Montagem de genoma, genômica populacional e mapeamento associativo em Attalea Kunth., um importante gênero de palmeiras nativas da região neotropical

• Processo: 21/10319-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de junho de 2022 - 31 de maio de 2024
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica
• Pesquisador responsável: Maria Imaculada Zucchi
• Beneficiário: Maria Imaculada Zucchi
• Instituição Sede: Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Alessandra Selbach Schnadelbach ; Cássio van den Berg ; Claudia Barros Monteiro Vitorello
• Assunto(s): Genética vegetal Genômica populacional Populações naturais Polimorfismo de um único nucleotídeo Hibridização genética Palmeiras Attalea Biodiversidade Técnicas de genotipagem
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: genômica populacional | mapeamento associativo | palmeiras nativas | Piaçava | populações naturais | SNPs | Diversidade genetica, genética de populações de plantas

Resumo

O avanço das novas tecnologias de sequenciamento tem impulsionado projetos cujo objetivo é obter a sequência do genoma de organismos não-modelos. Apesar de sua importância ecológica e econômica, vários grupos de plantas são subrepresentados nesses esforços, em especial o grupo das palmeiras. Dentro da família Arecaceae, o gênero Attalea se destaca por sua plasticidade ecológica, pela importância econômica de suas espécies e por altas taxas de hibridização. As espécies de Attalea da Mata Atlântica formam um clado com sete espécies, dentre as quais quatro ocupam a faixa central da Mata Atlântica: Attalea funifera, Attalea oleifera, Attalea humilis e Attalea pindobassu. As três primeiras estão envolvidas em três possíveis eventos de hibridização (Attalea x piassabossu, Attalea x salvadorensis e Attalea x voeksii). A região na qual essas espécies, e seus possíveis híbridos, se distribuem foi fortemente influenciada por mudanças climáticas e mudanças no nível domar nos períodos Terciário e Quaternário, os quais podem ter influenciado processos de especiação e demográficos desse grupo. Dentre as espécies de Attalea da Mata Atlântica, A. funifera, popularmente conhecida como piaçava, se destaca pela exploração econômica de suas fibras, cujo mercado vem sofrendo uma grande queda, devido à falta de insumos tecnológicos. Além disso, essa espécie apresenta um sistema de determinação sexual peculiar, sendo capaz de produzir inflorescências masculinas, femininas e hermafroditas. Os indivíduos dessa espécie também são capazes de mudar o tipo de inflorescência de acordo com fatores ambientais. Dentro desse contexto, esse projeto pretende: sequenciar e montar o genoma de A. funifera; coletar, caracterizar morfologicamente e genotipar com SNPs acessos de quatro espécies de Attalea do corredor central da Mata Atlântica e de possíveis zonas híbridas entre essas espécies; e realizar estudos de associação de genótipo-fenótipo em populações de piaçava cultivadas para traços de qualidade de fibra e de óleo do fruto. Assim, este projeto utilizará esse grupo como um modelo para entender eventos de hibridização em palmeiras, testar hipóteses biogeográficas sobre processos subjacentes à origem da biodiversidade da região neotropical, explorar o potencial de populações naturais para investigar a arquitetura genética de traços de importância econômica e entender a evolução do sistema sexual de palmeiras (AU)