Normalização de dados do perfil de miRNA na urina de pacientes com câncer de cabeça e pescoço tratados com cisplatina

• Processo: 23/08312-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2023
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
• Pesquisador responsável: Patricia Moriel
• Beneficiário: Patricia Moriel
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Cisplatino Neoplasias de cabeça e pescoço MicroRNAs Epigenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cisplatin | head and neck cancer | miRNA | epigenética

Resumo

O perfil de expressão de microRNA (miRNA) por qRT-PCR depende diretamente da estratégia de normalização mais adequada adotada; entretanto, atualmente não existe um gene de referência universalmente adequado. Portanto, este estudo teve como objetivo determinar, considerando os resultados do RNA-Seq, o normalizador endógeno mais adequado para uso na quantificação relativa de miRNAs na urina de pacientes tratados com cisplatina com câncer de cabeça e pescoço. O sequenciamento maciço foi realizado para identificar os miRNAs expressos diferencialmente entre o grupo com nefrotoxicidade da cisplatina (n = 6) e o sem (n = 6). O normalizador endógeno candidato foi escolhido de acordo com quatro critérios: (1) o miRNA deve ser expresso na maioria das amostras; (2) o miRNA deve ter um valor de dobra entre 0,99 e 1,01; (3) o miRNA deve ter um p-valor e 0,98; e (4) o miRNA não deve ser comentado pela análise final do GeneGlobe (Qiagen). Quatro miRNAs atenderam a todos os critérios (hsa-miR-363-5p, hsa-miR-875-5p, hsa-miR-4302 e hsa-miR-6749-5p) e foram selecionados para validação por qRT-PCR em uma coorte de 49 pacientes (incluindo os 12 participantes do sequenciamento). Apenas hsa-miR-875-5p se mostrou um normalizador adequado para a condição experimental sob investigação, pois exibiu expressão invariante entre os dois grupos. (AU)