Auxílio à pesquisa 20/15161-3 - Genômica, Genomas - BV FAPESP
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Adaptação durante transições biogeográficas do Cerrado para a Caatinga: paralelismo evolutivo e idiossincrasias em linhagens independentes do gênero Cereus (Cactaceae)

Processo: 20/15161-3
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Regular
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Botânica - Fitogeografia
Pesquisador responsável:Fernando de Faria Franco
Beneficiário:Fernando de Faria Franco
Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
Pesquisadores associados: Daniela Cristina Zappi ; Danilo Trabuco do Amaral ; Evandro Marsola de Moraes ; Nigel Paul Taylor
Auxílio(s) vinculado(s):23/02136-9 - Evolution Meeting 2023, AR.EXT
Bolsa(s) vinculada(s):24/00183-2 - Padronização e otimização de protocolos de extrações de ácidos nucleicos, BP.TT
Assunto(s):Genômica  Genomas  Adaptação  Transcriptoma  Bioma  Cerrado  Caatinga  Paralelismo  Idiossincrasia  Linhagens vegetais  Cactaceae 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:adaptação | Genomas de baixa cobertura | transcriptomas | Transição de Biomas | Genômica

Resumo

No presente projeto utilizaremos uma abordagem genômica e ecológica para testar a hipótese de seleção natural paralela associada a transição histórica do Cerrado para a Caatinga em duas linhagens independentes do gênero Cereus (Cactaceae), distintas com relação a idade de origem, ocupação de habitats e fuso filogenético. Considerando as condições climáticas e edáficas distintas entre o Cerrado e Caatinga, o principal pressuposto é que transições biogeográficas envolvendo esses biomas devem ter sido acompanhadas por alterações adaptativas e evolução do nicho, o que geralmente ocorrem nesse tipo de evento. A estratégia para coleta de dados envolve obtenção dados genéticos (transcriptomas e genomas completos de baixa cobertura) e ecológicos (fenótipos selecionados e modelagem de nicho ecológico) para espécies de dois clados de Cereus, a saber: a) clado Jamacaru (C. jamacaru subsp. jamacaru e C. jamacaru subsp. calcirupicola); b) clado D (C. albicaulis e C. mirabella); além de grupos externos para cada clado. A partir desse desenho experimental e uma série de abordagens estatísticas, será possível testar se existem assinaturas de seleção natural comuns nas transições independentes do Cerrado para a Caatinga experienciadas pelo gênero Cereus, o que poderia indicar paralelismo evolutivo no nível de sítios nucleotídicos, de genes, ou de vias metabólicas. Além disso, como os clados alvo apresentam particularidades com relação aos nichos ocupados, também será possível investigar assinaturas de adaptação idiossincráticas. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FRANCO, FERNANDO FARIA; AMARAL, DANILO TRABUCO; BONATELLI, ISABEL A. S.; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; TELHE, MILENA CARDOSO; MORAES, EVANDRO MARSOLA. Evolutionary Genetics of Cacti: Research Biases, Advances and Prospects. GENES, v. 13, n. 3, p. 22-pg., . (18/06937-8, 20/15161-3, 19/11233-2)

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