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Filogenia e identificação molecular de peixes da superordem Ostariophysi (Chordata: Actinopterygii) utilizando abordagens genômicas

Processo: 20/13433-6
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de outubro de 2021 - 30 de setembro de 2026
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Claudio de Oliveira
Beneficiário:Claudio de Oliveira
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Bruno Francelino de Melo ; Fábio Fernandes Roxo ; Fausto Foresti ; GABRIEL DE SOUZA DA COSTA E SILVA ; Luz Eneida Ochoa Orrego ; Mario Cesar Cardoso de Pinna ; Ricardo Cardoso Benine
Auxílios(s) vinculado(s):23/01497-8 - Relações filogenéticas de Stevardiinae com ênfase na tribo Diapomini (Characiformes: Characidae) utilizando os elementos ultraconservados do genoma, AP.R
Bolsa(s) vinculada(s):23/09871-6 - Desvendando a diversidade e as origens do gênero Characidium (Characiformes: Crenuchidae) na região Neotropical: um estudo de Sistemática e Biogeografia com abordagem genômica e integrativa, BP.PD
23/12170-0 - Caracterização molecular de Chirocentrodon bleekerianus (Clupeiformes: Pristigasteridae), BP.IC
23/07838-1 - Entendendo o papel das reticulações nas interrelações das ordens de Ostariophysi usando redes filogeneticas., BP.PD
+ mais bolsas vinculadas 23/01862-8 - Filogenômica dos membros da família Aspredinidae (Siluriformes: Ostariophysi), BP.MS
22/06543-5 - Delimitação molecular das espécies do gênero Phenacorhamdia Dahl, 1961 (Siluriformes: Heptapteridae), BP.IC
21/12979-8 - Relações filogenéticas entre gêneros e famílias de Siluriformes usando elementos ultraconservados, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Biodiversidade  Biogeografia  Conservação  Sistemática  Evolução  Peixes  Ostariophysi  Chordata  Actinopterygii 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biodiversidade | Biogeografia | Conservação | Evolução | Peixes | Sistematica | Genética de Peixes

Resumo

Ostariophysi é uma das maiores superordens de peixes, formada quase exclusivamente por espécies de água-doce, com cerca de 95 famílias, cerca de 1.500 gêneros e 11.000 espécies, contendo assim, aproximadamente, 30% das espécies de peixes conhecidas no mundo e quase 70% das espécies de água doce. Os Ostariophysi estão presentes em todo o mundo, exceto na Antártica, de onde são conhecidos apenas fósseis. Apesar da grande riqueza de espécies e, portanto, sua grande importância científica e econômica, existem ainda muitos problemas na identificação de espécies e no entendimento das relações entre os grupos internos da superordem (e consequentemente na sua classificação), assim como dúvidas nos seus processos de diversificação e biogeografia histórica, que precisam ser abordados com metodologias modernas e resolutivas. Para abordar a questão da identificação molecular de todos os exemplares analisados estamos propondo o sequenciamento completo de seus DNAs mitocondriais, o que vai permitir a criação de um grande banco de dados, que poderá ser utilizado futuramente em muitos projetos de DNA barcode (identificação molecular), projetos com objetivos ecológicos (DNA ambiental), de regulação e controle de espécies (DNA forense) e também para elaboração de filogenias mitocondriais. Para abordar as questões sobre as relações entre os grupos (filogenias) e sobre seus processos de diversificação (macroevolução) e biogeografia histórica serão utilizados os marcadores chamados elementos ultraconservados (ultraconserved elements - UCEs). O uso dessa classe de marcadores moleculares genômicos em estudos de filogenia, macroevolução e biogeografia histórica tem crescido bastante nos últimos anos, inclusive com vários trabalhos publicados por nosso grupo de pesquisa, confirmando as vantagens de seu uso em tal tipo de estudo. Para a realização desse projeto está sendo montada uma grande rede de colaboradores do Brasil e do exterior, todos com grande experiência no estudo de peixes, o que permitirá não só a realização a contento do presente projeto, mas também a realização de inúmeros projetos futuros. (AU)

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Publicações científicas (8)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
VILLA-VERDE, LEANDRO; DE PINNA, MARIO C. C.; REIS, VINICIUS J. C.; OYAKAWA, OSVALDO T.. Secretive fish diversity: A new species of Listrura (Siluriformes, Trichomycteridae) from a supposedly well-known river in south-eastern Brazil. Journal of Fish Biology, v. 100, n. 5, p. 12-pg., . (20/13433-6)
MARCENIUK, ALEXANDRE PIRES; OLIVEIRA, CLAUDIO; FERRARIS, CARL J.. A new classification of the family Ariidae (Osteichthyes: Ostariophysi: Siluriformes) based on combined analyses of morphological and molecular data. ZOOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, v. N/A, p. 51-pg., . (16/09204-6, 14/26508-3, 20/13433-6, 18/20610-1)
ADACHI, AISNI M. C. L.; ROQUE, POLLYANA C. G.; HAZIN, FABIO H. V.; VIANNA, MARCELO; ROTUNDO, MATHEUS M.; OLIVEIRA, CLAUDIO; FORESTI, FAUSTO; CRUZ, VANESSA P.. Genetic Population Structure and Diversity of the Whitetail Dogfish Squalus albicaudus (Chondrichthyes, Squaliformes) along the Brazilian Coast as Identified by SNP Markers. FISHES, v. 8, n. 7, p. 11-pg., . (19/15148-0, 20/13433-6)
MATTOX, GEORGE M. T.; CETRA, MAURICIO; SOUZA, CAMILA S.; OYAKAWA, OSVALDO T.; BENTO, RODRIGO M. M.; OLIVEIRA, CLAUDIO. Spintherobolus papilliferus in the rio Ribeira de Iguape basin: implications for the biogeography and conservation of an endangered species (Ostariophysi: Characiformes). Neotropical Ichthyology, v. 21, n. 2, p. 19-pg., . (17/01970-4, 20/13433-6, 17/25860-3)
TURSELLINO, MAURO NIRCHIO; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; SASSI, FRANCISCO DE MENEZES CAVALCANTE; DEON, GEIZE APARECIDA; OLIVEIRA, CLAUDIO; KURANAKA, MARIANA; VALDIVIEZO-RIVERA, JONATHAN; GONZALEZ, VICTOR HUGO; ROSSI, ANNA RITA. Integrating Genomic and Chromosomal Data: A Cytogenetic Study of Transancistrus santarosensis (Loricariidae: Hypostominae) with Characterization of a ZZ/ZW Sex Chromosome System. GENES, v. 14, n. 9, p. 15-pg., . (20/13433-6)
SILVA, GUILHERME JOS DA COSTA; DA COSTA E SILVA, GABRIEL DE SOUZA; OLIVEIRA, CLAUDIO. A new species of spiny Rineloricaria (Siluriformes: Loricariidae) from the Rio Paraiba do Sul basin and costal rivers from Rio de Janeiro State. Zootaxa, v. 5175, n. 2, p. 8-pg., . (16/09204-6, 09/50613-3, 21/12979-8, 18/20610-1, 20/13433-6, 14/26508-3)
MATTOX, GEORGE M. T.; BRITZ, RALF; SOUZA, CAMILA S.; CASAS, ANDRE L. S.; LIMA, FLAVIO C. T.; OLIVEIRA, CLAUDIO. Two new species of miniature tetras of the fish genus Priocharax from the Rio Juru? drainage, Acre, Brazil (Teleostei: Characiformes: Characidae). CANADIAN JOURNAL OF ZOOLOGY, v. N/A, p. 19-pg., . (17/01970-4, 13/20936-0, 11/51532-7, 20/13433-6)

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