Contínuo aprimoramento de vacinas: Centro para Vigilância Viral e Avaliação Sorológica (CeVIVAS)

• Processo: 21/11944-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Ciência para o Desenvolvimento
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2027
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
• Pesquisador responsável: Sandra Coccuzzo Sampaio Vessoni
• Beneficiário: Sandra Coccuzzo Sampaio Vessoni
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Daniel Carvalho Pimenta ; Eliana Faquim de Lima Mauro ; Geraldo Santana Magalhães ; Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga ; Simone Kashima Haddad
• Pesquisadores associados: Alex Ranieri Jerônimo Lima ; Claudia Renata dos Santos Barros ; Daniel José Galafasse Lahr ; David Schlesinger ; Dimas Tadeu Covas ; Elaine Cristina Marqueze ; Evaldo Stanislau Affonso de Araujo ; Evandra Strazza Rodrigues Sandoval ; Heidge Fukumasu ; Hugo Aguirre Armelin ; Igor Cabral Corrêa ; Jayme Augusto de Souza-Neto ; Joao Paulo Fumio Whitaker Kitajima ; Jose Salvatore Leister Patane ; Jounghyeok Kwon ; Julia Pinheiro Chagas da Cunha ; Keith Crandall ; Luiz Carlos Junior Alcantara ; Luiz Lehmann Coutinho ; Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga ; Marta Giovanetti ; Maurício Lacerda Nogueira ; Nancy Starobinas ; Rejane Maria Tommasini Grotto ; Svetoslav Nanev Slavov ; Vincent Louis Viala
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/23798-2 - Implementação de plataforma de análise de imunidade celular induzida por imunizantes produzidos pelo Instituto Butantan: imunidade celular protetora em resposta às infecções virais, BP.PD; 23/11919-7 - Identificação e caracterização de potenciais novas linhagens circulantes do vírus da dengue entre 2021 e 2026: contribuições para o monitoramento evolutivo, BP.DR; 24/03645-7 - Identificação e sequenciamento de peptídeos derivados da região hipervariável de anticorpos induzidos por vacinação, BP.PD; + mais bolsas vinculadas 24/05506-4 - Contínuo aprimoramento de vacinas: Centro paraVigilância Viral e Avaliação Sorológica (CeVIVAS), BP.TT; 23/15913-3 - Bioinformática na análise filogenética, filogeográfica e epidemiológica na evolução dos vírus Influenza no Brasil, BP.TT; 23/13992-3 - Implementação de plataforma de analise de imunidade celular induzida por imunizantes produzidos pelo Instituto Butantan: Imunidade celular protetora em resposta às infecções virais, BP.PD; 23/14852-0 - Impacto dos diferentes genótipos da dengue na fisiopatologia e gravidade da doença: uma abordagem multi-ômica, BP.DR; 23/07688-0 - Filogenética, filogeografia e epidemiologia comparativas aplicadas no entendimento da evolução dos vírus da COVID-19, Influenza, e Dengue no Brasil, BP.PD; 23/08965-7 - Vigilância genômica dos vírus Influenza A e B circulantes na cidade de São Paulo entre 2023 a 2025, BP.DR; 23/11920-5 - Desenvolvimento de um pipeline para contínua melhoria de anticorpos monoclonais para uso terapêutico nas doenças causadas por influenza e SARS-CoV-2, BP.PD; 23/11334-9 - Produção de partículas pseudovirais para avaliação de anticorpos neutralizantes, BP.PD; 23/09546-8 - Desenvolvimento de Biossensor para Diagnóstico Rápido dos Sorotipos de Dengue, BP.TT; 22/16349-1 - Monitoramento genômico de dengue vírus e identificação de quasispecies virais em região endêmica, BP.DR - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Imunização Vacinação Vacinas Resposta imune Vigilância genômica COVID-19 Dengue Influenza
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Covid-19 | Dengue | Genomic surveillance | Influenza | resposta imune celular | Variantes de preocupação (VOC) | Imunização

Resumo

Vacinação é o pilar das políticas de saúde pública. A história da vacinação mostra que as vacinas têm sido desenvolvidas de forma empírica e, por isso, muitos estudos são necessários para o contínuo desenvolvimento desse produto biológico. A efetividade das vacinas é avaliada pela redução da infecção ou da doença entre os indivíduos vacinados e é influenciada por vários fatores como as características do indivíduo, fatores demográficos, fatores imunes e os patógenos circulantes. A pandemia de COVID-19 evidenciou o potencial de rápida resposta do Instituto Butantan, via o seu Centro de Desenvolvimento Científico, aos desafios, por meio da adequação técnica necessária e capacitação gestora para a integração entre as áreas científicas e áreas administrativas, tais como as Secretarias de Saúde Municipais e Estadual. Pautados na experiência bem-sucedida, apresentamos o presente projeto que visa monitorar alguns desses fatores com o objetivo de se obter um contínuo aprimoramento das vacinas virais para Influenza, COVID-19 e Dengue. Para tanto, iniciaremos nosso trabalho realizando uma constante vigilância genômica dos vírus Influenza, SARS-CoV-2 e DENV circulantes no Estado de SP, no país e em países vizinhos. Os dados obtidos permitirão (i) estudos sobre a história evolutiva desses vírus e (ii) conhecermos as variantes virais circulantes nas regiões estudadas. Para conhecer a capacidade protetora das vacinas empregadas, nós investigaremos se (i) soros de indivíduos vacinados neutralizam a infecção das variantes circulantes e (ii) como é a resposta celular de indivíduos vacinados frente a linhagem viral usada na imunização e frente às variantes circulantes na população. Esse trabalho permitirá a criação de um biobanco de variantes virais, de uma soroteca de indivíduos vacinados e de um banco de células mononucleares isoladas de sangue periférico de indivíduos vacinados que poderão ser utilizadas também em projetos futuros. Em paralelo, analisaremos a efetividade das vacinas de acordo com os dados sociodemográficos, de saúde e ambientais, comparando a efetividade das vacinas de acordo com as variantes virais. Os resultados obtidos serão continuamente enviados aos órgãos de assistência nas três esferas administrativas: municipal, estadual e federal, com o intuito de contribuir de maneira significativa com o direcionamento de ações em políticas públicas. Estaremos assim, fornecendo continuamente dados ao sistema de saúde para que este enfrente, com subsídios mais rigorosos, os desafios impostos pelos vírus que serão aqui estudados. (AU)

Publicações científicas

(19)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BANHO, CECILIA ARTICO; MARQUES, BEATRIZ DE CARVALHO; SACCHETTO, LIVIA; LIMA, ANA KAROLINE SEPEDRO; PARRA, MAISA CARLA PEREIRA; LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; RIBEIRO, GABRIELA; MARTINS, ANTONIO JORGE; BARROS, CLAUDIA RENATA DOS SANTOS; ELIAS, MARIA CAROLINA; et al. Dynamic clade transitions and the influence of vaccination on the spatiotemporal circulation of SARS-CoV-2 variants. NPJ VACCINES, v. 9, n. 1, p. 12-pg., 2024-08-10. (22/03645-1, 20/10127-1, 21/11944-6, 23/14670-0, 20/04836-0)

CRUVINEL, VANESSA RESENDE NOGUEIRA; DE CARVALHO, ENEAS; ALVES, DAIANI CRISTINA CILIAO; MARQUES, CARLA PINTAS; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; GIOVANETTI, MARTA; SAMPAIO, SANDRA COCCUZZO; ELIAS, MARIA CAROLINA; DE ARAUJO, WILDO NAVEGANTES; HADDAD, RODRIGO; et al. Unveiling microbial worlds: exploring viral metagenomics among waste pickers at Latin America's largest dumpsite. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 66, p. 7-pg., 2024-01-01. (18/15826-5, 21/11944-6, 17/23205-8)

POLICASTRO, LUCCA ROCHA; LIMA DE LA-ROQUE, DEBORA GLENDA; CALADO, RODRIGO TOCANTINS; COVAS, DIMAS TADEU; ALCANTARA, LUIZ CARLOS; GIOVANETTI, MARTA; KASHIMA, SIMONE. Oropouche virus in Brazil: Assessing the risks and challenges for transfusion medicine. Vox Sanguinis, v. N/A, p. 4-pg., 2024-12-24. (13/08135-2, 21/11944-6, 22/16349-1)

GIOVANETTI, MARTA; VAZQUEZ, CYNTHIA; LIMA, MAURICIO; CASTRO, EMERSON; ROJAS, ANALIA; FUENTE, ANDREA GOMEZ DE LA; AQUINO, CAROLINA; CANTERO, CESAR; FLEITAS, FATIMA; TORALES, JUAN; et al. Rapid Epidemic Expansion of Chikungunya Virus East/Central/ South African Lineage, Paraguay. Emerging Infectious Diseases, v. 29, n. 9, p. 5-pg., 2023-09-01. (21/11944-6)

SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; LIMA DE LA-ROQUE, DEBORA GLENDA; MENDES DA COSTA, PERICLES NATAN; RODRIGUES, EVANDRA STRAZZA; SANTOS, ELAINE VIEIRA; BORGES, JOSIANE SERRANO; EVARISTO, MARIANE; MACONETTO, JULIANA DE MATOS; MARQUES, ADRIANA APARECIDA; MILHOMENS, JONATHAN; et al. Dynamics of SARS-CoV-2 Variants of Concern in Vaccination Model City in the State of Sao Paulo, Brazil. Viruses-Basel, v. 14, n. 10, p. 12-pg., 2022-10-01. (14/50947-7, 18/15826-5, 20/10127-1, 20/06441-2, 19/22155-2, 17/26950-6, 21/11944-6, 13/08135-2)

DE CAMPOS, GABRIEL MONTENEGRO; COSTA, THALITA CRISTINA DE MELLO; SILVEIRA, ROBERTA MARANINCHI; VALENCA, IAN NUNES; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DARRIGO JUNIOR, LUIZ GUILHERME; VIEIRA, ANA CAROLINA DE JESUS; MESQUITA, CAMILA CAMPOS; LAURINDO, PATRICIA DA SILVA; CUNHA, RENATO GUERINO; et al. Viral Metagenomics in Patients Who Underwent Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation (HSCT): A Brazilian Experience. MICROORGANISMS, v. 12, n. 12, p. 13-pg., 2024-12-01. (19/08528-0, 19/07861-8, 23/12155-0, 21/11944-6, 17/23205-8)

BRCKO, ISABELA CARVALHO; DE SOUZA, VINICIUS CARIUS; RIBEIRO, GABRIELA; LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; MARTINS, ANTONIO JORGE; BARROS, CLAUDIA RENATA DOS SANTOS; DE CARVALHO, ENEAS; PEREIRA, JAMES SIQUEIRA; DE LIMA, LOYZE PAOLA OLIVEIRA; VIALA, VINCENT LOUIS; et al. Comprehensive molecular epidemiology of influenza viruses in Brazil: insights from a nationwide analysis. VIRUS EVOLUTION, v. 11, n. 1, p. 17-pg., 2025-01-08. (21/11944-6, 23/07688-0, 23/11920-5)

DE LA ROQUE, DEBORA GLENDA LIMA; SANTOS, ELAINE VIEIRA; POLICASTRO, LUCCA ROCHA; EVARISTO, MARIANE; DA COSTA, PERICLES NATAN MENDES; EVARISTO, MARRIANE; YAMAMOTO, APARECIDA YULIE; GIOMO, DENISE BERGAMASCHI; TORRES, PAULA MARILIA AFONSO; GENTIL, DANIELLE CRISTINA DACANAL; et al. Exploring the Chikungunya virus landscape in a dengue-endemic Brazilian area. JOURNAL OF INFECTION AND PUBLIC HEALTH, v. 17, n. 7, p. 4-pg., 2024-05-30. (22/16349-1, 13/08135-2, 21/11944-6)

DA SILVA, ANIELLY SARANA; DE CAMPOS, GABRIEL MONTENEGRO; ALTIZANI, GABRIELA MARENGONE; BARROS, ALICE CHAGAS; JUNQUEIRA, DENNIS MALETICH; KASHIMA, SIMONE; SAMPAIO, SANDRA COCCUZZO; ELIAS, MARIA CAROLINA; GIOVANETTI, MARTA; SCRIDELI, CARLOS ALBERTO; et al. Human pegivirus-1 (HPgV-1) RNA frequency and genotype distribution in pediatric oncology patients with febrile neutropenia. VIRUS RESEARCH, v. 350, p. 5-pg., 2024-10-11. (22/14958-0, 17/23205-8, 22/00910-6, 21/11944-6)

VAZQUEZ, CYNTHIA; ALCANTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR; FONSECA, VAGNER; LIMA, MAURICIO; XAVIER, JOILSON; ADELINO, TALITA; FRITSCH, HEGGER; CASTRO, EMERSON; DE OLIVEIRA, CARLA; SCHUAB, GABRIEL; et al. Retrospective Spatio-Temporal Dynamics of Dengue Virus 1, 2 and 4 in Paraguay. Viruses-Basel, v. 15, n. 6, p. 14-pg., 2023-06-01. (21/11944-6)

CAVALCANTE SOUZA, JULIANA VANESSA; SANTOS, HAZERRAL DE OLIVEIRA; LEITE, ANDERSON BRANDAO; GIOVANETTI, MARTA; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE CARVALHO, ENEAS; TODAO BERNARDINO, JARDELINA DE SOUZA; VIALA, VINCENT LOUIS; HADDAD, RODRIGO; CICCOZZI, MASSIMO; et al. Viral Metagenomics for the Identification of Emerging Infections in Clinical Samples with Inconclusive Dengue, Zika, and Chikungunya Viral Amplification. Viruses-Basel, v. 14, n. 9, p. 8-pg., 2022-09-01. (17/23205-8, 18/15826-5, 21/09446-8, 21/11944-6, 20/13194-1, 19/08528-0)

LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; SANTOS, HAZERRAL DE OLIVEIRA; PEREIRA, JAMES SIQUEIRA; LEITE, ANDERSON BRANDAO; DO NASCIMENTO, JEAN PHELLIPE MARQUES; SOUZA, JULIANA VANESSA CAVALCANTE; LIMA, MARLON BRENO ZAMPIERI; DE ARAUJO, MYKAELLA ANDRADE; GIOVANETTI, MARTA; KALLAS, ESPER GEORGES; et al. Enterovirus D68 Subgenotype B3 Circulation in Children with Acute Respiratory Illness in the State of Alagoas, Brazil. Viruses-Basel, v. 17, n. 2, p. 8-pg., 2025-02-01. (21/11944-6, 17/23205-8, 23/11919-7)

DE CAMPOS, GABRIEL MONTENEGRO; LIMA DE LA-ROQUE, DEBORA GLENDA; JERONIMO LIMA, ALEX RANIERI; ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; DE CARVALHO, ENEAS; OLIVEIRA DE LIMA, LOYZE PAOLA; CATTONY NETO, PEDRO DE QUEIROZ; DOS SANTOS, MURILO MARCONI; CICCOZZI, MASSIMO; GIOVANETTI, MARTA; et al. Exploring Viral Metagenomics in Pediatric Patients with Acute Respiratory Infections: Unveiling Pathogens beyond SARS-CoV-2. MICROORGANISMS, v. 11, n. 11, p. 10-pg., 2023-11-01. (22/00910-6, 17/23205-8, 21/11944-6, 18/15826-5, 21/09446-8)

HILL, VERITY; CLEEMPUT, SARA; PEREIRA, JAMES SIQUEIRA; GIFFORD, ROBERT J.; FONSECA, VAGNER; TEGALLY, HOURIIYAH; BRITO, ANDERSON F.; RIBEIRO, GABRIELA; DE SOUZA, VINICIUS CARIUS; BRCKO, ISABELA CARVALHO; et al. A new lineage nomenclature to aid genomic surveillance of dengue virus. PLOS BIOLOGY, v. 22, n. 9, p. 27-pg., 2024-09-01. (18/14389-0, 21/11944-6)

DE LA-ROQUE, DEBORA GLENDA LIMA; SANTOS, ELAINE VIEIRA; OLIVEIRA, RENATA APARECIDA MACHADO; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; RODRIGUES, EVANDRA S.; FONSECA, VAGNER; MARTINS, ANTONIO JORGE; GIOMO, DENISE BERGAMASCHI; TORRES, PAULA MARILIA AFONSO; GENTIL, DANIELLE CRISTINA DACANAL; et al. DENV-1 genotype V circulation during the nonepidemic period in the Northeast of Sao Paulo State endemic area. Journal of Medical Virology, v. 96, n. 3, p. 4-pg., 2024-03-01. (13/08135-2, 21/11944-6, 22/16349-1)

DE ARAUJO, JULIANA CALABRIA; CARVALHO, ANA PAULA ASSAD; LEAL, CINTIA D.; NATIVIDADE, MANUELLE; BORIN, MARCUS; GUERRA, AUGUSTO; CAROBIN, NATALIA; SABINO, ADRIANO; ALMADA, MARIANA; COSTA, MARIA CRISTINA M.; et al. Detection of Multiple Human Viruses, including Mpox, Using a Wastewater Surveillance Approach in Brazil. PATHOGENS, v. 13, n. 7, p. 10-pg., 2024-07-01. (21/11944-6)

DE CAMPOS, GABRIEL MONTENEGRO; SANTOS, HAZERRAL DE OLIVEIRA; LIMA, ALEX RANIERI JERONIMO; LEITE, ANDERSON BRANDAO; RIBEIRO, GABRIELA; BERNARDINO, JARDELINA DE SOUZA TODAO; DO NASCIMENTO, JEAN PHELLIPE MARQUES; SOUZA, JULIANA VANESSA CAVALCANTE; DE LIMA, LOYZE PAOLA OLIVEIRA; LIMA, MARLON BRENO ZAMPIERI; et al. Unveiling viral pathogens in acute respiratory disease: Insights from viral metagenomics in patients from the State of Alagoas, Brazil. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 18, n. 9, p. 11-pg., 2024-09-01. (21/11944-6, 17/23205-8, 22/00910-6, 23/12155-0, 22/14958-0)

LIMA, MARLON BRENO ZAMPIERI; DANIEL, THUANY GIOVANA PEREIRA; BITENCOURT, HELLEN TAYANA OLIVEIRA; ALCANTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR; HADDAD, RODRIGO; KASHIMA, SIMONE; ELIAS, MARIA CAROLINA; GIOVANETTI, MARTA; SAMPAIO, SANDRA COCCUZZO; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Molecular frequency of human gemycircularvirus (GCYV) dna among blood donors from the Brazilian Amazon. TRANSFUSION CLINIQUE ET BIOLOGIQUE, v. 31, n. 2, p. 4-pg., 2024-04-17. (22/00910-6, 17/23205-8, 21/11944-6, 18/15826-5, 22/14958-0)

RODRIGUES, EVANDRA STRAZZA; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV; DE LA ROQUE, DEBORA GLENDA LIMA; SANTOS, ELAINE VIEIRA; BORGES, JOSIANE SERRANO; EVARISTO, MARIANE; DA COSTA, PERICLES NATAN MENDES; DE MATOS MACONETTO, JULIANA; MARQUES, ADRIANA APARECIDA; BACCARIN, ANEMARIE DINARTE; et al. Epidemiology of the SARS-CoV-2 Omicron Variant Emergence in the Southeast Brazilian Population. MICROORGANISMS, v. 12, n. 3, p. 13-pg., 2024-03-01. (20/10127-1, 21/11944-6, 20/06441-2)