Adaptação durante transições biogeográficas do Cerrado para a Caatinga: paralelismo evolutivo e idiossincrasias em linhagens independentes do gênero Cereus (Cactaceae)

• Processo: 20/15161-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2021
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2024
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica - Fitogeografia
• Pesquisador responsável: Fernando de Faria Franco
• Beneficiário: Fernando de Faria Franco
• Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Sorocaba
• Pesquisadores associados: Daniela Cristina Zappi ; Danilo Trabuco do Amaral ; Evandro Marsola de Moraes ; Nigel Paul Taylor
• Auxílio(s) vinculado(s): 23/02136-9 - Evolution Meeting 2023, AR.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/08069-4 - Em busca da compreensão da evolução do genoma das plantas: Caracterização do repeteoma do gênero Cereus (Cereeae, Cactaceae) utilizando dados de ressequenciamento do genoma completo e ferramentas de bioinformática, BP.PD; 24/00183-2 - Padronização e otimização de protocolos de extrações de ácidos nucleicos, BP.TT
• Assunto(s): Genômica Genomas Adaptação Transcriptoma Bioma Cerrado Caatinga Paralelismo Idiossincrasia Linhagens vegetais Cactaceae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: adaptação | Genomas de baixa cobertura | transcriptomas | Transição de Biomas | Genômica

Resumo

No presente projeto utilizaremos uma abordagem genômica e ecológica para testar a hipótese de seleção natural paralela associada a transição histórica do Cerrado para a Caatinga em duas linhagens independentes do gênero Cereus (Cactaceae), distintas com relação a idade de origem, ocupação de habitats e fuso filogenético. Considerando as condições climáticas e edáficas distintas entre o Cerrado e Caatinga, o principal pressuposto é que transições biogeográficas envolvendo esses biomas devem ter sido acompanhadas por alterações adaptativas e evolução do nicho, o que geralmente ocorrem nesse tipo de evento. A estratégia para coleta de dados envolve obtenção dados genéticos (transcriptomas e genomas completos de baixa cobertura) e ecológicos (fenótipos selecionados e modelagem de nicho ecológico) para espécies de dois clados de Cereus, a saber: a) clado Jamacaru (C. jamacaru subsp. jamacaru e C. jamacaru subsp. calcirupicola); b) clado D (C. albicaulis e C. mirabella); além de grupos externos para cada clado. A partir desse desenho experimental e uma série de abordagens estatísticas, será possível testar se existem assinaturas de seleção natural comuns nas transições independentes do Cerrado para a Caatinga experienciadas pelo gênero Cereus, o que poderia indicar paralelismo evolutivo no nível de sítios nucleotídicos, de genes, ou de vias metabólicas. Além disso, como os clados alvo apresentam particularidades com relação aos nichos ocupados, também será possível investigar assinaturas de adaptação idiossincráticas. (AU)

Publicações científicas

(9)

(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)

FRANCO, FERNANDO FARIA; AMARAL, DANILO TRABUCO; BONATELLI, ISABEL A. S.; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; TELHE, MILENA CARDOSO; MORAES, EVANDRO MARSOLA. . GENES, v. 13, n. 3, p. 22-pg., 2022-03-01. (18/06937-8, 20/15161-3, 19/11233-2)

AMARAL, DANILO T.; BONATELLI, ISABEL A. S.; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; TELHE, MILENA C.; MORAES, EVANDRO M.; ZAPPI, DANIELA CRISTINA; TAYLOR, NIGEL PAUL; FRANCO, FERNANDO F.. . PLANTA, v. 260, n. 1, p. 16-pg., 2024-07-01. (18/06937-8, 19/11233-2, 22/09910-9, 20/15161-3, 18/03428-5)

ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; TAYLOR, NIGEL P.; ZAPPI, DANIELA C.; TELHE, MILENA C.; FRANCO, FERNANDO F.; MORAES, EVANDRO M.. . ANNALS OF BOTANY, v. 132, n. 5, p. 18-pg., 2023-10-10. (20/15161-3, 18/06937-8, 19/11233-2, 19/03211-9, 18/03428-5)

TAYLOR, NIGEL P.; ZAPPI, DANIELA C.; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; TELHE, MILENA C.; FRANCO, FERNANDO F.; MORAES, EVANDRO M.. . Taxon, v. 72, n. 6, p. 13-pg., 2023-11-28. (18/06937-8, 19/03211-9, 19/11233-2, 20/15161-3)

FRANCO, FERNANDO FARIA; AMARAL, DANILO TRABUCO; BONATELLI, ISABEL A. S.; MEEK, JARED B.; MORAES, EVANDRO MARSOLA; ZAPPI, DANIELA CRISTINA; TAYLOR, NIGEL PAUL; EATON, DEREN A. R.. . HEREDITY, v. 132, n. 6, p. 13-pg., 2024-04-18. (20/16162-3, 19/10341-6, 20/15161-3, 14/25227-0)

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AMARAL, DANILO T.; OLIVEIRA, JOAO VICTOR M.; MORAES, EVANDRO M.; ZAPPI, DANIELA C.; TAYLOR, NIGEL P.; FRANCO, FERNANDO F.. . JOURNAL OF ARID ENVIRONMENTS, v. 226, p. 10-pg., 2024-11-30. (18/03428-5, 22/09910-9, 20/15161-3)

ZAPPI, DANIELA C.; TAYLOR, NIGEL P.; COSTA, FABIANE NEPOMUCENO; FONSECA, SIMONE NUNES; FERREIRA, PAULA LEAO; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; TELHE, MILENA C.; KOHLER, MATIAS; FRANCO, FERNANDO F.; MORAES, EVANDRO M.. . Taxon, v. 73, n. 4, p. 9-pg., 2024-05-29. (20/15161-3, 22/04621-9, 18/06937-8, 19/11233-2, 19/03211-9)

VIRGENS, GRAZIELA SORIA; OLIVEIRA, JULIA; CARDOSO, MARIA IZADORA OLIVEIRA; TEODORO, JOAO ALFREDO; AMARAL, DANILO T.. . JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, v. 128, p. 8-pg., 2024-02-02. (20/16162-3, 23/06458-0, 20/15161-3, 22/09910-9)