Filogeografia comparada automatizada e preditiva de espécies neotropicais

• Processo: 20/16162-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2024
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Isabel Aparecida da Silva Bonatelli
• Beneficiário: Isabel Aparecida da Silva Bonatelli
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas (ICAQF). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus Diadema. Diadema , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Bryan Charles Carstens ; Danilo Trabuco do Amaral ; Evandro Marsola de Moraes ; Fernando de Faria Franco ; Marcelo Coelho Miguel Gehara
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/08676-2 - Levantamento automatizado e gestão de dados ecológicos e genéticos disponíveis em bancos de dados públicos, BP.TT
• Assunto(s): Aprendizado computacional Inferência bayesiana aproximada Análise preditiva Filogeografia Mudança climática Biodiversidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Abc | Alterações Climáticas | Aprendizado de Máquina | Filogeografia preditiva | Neotropical | Filogeografia

Resumo

O entendimento de muitos processos evolutivos começa na investigação da ocorrência geográfica atual das espécies. Uma das principais descobertas é que as mudanças climáticas dos últimos 21.000 anos levaram a alterações substanciais na distribuição da biodiversidade em escala global. No entanto, a maior parte dos estudos são baseados em narrativas descritivas e interpretação de resultados para táxons únicos, o que se mostra insuficiente. O aumento excepcional de dados genéticos e georreferenciados em repositórios públicos oferece uma oportunidade de refinamento das inferências propostas para poucas espécies, tornando-as acessíveis a maiores escalas taxonômicas e geográficas. Uma outra abordagem que se estabelece no campo da filogeografia é a exploração de características fenotípicas capazes de explicar padrões filogeográficos discordantes frente aos eventos climáticos. O presente projeto tem como objetivo entender as respostas demográficas de diferentes espécies neotropicais diante das alterações climáticas do Último Máximo Glacial a partir de dados disponíveis em repositórios digitais e uma abordagem de filogeografia comparada e preditiva. Dados genéticos georreferenciados serão coletados e analisados para diferentes alterações demográficas a partir de modelagem de distribuição das espécies e computação Bayesiana aproximada (ABC). A associação de características abióticas e bióticas com a resposta demográfica será investigada utilizando aprendizado de máquina. Os resultados do presente trabalho deverão oferecer uma perspectiva mais ampla para o entendimento das diferentes respostas demográficas observadas em espécies da região Neotropical e incentivar o reaproveitamento de dados disponíveis a partir de uma abordagem automatizada. Adicionalmente, deve fornecer subsídios para estratégias de conservação e permitir a elaboração de novas hipóteses a serem testadas a partir de dados genômicos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BONATELLI, ISABEL A. S.; FRANCO, FERNANDO F.; AMARAL, DANILO TRABUCO. Editorial: Barren lives: biodiversity and diversification in arid regions. FRONTIERS IN ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 11, p. 3-pg., 2023-08-17. (20/16162-3)