Vírus emergentes e reemergentes: biologia, patogênese e prospecção

• Processo: 19/26119-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de junho de 2021 - 31 de maio de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Eurico de Arruda Neto
• Beneficiário: Eurico de Arruda Neto
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Benedito Antônio Lopes da Fonseca ; Luis Lamberti Pinto da Silva ; Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Pesquisadores associados: Fernando Chahud ; Osvaldo Massaiti Takayanagui ; Wilma Terezinha Anselmo Lima
• Auxílios(s) vinculado(s): 22/15883-4 - EMU concedido no processo 2019/26119-0: QuantiStudio" 5 Real-Time PCR System, AP.EMU; 22/15881-1 - EMU concedido no processo 2019/26119-0: leitor de microplaca Varioskan LUX Multimode Microplate Reader, AP.EMU
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/05503-2 - Análise da importância do fator de regulação de CREB3 sobre a replicação do vírus Zika em trofoblastos., BP.IC; 23/02880-0 - Estudo das interações de SARS-CoV-2 com o sistema de endomembranas da célula hospedeira., BP.PD; 22/15243-5 - Estudo da infecção ex vivo de tecido linfóide secundário humano com vírus pandêmicos: Influenza e SARS-CoV-2., BP.MS; + mais bolsas vinculadas 22/15799-3 - Genômica de vírus associados a doença humana, BP.PD; 22/10751-2 - Estudo da Infecção do Baço por SARS-CoV-2, BP.IC; 22/12726-5 - Geração de linhagens celulares knockout para os complexos adaptadores de capa vesicular (APs)., BP.TT; 22/04533-2 - Estudo do tráfego do vírus Oropouche e sua relação com a modulação da via autofágica durante a infeção da célula hospedeira, BP.MS; 22/08111-5 - Análise da expressão gênica unicelular de tecidos linfoides humanos infectados por vírus respiratórios pandêmicos: SARS-CoV-2 e Influenza, BP.PD; 22/09032-1 - Processamento de tecidos linfoides humanos para obter culturas primárias e detectar coronavírus e vírus Influenza., BP.TT; 22/01255-1 - Processamento de amostras de primatas e pequenos mamíferos neotropicais e detecção de coronavírus por RTPCR e/ou RT-qPCR, BP.TT; 22/01222-6 - Papel das proteínas não estruturais de OROV na sua patogênese, BP.IC; 21/05869-1 - Infecção de linfócitos TCD8+ por vírus Influenza, BP.MS; 21/13940-8 - Processamento de tecidos linfoides humanos para obter culturas primárias e detectar coronavírus e vírus Influenza, BP.TT - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Virologia Vírus Arbovirus Influenza SARS-CoV-2 COVID-19 Interações vírus-célula Vacinas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arbovírus | Influenza | SARS-CoV-2 | Virus Emergentes | Vírus transmitidos por roedores | Vírus zoonóticos | Virologia

Resumo

Este projeto temático tem como eixo central pesquisar viroses de grande importância em saúde humana. A proposta parte de cinco grupos de pesquisa que trabalharão em colaboração, lideradas por docentes de carreiras consolidadas, e se compõe de subprojetos em quatro grandes vertentes de trabalho: 1) Interação vírus-célula; 2) Patogênese de infecções virais; 3) Diagnóstico e prospecção de vírus humanos; 4) Testes de drogas e vacinas antivirais. Os patógenos a serem abordados neste Temático são: o vírus da imunodeficiência humana (HIV); os arbovírus Zika (ZIKV), Oropouche (OROV), Mayaro (MAYV), Chikungunya (CHIKV), Dengue (DENV), West Nile (WNV), febre amarela (YFV), encefalite de Saint Louis (SLEV), e Rocio (ROCV); hantavírus causadores de síndrome pulmonar e cardiovascular; arenavírus; e os vírus respiratórios influenza A (IAV), sincicial respiratório (RSV), metapneumovírus (MPV), rinovírus (RV), e enterovírus (EV). A grande importância desses agentes para a saúde humana se reflete no vigor com que vírus zoonóticos grassam no Brasil, causando doenças e inclusive síndromes congênitas; nos 38 milhões de pessoas vivendo com HIV no mundo, e nas elevadas frequências de infecções virais respiratórias, as mais frequentes da humanidade. Além desses vírus específicos, será feito estudo de viroma em amostras de tecidos e sangue humanos, e prospecção de vírus zoonóticos com potencial para ampliar o repertório de ameaças à saúde humana. Os vírus serão objetos de investigação em vários modelos experimentais, incluindo estudos sobre entrada, montagem, tráfego intracelular e externalização de vírus em exossomos; antagonismo e modulação por vírus de fatores antivirais do hospedeiro; efeitos de vírus sobre proteostase em neurônios; efeitos de vírus em stress de retículo endoplasmático, autofagia e inflamassoma; modulação da resposta inflamatória celular na infecção por arbovírus; biologia celular da persistência de vírus em tecidos linfo-hematopoiéticos; patogênese de arbovírus; biologia celular de infecção por vírus em células de morcegos; resposta humoral a flavivirus e suas reações cruzadas; análise em single cell de genômica funcional de vírus; infecção placentária e transmissão vertical de vírus; desenvolvimento de diagnóstico de amplo espectro de viroses febris agudas e do SNC por sequenciamento massivo em MinION e microarranjos de DNA e peptídeos; prospecção e eco-epidemiologia de vírus zoonóticos; viromas de pacientes com doença febril aguda; detecção de arbovírus em fauna aviária; e desenvolvimento de drogas e vacinas antivirais. Os desafios científicos são claros, e temos convicção de que podemos atacá-los, com competência, com base em estratégias bem planejadas, com colaborações entre as equipes que incluem técnicos, pós-doutorandos, estudantes de pós-graduação e de iniciação científica. Além disso, o Centro de Pesquisa em Virologia da USP de Ribeirão Preto, criado graças à FAPESP, dispõe de estrutura bem montada, com laboratórios BSL2 e BSL3, biotério de experimentação, e sólida rede de apoio em de laboratórios de multiusuários da instituição. Este projeto tem potencial para fazer descobertas importantes em virologia, algumas de caráter fundamental, que poderão expandir conhecimento e, inclusive, servir de base para desenvolver produtos. (AU)

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; MORAES FIGUEIREDO, LUIZ TADEU; AQUINO, VICTOR HUGO. Linear and Continuous Flavivirus Epitopes From Naturally Infected Humans. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 11, AUG 12 2021. (19/26119-0, 18/09383-3, 19/27333-6)

FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; CASTRO-JORGE, LUIZA ANTUNES; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; DE AZEVEDO, PATRICK ORESTES; HANSEN, ALANA WITT; GAZZINELLI, RICARDO TOSTES; DA FONSECA, BENEDITO ANTONIO LOPES; SPILKI, FERNANDO ROSADO; FIGUEIREDO, LUIZ TADEU MORAES. oronaVac and ChAdOx1 Vaccination and Gamma Infection Elicited Neutralizing Antibodies against the SARS-CoV-2 Delta Varian. IRUSES-BASE, v. 14, n. 2, FEB 2022. (18/09383-3, 20/05527-0, 19/26119-0)

FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; CAPATO, CARLOS FABIANO; DE CASTRO-JORGE, LUIZA ANTUNES; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; ARRUDA, EURICO; FIGUEIREDO, LUIZ TADEU MORAES. Stability of SARS-CoV-2 and other airborne viruses under different stress conditions. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 167, n. 1, NOV 2021. (18/09383-3, 19/26119-0, 19/27333-6)

FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; CASTRO-JORGE, LUIZA ANTUNES; FRAGA-SILVA, THAIS FERNANDA DE CAMPOS; DE AZEVEDO, PATRICK ORESTES; CAPATO, CARLOS FABIANO; RATTIS, BRUNA AMANDA CRUZ; HOJO-SOUZA, NATALIA SATCHIKO; FLORIANO, VITOR GONCALVES; DE CASTRO, JULIA TEIXEIRA; RAMOS, SIMONE GUSMAO; et al. Protective Immunity against Gamma and Zeta Variants after Inactivated SARS-CoV-2 Virus Immunization. Viruses-Basel, v. 13, n. 12, DEC 2021. (19/26119-0, 20/05527-0, 18/09383-3, 19/09881-6, 19/11213-1)