Detecção e caracterização de variantes estruturais no genoma humano utilizando novas tecnologias

• Processo: 22/16766-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Társis Antônio Paiva Vieira
• Beneficiário: Társis Antônio Paiva Vieira
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Cláudia Márcia Benedetto de Carvalho Fonseca ; Vera Lúcia Gil da Silva Lopes
• Assunto(s): Citogenética Análise de sequência de DNA Cromossomos em anel Genoma humano Rearranjo gênico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cromossomos em anel | Mapeamento óptico | Rearranjos cromossômicos balanceados | Rearranjos cromossômicos complexos | Sequenciamento genomico | variantes estruturais | Citogenética Humana

Resumo

Variantes estruturais no genoma humano são definidas como qualquer rearranjo resultado de novos eventos de quebra e junção da dupla fita de DNA, incluem todas as alterações cromossômicas estruturais, e são causa importante de doenças. Rearranjos cromossômicos balanceados (RCBs), rearranjos cromossômicos complexos (RCCs) e cromossomos em anel são raros e podem causar alterações fenotípicas por diferentes mecanismos. Novas tecnologias como o sequenciamento de nova geração e o mapeamento óptico, têm permitido a caracterização de variantes estruturais no genoma em uma resolução sem precedentes, contribuindo na identificação de novos genes de doença e no conhecimento dos mecanismos de origem desses rearranjos. Os objetivos deste projeto são: (a) caracterizar RCBs em indivíduos com fenótipo anormal; (b) caracterizar RCCs; (c) investigar a instabilidade de cromossomos em anel e caracterizar seus pontos de quebra. Para isso serão utilizados os métodos de sequenciamento genômico de 30X e de baixa cobertura, mapeamento óptico, análise cromossômica por microarray (CMA) e hibridação in situ fluorescente (FISH). Os métodos de sequenciamento genômico e mapeamento óptico serão realizados por empresa terceirizada e os dados serão analisados com o apoio da Profa. Claudia Carvalho do Pacific Northwest Research Institute (PNRI) nos EUA, que tem ampla experiência na utilização desses métodos para a caracterização de rearranjos estruturais. Os métodos de FISH e CMA serão realizados no Laboratório de Citogenética Humana e Citogenômica (LCHC) da Unicamp. Este projeto permitirá a caracterização de variantes estruturais no genoma humano, em nível de pares de bases do DNA, podendo contribuir com a identificação de novos genes de doenças e com o conhecimento sobre os mecanismos de origem das alterações estudadas. (AU)