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EMU Infraestrutura de Acervos e Coleções: aquisição de equipamentos para geração de imagens anatômicas radiográficas 2D e 3D das coleções científicas do Departamento de Biologia da FFCLRP, USP, Ribeirão Preto, para disponibilização na internet

Processo:22/11451-2
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa Infraestrutura - Acervos e Coleções
Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
Data de Término da vigência: 31 de maio de 2026
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia - Morfologia dos Grupos Recentes
Pesquisador responsável:Fernando Luis Medina Mantelatto
Beneficiário:Fernando Luis Medina Mantelatto
Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:Ribeirão Preto
Pesquisadores associados:Max Cardoso Langer ; Tiana Kohlsdorf
Bolsa(s) vinculada(s):24/22466-6 - EMU Infraestrutura de Coleções Cientificas do Departamento de Biologia da FFCLRP/USP: Curadoria de Acervos, BP.TT
24/21972-5 - EMU Infraestrutura de Coleções Cientificas do Departamento de Biologia da FFCLRP/USP: Construção de modelos 3D, BP.TT
23/14715-3 - Curadoria e técnicas de preparação, preservação, e análise de material biológico em acervos biológicos: diafanização e coloração diferencial; taxidermia e preparação de material em via seca; inspeção radiográfica 2D e 3D; reconstrução de modelos 3D., BP.TT
Assunto(s):Coleção e conservação de espécies biológicas  Taxonomia dos grupos recentes  Biodiversidade  Sistemática  Imagens  Acervo  Aquisição de equipamentos  Infraestrutura de pesquisa 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Acervos biológicos | Análise Integrativa | Biodiversidade | Coleções científicas | Imagens | Sistemática e Taxonomia

Resumo

O valor das coleções biológicas, especialmente no atual contexto de perda acelerada da biodiversidade planetária, é indubitável. Atualmente, face ao grande desenvolvimento tecnológico e popularização dos meios digitais, grandes bancos de dados de coleções biológicas vêm sendo disponibilizados na internet, o que consequentemente aumenta exponencialmente a sua visibilidade e o seu uso. Neste contexto, a qualidade e precisão das informações contidas nas coleções biológicas é de extrema importância, sendo a revisão dos registros um desafio que precisa ser enfrentado para qualificar os dados das coleções, especialmente quanto às localidades e coordenadas e, assim, possibilitar a vinculação de informações fidedignas aos organismos, possibilitando análises em fina escala. Outro avanço tecnológico que afeta diretamente o uso das coleções biológicas é a possibilidade de disponibilizar em ambiente virtual imagens de alta qualidade tanto do exterior do material biológico quanto de seu interior, utilizando equipamentos de inspeção radiológica e micro/nano tomógrafos e técnicas computacionais de reconstrução de modelos 3D, permitindo a disseção virtual de partes anatômicas. Diante do exposto, o presente projeto tem por objetivo a aquisição de um conjunto de equipamentos multiusuários para a geração de imagens radiográficas 2D e de reconstrução de modelos 3D das coleções científicas do Departamento de Biologia da FFCLRP-USP, Ribeirão Preto, para uso em pesquisas, ensino e disponibilização na internet. Mais especificamente, o presente projeto tem por objetivo a compra de: um sistema de inspeção radiográfica digital para rápido acesso a informações anatômicas internas, especialmente do esqueleto; conjunto de 6 estações de trabalho computacionais e respectivos softwares para segmentação de reconstruções 3D geradas pelo nano/micro CT-Scan computadorizado; uma estação de trabalho computacional para armazenamento, organização e disponibilização de imagens relacionadas aos espécimes das coleções na internet. Além disso, almejamos abrir a oportunidade para a formação humana especializada com o treinamento técnico de três bolsistas TT FAPESP. O DB/FFCLRP/USP abriga atualmente quatorze (14) coleções científicas, sendo onze (11) delas acervos de espécimes mortos/preservados, as quais juntas mantêm mais de 500.00 espécimes distribuídos em mais de 134.000 lotes. Cada uma dessas coleções está associada a um laboratório de pesquisa e respectivo curador específico, suportado por infraestrutura física, humana e organizacional dedicada, além de um laboratório multiusuário, Centro para Documentação da Biodiversidade (CDB). O CDB é estruturado por um Comitê Gestor, um Responsável por Equipamentos e por uma Comissão de Usuários, e possui corpo técnico dedicado a operar e dar manutenção aos equipamentos multiusuários (tomógrafo industrial (nano/micro-CT e ao estereomicroscópio com captura de imagem). O CDB faz parte da plataforma USP Multi - Centrais de Equipamentos Multiusuários, a qual torna o parque de equipamentos da instituição visível e de fácil acesso ao compartilhamento e traz facilidades para sua gestão otimizada e manutenção prioritária institucional, com uso prioritário de verbas como a reserva técnica institucional FAPESP, além de possuir mecanismos instalados para transferência orçamentária e para recebimento de pagamentos externos a partir da fundação da FFCLRP. Assim, há suficiente capacidade técnica e de infraestrutura e apoio institucional para garantir a adequada utilização do EMU solicitado. A aprovação deste projeto terá enorme impacto positivo nas áreas da educação, pesquisa e extensão promovidos pela intuição sede, incluindo os projetos associados e complementares que apoiam o presente projeto EMU, tornando possível o acesso a informações até então inacessíveis, possibilitando novas análises e geração de informações imprescindíveis para o avanço de qualidade das pesquisas realizadas. (AU)

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Publicações científicas (13)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
TAMBURUS, ANA FRANCISCA; TELES, JENIFFER NATALIA; VALEZIO, BEATRIZ HELOISA; MANTELATTO, FERNANDO LUIS. . BIOLOGICAL BULLETIN, v. 246, n. 1, p. 10-pg., . (10/50188-8, 18/13685-5, 16/50376-5, 98/07454-5, 21/08075-6, 09/54931-0, 02/08178-9, 22/11451-2)
BIRINDELLI, JOSE L. O.; SEVERO-NETO, FRANCISCO; MOREIRA, CRISTIANO R.; COLARES, LUCAS F.; OLIVEIRA, LUCAS P.; MONTAG, LUCIANO F. A.; MARINHO, MANOELA M. F.; SOARES, KARLA D. A.; SHIBATTA, OSCAR A.; DI DARIO, FABIO; et al. . Biological Journal of the Linnean Society, v. 146, n. 3, p. 18-pg., . (22/11451-2, 14/15168-7, 17/12909-4, 17/01970-4, 23/02499-4)
PEREIRA-SANTOS, AURORA; BOCHINI, GABRIEL L.; FELDER, DARRYL L.; MANTELATTO, FERNANDO L.. . JOURNAL OF CRUSTACEAN BIOLOGY, v. 45, n. 4, p. 15-pg., . (18/13685-5, 21/08075-6, 10/50188-8, 22/11451-2, 25/07224-9, 09/54931-0)
DE SOUZA, CAIO MARINS RODRIGUES; DE OLIVEIRA, LARA ZAINE SILVA; VAZ, CAROLINA FERREIRA; BAZON, JOSE NORBERTO; VIEIRA, TATIANA MANZINI; GROPPO, MILTON; CROTTI, ANTONIO EDUARDO MILLER; DIAS, POLIANNA ALVES SILVA; DIAS, HERBERT JUNIOR. . BIOTECHNOLOGIE AGRONOMIE SOCIETE ET ENVIRONNEMENT, v. 29, n. 1, p. 11-pg., . (22/11451-2, 22/12597-0, 16/06260-2)
ROSSIGALLI-COSTA, NATHALIA; ANELLI, VINICIUS; KOHLSDORF, TIANA. . Biological Journal of the Linnean Society, v. 145, n. 4, p. 8-pg., . (20/14780-1, 15/07650-6, 21/03089-9, 22/11451-2)
OLIVEIRA-FILHO, RONALDO R.; ANTUNES, MARIANA; TAMBURUS, ANA F.; OLIVEIRA-ROGERI, LUCAS; BOCHINI, GABRIEL L.; HOSTIM-SILVA, MAURICIO; MANTELATTO, FERNANDO L.. . Zootaxa, v. 5621, n. 2, p. 15-pg., . (18/13685-5, 22/11451-2, 16/50376-5, 09/54931-0)
FERREIRA, LUIZ ANTONIO; FERREIRA, DANIELE DA SILVA; TOZATTI, MARCOS GOMIDE; SILVA, MARCELLY CANUTO DE ALMEIDA; GROPPO, MILTON; MAGALHAES, LIZANDRA GUIDI; ANDRADE E SILVA, MARCIO LUIS; JANUARIO, ANA HELENA; PAULETTI, PATRICIA MENDONCA; VERLY, LEONARDO BINDELLI; et al. . NATURAL PRODUCT RESEARCH, v. N/A, p. 6-pg., . (22/12597-0, 16/06260-2, 22/11451-2)
ALONSO, JOAO VICTOR; TELES, JENIFFER NATALIA; BOOS, HARRY; MANTELATTO, FERNANDO LUIS. . Hydrobiologia, v. N/A, p. 18-pg., . (09/54931-0, 22/11451-2, 25/07224-9, 16/50376-5, 21/08075-6, 18/13685-5, 10/50188-8, 24/04231-1)
FRANCA, NIELSON FELIX CAETANO; MAGALHAES, CELIO; MANTELATTO, FERNANDO LUIS. . ZOOSYSTEMATICS AND EVOLUTION, v. 101, n. 4, p. 21-pg., . (18/13685-5, 10/50188-8, 22/11451-2, 25/07224-9, 21/08075-6, 16/50376-5, 09/54931-0)
BALBINO, FELIPE C.; TAMBURUS, ANA F.; MANTELATTO, FERNANDO L.. . ZOOLOGISCHER ANZEIGER, v. 317, p. 14-pg., . (10/50188-8, 23/01382-6, 24/11643-4, 22/11860-0, 22/11451-2, 23/10796-9)
SOUZA-CARVALHO, EDVANDA A.; MAGALHAES, CELIO; CARVALHO, FABRICIO L.; MANTELATTO, FERNANDO L.. . ARTHROPOD SYSTEMATICS & PHYLOGENY, v. 83, p. 15-pg., . (09/54931-0, 22/11451-2, 18/13685-5, 02/08178-9, 10/50188-8)
VISIN, YASMINE LUISE; DE SOUZA, BEATRIZ COSTA; DA COSTA, FERNANDO BATISTA. . CHEMISTRY & BIODIVERSITY, v. N/A, p. 12-pg., . (22/12597-0, 16/06260-2, 22/11451-2, 19/01486-0)
ZANI, PEDRO H. N.; MANTELATTO, FERNANDO L.; BOCHINI, GABRIEL L.. . REGIONAL STUDIES IN MARINE SCIENCE, v. 90, p. 11-pg., . (21/08075-6, 18/13685-5, 22/11451-2)