BOAS; ANDERSON VICENTE DE PAULA; HEUDER GUSTAVO OLIVEIRA PAIAO; ANTONIO CHARLYS DA COSTA; TÂNIA REGINA TOZETTO-MENDOZA; WILTON FREIRE; FLAVIA CRISTINA SILVA SALES; et al. SARS-CoV-2 shedding, infectivity, and evolution in an immunocompromised adult patient. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 66, . (20/05623-0, 18/14389-0)