Genômica comparada e filogenômica de espécies de moscas-das-frutas do grupo fraterculus. III. A Terra desconhecida

• Processo: 22/12583-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de novembro de 2023 - 31 de outubro de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito
• Beneficiário: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Assunto(s): Especiação Evolução molecular Metilação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Especiação | evolução molecular | genômica comparada | genômica de populações | metilação | genética evolutiva

Resumo

Embora algumas espécies do grupo fraterculus de moscas-das-frutas sejam das maiores ameaças à fruticultura nacional, sabemos muito pouco ainda sobre sua biologia e diferenciação. Em projetos anteriores, utilizamos de dados de sequenciamento de genoma e transcriptoma para identificar milhares de regiões nos genomas de espécies diferentes de Anastrepha que têm grande potencial para nos permitir avaliar diversidade natural de espécies de Anastrepha e sua associação com diferentes frutos hospedeiros. Tais procedimentos são especialmente importantes no processo de adaptação de Anastrepha, que tem se diferenciado com fluxo gênico, em especial no grupo fraterculus. A diferenciação com fluxo gênico dificulta a identificação de regiões no genoma envolvidas com tal diferenciação, mas utilizaremos aqui estratégias que podem fazê-lo. Em estudos anteriores, identificamos regiões filogeneticamente informativas para análises filogenômicas tanto em Anastrepha, como até mesmo para espécies mais próximas. Contudo, o melhor entendimento dos limites de sua utilidade demanda uma expansão da amostragem, tanto de espécies quanto de localidades, que terão seus genomas investigados por meio de ressequenciamento de genes de interesse e análises filogenômicas e de seleção. O estudo de forças evolutivas envolvidas na diferenciação dessa regiões também passará pela identificação de suas marcações epigenéticas, que podem estar associadas a adaptação a diferentes condições edáficas, ou até mesmo a diferentes hospedeiros. Assim, a identificação de regiões diferentemente metiladas pode trazer importante informação para o entendimento do seu papel na diferenciação ecológica, uma vez que pode permitir maior plasticidade e facilitar tanto que a adaptação a diferentes hospedeiros seja transferida para a progênie, mas também entre espécies distintas. A combinação da identificação de regiões no genoma que apresentam marcas epigenéticas associadas à diferentes hospedeiros com a identificação de regiões no genoma que diferem entre espécies promete auxiliar tanto na identificação do processo adaptativo a diferentes hospedeiros, como seu papel na diferenciação das espécies e identificação das principais regiões no genoma e forças evolutivas envolvidas. (AU)