Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3)

• Processo: 21/10577-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah
• Beneficiário: Shaker Chuck Farah
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Aline Maria da Silva ; Beny Spira ; Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho ; Cristina Elisa Alvarez Martinez ; Henrique Ferreira ; João Carlos Setubal ; Marcelo Brocchi ; Marcio Vinicius Bertacine Dias ; Marilis Do Valle Marques ; Regina Lúcia Baldini ; Roberto Kopke Salinas ; Rodrigo da Silva Galhardo ; Sandro Roberto Marana
• Pesquisadores associados: Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho ; Cristina Elisa Alvarez Martinez ; Frederico José Gueiros Filho ; Germán Gustavo Sgro ; João Carlos Setubal ; José Freire da Silva Neto ; Leonardo Talachia Rosa ; Marcio Vinicius Bertacine Dias ; Marco Aurélio Takita ; Rita de Cássia Café Ferreira ; Robson Francisco de Souza ; Rodrigo da Silva Galhardo
• Auxílio(s) vinculado(s): 24/09645-9 - Integração de métodos experimentais e in silico no estudo de mecanismos de resistência em Mycobacterium tuberculosis, AP.R SPRINT; 24/02235-0 - Estudo das enzimas do tipo NlpC_P60 para o desenvolvimento de novos agentes antimicobacterianos, AP.R; 23/15471-0 - EMU concedido no processo 2021/10577-0: leitor de microplacas multimodo Clariostar-BMG Labtech, AP.EMU; 23/12177-4 - EMU concedido no processo 2021/10577-0: espectrômetro de dicroísmo circular JASCO, modelo J-1500, AP.EMU; 23/12239-0 - EMU concedido no processo 2021/10577-0: PEAQ-ITC (microcalorímetro), AP.EMU
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/04962-6 - Inibição da diidrofolato redutase de Mycobacterium tuberculosis e de fungos patogênicos por antimicrobianos identificados por estratégia baseada em fragmentos, BP.DR; 24/10763-6 - Estudo estrutural por criomicroscopia eletrônica do estator flagelar MotA/MotB de Leptospira interrogans, BP.DD; 24/15711-4 - Identificação de compostos que interagem com a enzima ClpC1 do complexo proteico ClpP1P2C1 de Mycobacterium tuberculosis por triagem de fragmentos, BP.IC; + mais bolsas vinculadas 24/19817-1 - Estudo do mecanismo de ação e resistência à pirazinamida em Mycobacterium tuberculosis, BP.IC; 24/12387-1 - Desenvolvimento de um sistema para a identificação e caracterização de peptídeos associados à adsorção de bacteriófagos de Xanthomonas citri, BP.DR; 24/01729-9 - Desenvolvimento e aplicação de uma ferramenta computacional para investigação da diversidade de espécies bacterianas com base em dados metagenômicos, BP.DD; 24/14262-1 - Divulgação científica do CEPID B3, BP.JC; 24/13851-3 - Avaliação de despolimerases fágicas contra Xanthomonas citri subsp. citri., BP.IC; 24/10539-9 - Caracterização do complexo nucleoproteico interconectando o divisomo e a região terminal de replicação do cromossômica de Xanthomonas citri, BP.DR; 24/16116-2 - Varredura de moléculas que inibem fatores de transcrição bacterianos, BP.IC; 24/09014-9 - Estudo da regulação da expressão da aconitase e efeitos de sua ligação ao degradossomo de rna em caulobacter crescentus, BP.MS; 24/12945-4 - Expansão do espectro de hospedeiros de bacteriófagos líticos por meio de recombinação e seleção, BP.DR; 23/03213-7 - Salmonella enterica e Vesículas de Membrana (MVs) no Desenvolvimento de Vacinas, BP.DR; 24/03230-1 - Caracterização da via de reparo de DNA por FAN1 em Pseudomonas aeruginosa, BP.DD; 23/08535-2 - CONSTRUÇÃO DE "ARTILISINAS" PARA O CONTROLE DE Xanthomonas citri subsp. citri, BP.PD; 23/16089-2 - Estudo por criomicroscopia eletrônica da adsorção ao seu receptor de um bacteriófago específico ao pilus tipo IV, BP.PD; 24/06039-0 - Explorando as aplicações biotecnológicas de sistemas de secreção do tipo IV bactericidas., BP.PD; 24/05782-1 - Implementação de ferramentas e pipelines de bioinformática para análise de genomas de fagos e de bactérias e de suas interações., BP.TT; 23/17618-9 - R-bodies de Xanthomonas citri: expressão e caracterização estrutural, BP.IC; 24/01290-7 - Caracterização da resposta a estresses por fatores sigma alternativos em Xanthomonas citri, BP.PD; 24/03640-5 - Interseção entre respostas a estresses em bactérias, BP.PD; 24/03217-5 - Estudos estruturais das subunidades do complexo da membrana interna do Sistema de Secreção do Tipo IV de Xanthomonas citri por espectroscopia de RMN e criomicroscopia eletrônica, BP.PD; 24/01159-8 - Desvendando a interação entre bactérias e fagos por meio do monitoramento das alterações transcritômicas durante a infecção por fagos., BP.MS; 24/03134-2 - Um novo domínio e a uma nova via de sinalização de DgcP em Pseudomonas aeruginosa, BP.DD; 23/13894-1 - Estudo por criomicroscopia eletrônica da adsorção de um fago ao pilus tipo IV, BP.DD; 24/02648-2 - Desenvolvimento e implementação do projeto educacional MicroMath., BP.IC; 23/13202-2 - Caracterização de bacteriófago de Xanthomonas citri, BP.IC; 23/13291-5 - Determinação dos níveis intrínsecos de ppGpp em uma espécie e sua influência na taxa de crescimento e na tolerância a antibióticos, BP.DD; 23/05679-3 - Caracterização do gene xac4136 como possível efetor anti-eucariótico do Sistema de Secreção do tipo VI em Xanthomonas citri, BP.MS; 23/14021-1 - Endolisinas fágicas (ELs) como agentes antimicrobianos de bactérias Gram-negativas, BP.PD; 23/12063-9 - Disseminação de conceitos em microbiologia: Avaliação do impacto na educação básica., BP.IC; 23/09812-0 - Estudo da ação dos sistemas de secreção de Pseudomonas aeruginosa e seus efetores em co-culturas com Aspergillus fumigatus, BP.IC; 23/10731-4 - Implementação de infraestrutura computacional para espectroscopia de RMN, BP.TT; 23/11219-5 - Desenvolvimento e implementação do projeto educacional MicroMat, BP.IC; 23/06833-6 - Avaliação do papel da aconitase na regulação de genes de síntese de ferro-enxofre em Caulobacter crescentus, BP.IC; 23/06554-0 - Identificação de compostos que interagem com a DNA Girase de Mycobacterium tuberculosis através da triagem de fragmentos, BP.IC; 23/06729-4 - Treinamento de bacteriófagos líticos de Pseudomonas aeruginosa para superar a resistência bacteriana, BP.IC; 23/06724-2 - Isolamento de bacteriófagos líticos de Pseudomonas aeruginosa de diversos ambientes naturais, BP.IC; 17/23627-0 - Determinação das bases estruturais da formação biosintética de anéis heterocíclicos em poliéteres ionóforos, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Microbiologia Microbiologia molecular Biologia estrutural Biologia sintética Transdução de sinais Bacteriófagos Anti-infecciosos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bacterial signal transduction | Bacteriophages | Molecular Microbiology | Screening for antimicrobial compounds | Structural Biology | Synthetic Biology | Microbiologia

Resumo

O CEPID B3 é uma rede com pólos de pesquisa sediados em São Paulo (IQ-USP, ICB-USP), Campinas (IB-UNICAMP, IAC), Ribeirão Preto (FCFRP-USP, FMRP-USP) e Rio Claro (UNESP) que colaborará na realização de pesquisas básicas de ponta sobre os mecanismos moleculares de importância primordial para a reprodução bacteriana, o comportamento multicelular, a competição, a colonização e as interações de bactérias com seus hospedeiros eucarióticos e bacteriófagos. Os conhecimentos adquiridos serão utilizados na busca e desenvolvimento de novos inibidores químicos e biológicos do crescimento bacteriano. (AU)