Estudos amplos do genoma de Nyssorhynchus darlingi relacionados à dispersão microgeográfica e comportamento de busca de sangue.

• Processo: 22/03328-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Entomologia e Malacologia de Parasitos e Vetores
• Pesquisador responsável: Paulo Eduardo Martins Ribolla
• Beneficiário: Paulo Eduardo Martins Ribolla
• Instituição Sede: Instituto de Biotecnologia (IBTEC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Comportamento Genética populacional Imputação de dados Malária Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: comportamento | Genética populacional | Imputação de dados | malária | Nyssorhynchus darlingi | Sequenciamento genomico | Genética de populações e genômica

Resumo

Antecedentes: No Brasil, a malária está concentrada na Bacia Amazônica, onde são notificados mais de 99% dos casos anuais. O principal objetivo deste estudo foi investigar a estrutura populacional e estudos de associação genética do comportamento de morder de Nyssorhynchus (também conhecido como Anopheles) darlingi, o principal vetor da malária na região amazônica do Brasil, usando dados de sequenciamento genômico de baixa cobertura. Métodos: As amostras foram coletadas no município de Mâncio Lima, estado do Acre, Brasil entre 2016 e 2017. Diferentes abordagens usando imputação e não imputação de genótipos para tratamento de dados e genotipagem de sequenciamento de baixa cobertura foram realizadas. Após a genotipagem das amostras, foi realizada a análise de estratificação populacional. Resultados: Foram identificadas assinaturas de estratificação fracas, mas estatisticamente significativas, entre subpopulações separadas por distâncias de aproximadamente 2 a 3 km. Estudos de associação ampla do genoma (GWAS) foram realizados para comparar o comportamento de morder em ambientes internos/externos e a busca de sangue ao entardecer/amanhecer. Observou-se associação estatisticamente significativa entre comportamento de mordida e marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) adjacentes ao citocromo P450 CYP4H14, associados à resistência a inseticidas. Uma associação estatisticamente significativa entre a periodicidade de busca de sangue e marcadores SNP adjacentes aos genes associados ao ciclo circadiano também foi observada. Conclusão: Os dados aqui apresentados sugerem que o sequenciamento completo do genoma de baixa cobertura com processamento adequado representa uma ferramenta poderosa para caracterizar geneticamente populações de vetores em escala microgeográfica em áreas de transmissão de malária, bem como para estudos de associação genômica ampla. As fêmeas que entram nas casas para fazer uma refeição de sangue podem estar relacionadas a um alelo cyp4H14 específico e o tempo feminino de busca de sangue está relacionado aos genes do ritmo circadiano. (AU)