Controle pós-transcricional de expressão gênica: processamento de pré-rRNA, degradação de mRNA, splicing e montagem de snoRNPs em Saccharomyces cerevisiae

• Processo: 20/00901-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2021
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Carla Columbano de Oliveira
• Beneficiário: Carla Columbano de Oliveira
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Alexander Henning Ulrich ; Marcos Vicente de Albuquerque Salles Navarro ; Olivier Gadal
• Auxílio(s) vinculado(s): 24/19270-2 - Decifrando a organização sub-nucleolar de complexos do exossomo no nucléolo., AP.R SPRINT; 23/00368-0 - Uso de Microscopia de Alta Resolução para Investigar o Papel Funcional do Exosome em Complexos Sub-nucleolares, AP.R SPRINT; 22/08812-3 - EMU concedido no projeto 20/00901-1: sistema de cromatografia líquida FPLC, AP.EMU
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/03395-0 - Interações entre Fatores de Splicing e o pequeno RNA nuclear (snRNA) U2 Durante a Montagem do Spliceossomo em Saccharomyces cerevisiae., BP.MS; 24/02036-7 - Estudo do papel da subunidade do exossomo DIS3 no controle de ciclo celular, BP.PD; 23/06344-5 - Análise do efeito da presença do pré-rRNA 7S nas subunidades 60S na tradução em Saccharomyces cerevisiae, BP.DR; + mais bolsas vinculadas 22/16359-7 - Caracterização da interação de novas proteínas com o exossomo, BP.IC; 22/06549-3 - Efeito da Ausência do Fator de Splicing Cwc24 no Interactoma da Prp11 em Saccharomyces cerevisiae, BP.IC; 22/00071-4 - Identificação de carioferinas envolvidas na importação nuclear das subunidades do exossomo em Saccharomyces cerevisiae, BP.PD; 21/14620-7 - Influência da fosforilação de proteínas do complexo préribossomal 90s no recrutamento do exossomo e seu papel na sinalização durante o processamento e controle de qualidade dos pré-rRNAS, BP.PD; 21/14137-4 - Caracterização do papel do fator geral de splicing CWC24 em pré-mRNA em Saccharomyces cerevisiae, BP.DD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Expressão gênica Processamento pós-transcricional do RNA Interação proteína-proteína Fatores de processamento de RNA Ribossomos Motivo de reconhecimento de RNA Estabilidade de RNA Ribonucleoproteínas nucleolares pequenas Saccharomyces cerevisiae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Complexos ribonucleoproteicos | Interação proteína-proteína | interação proteína-RNA | Maturação de ribossomos | processamento de RNA | splicing | Controle de Expressão Gênica

Resumo

Em eucariotos, os RNAs passam por várias etapas de processamento para sua maturação, que envolvem interações específicas proteína-proteína e RNA-proteínas que são essenciais para o controle de expressão gênica. Nosso grupo tem caracterizado funcionalmente várias proteínas envolvidas em controle de expressão gênica. A RNase denominada exossomo tem sido nosso foco central da pesquisa, com estudos funcionais do complexo em levedura e estruturais do exossomo tanto de levedura como de archaea. Este projeto visa à continuação dos estudos do exossomo de levedura, e principalmente da localização subcelular de suas subunidades e do recrutamento deste complexo para as partículas pré-ribossomais. Um novo desafio também proposto aqui é o de estudo da participação do exossomo no controle de expressão de mRNAs em humanos. É proposta ainda a continuação do estudo de proteínas de Saccharomyces cerevisiae identificadas e caracterizadas anteriormente no laboratório, proteínas essas envolvidas em diferentes etapas de controle de expressão gênica, em vias conectadas entre si através interações proteicas. No centro dessas interações está Nop17, que faz parte do complexo co-chaperone R2TP e participa da montagem de complexos multiproteicos. Nop17 interage com o exossomo, com fatores de splicing, com subunidades de snoRNPs, com proteínas do pré-60S e com uma proteína que contém clusters Fe/S. Este projeto é, portanto, bastante abrangente e envolve o estudo de diferentes complexos enzimáticos. Dada a conservação evolutiva destes processos em eucariotos, os resultados poderão ser depois extrapolados para humanos, nos quais doenças já foram identificadas como sendo causadas por mutações nos genes das ortólogas estudadas por nós. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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FERRUZO, PAULT Y. M.; BOELL, VIKTOR K.; RUSSO, LILIAN C.; OLIVEIRA, CARLA C.; FORTI, FABIO L.. DUSP3 modulates IRES-dependent translation of mRNAs through dephosphorylation of the HNRNPC protein in cells under genotoxic stimulus. BIOLOGY OF THE CELL, v. 116, n. 5, p. 15-pg., 2024-03-27. (20/00901-1, 22/04243-4, 08/58264-5, 15/03983-0, 18/01753-6, 22/13414-7)

VIEIRA, EDUARDO GUIMARAES; DE PAIVA, RAPHAEL ENOQUE FERRAZ; MIGUEL, RODRIGO BERNARDI; DE OLIVEIRA, ANA PAULA ARAUJO; BAGATELLI, FELIPE FRANCO DE MELO; OLIVEIRA, CARLA COLUMBANO; TUNA, FLORIANA; FERREIRA, ANA MARIA DA COSTA. An engineered POSS drug delivery system for copper(ii) anticancer metallodrugs in a selective application toward melanoma cells. DALTON TRANSACTIONS, v. 53, n. 30, p. 15-pg., 2024-06-26. (20/00901-1, 16/21070-5, 11/50318-1, 13/07937-8, 16/16735-8, 17/21919-3, 18/21537-6)