EVOLUÇÃO DE CATÁLOGOS DE DNAs SATÉLITES EM CHARACIFORMES (Vertebrata: Teleostei): UMA HISTÓRIA DE 100 MILHÕES DE ANOS

• Processo: 22/13381-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Ricardo Utsunomia
• Beneficiário: Ricardo Utsunomia
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Diogo Teruo Hashimoto ; Fábio Porto-Foresti ; Francisco Jesus Ruiz-Ruano Campaña ; GUIGUEN Yann
• Assunto(s): Sequências repetitivas de ácido nucleico DNA satélite Peixes neotropicais Citogenética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: DNA repetitivo | DNA satélite | peixes neotropicais | Citogenetica

Resumo

Os genomas eucarióticos são compostos predominantemente por sequências heterogêneas de DNA repetitivo, cujas funções, em grande parte, não são exatamente conhecidas. Neste grupo, se inserem os DNAs satélites (satDNAs), que são sequências únicas repetidas em tandem que ocupam preferencialmente as regiões de heterocromatina. Historicamente, técnicas distintas foram utilizadas para a caracterização de satDNAs únicos, como a restrição enzimática do genoma, mas apenas na última década, com a popularização de tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) e ferramentas bioinformáticas, é que foi possível realizar estudos que permitiram a caracterização de catálogos representativos de satDNAs (satelitomas) nos mais diversos organismos a custos reduzidos. Recentemente, os primeiros satelitomas de peixes foram divulgados na ordem dos Characiformes em trabalhos independentes, revelando uma quantidade significativa deste tipo de sequência nos genomas destas espécies, embora nenhuma análise comparativa global tenha sido realizada até o momento. Assim, neste estudo, pretendemos caracterizar e comparar satelitomas adicionais de diferentes espécies inseridas na ordem dos Characiformes (com origem estimada em aproximadamente 100 milhões de anos) utilizando sequenciamento de leituras curtas. Além disso, os genomas em nível de cromossomo de duas espécies serão sequenciados e montados com o objetivo de identificar se existem regiões específicas dos genomas em que satDNAs conservados tendem a se acumular. Desta forma, os dados obtidos aqui abrirão a oportunidade de se investigar, de forma inédita, como catálogos inteiros de DNAs satélites evoluem, permitindo a identificação de padrões evolutivos para este tipo de sequência. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DOS SANTOS, RODRIGO ZENI; GOES, CAIO AUGUSTO GOMES; STORNIOLI, JOSE HENRIQUE FORTE; SASSI, FRANCISCO DE MENEZES CAVALCANTE; DE MORAES, RENATA LUIZA ROSA; DERGAM, JORGE ABDALA; PORTO-FORESTI, FABIO; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; UTSUNOMIA, RICARDO. Comparative satellite DNA mapping in species of the genus Prochilodus (Teleostei, Characiformes) and its evolutionary implications. GENOME, v. N/A, p. 8-pg., 2024-12-05. (21/14562-7, 23/00955-2, 21/12722-7, 22/13381-1)

DEON, GEIZE APARECIDA; DOS SANTOS, RODRIGO ZENI; SASSI, FRANCISCO DE MENEZES CAVALCANTE; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; VICARI, MARCELO RICARDO; PORTO-FORESTI, FABIO; UTSUNOMIA, RICARDO; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. The role of satellite DNAs in the chromosomal rearrangements and the evolution of the rare XY₁Y₂ sex system in Harttia (Siluriformes: Loricariidae). JOURNAL OF HEREDITY, v. 115, n. 5, p. 11-pg., 2024-05-17. (23/00955-2, 22/13381-1, 21/14096-6)