Associação genótipo ampla para as características de produção de leite, frame e conformação de úbere de bovinos Gir Leiteiro

• Processo: 24/14252-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Josineudson Augusto Ii de Vasconcelos Silva
• Beneficiário: Josineudson Augusto Ii de Vasconcelos Silva
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Avaliação genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Body conformation traits | Candidate Genes | Dairy Cattle | Avaliação genética

Resumo

Estudos de associação genômica ampla (GWAS) são empregados para identificar regiões genômicas e genes candidatos associados a diferentes características. O objetivo deste estudo foi realizar um GWAS para identificar variantes causais e genes associados à produção de leite, estrutura e características de conformação do úbere em gado Gir leiteiro. As características de conformação corporal foram classificadas como características de "estrutura" e "úbere" para este estudo. Após a imputação da genotipagem e o controle de qualidade, 42.105 polimorfismos estavam disponíveis para análises e 24.489 vacas com informações de pedigree tinham fenótipos. Primeiro, P-valor foi calculado com base na variância do erro de predição dos efeitos do SNP na primeira iteração. Depois disso, mais duas iterações foram realizadas para realizar a metodologia de associação genômica ampla ponderada de etapa única, realizada usando janelas móveis genômicas definidas com base no desequilíbrio de ligação. Os SNPs significativos e as 10 principais janelas que explicam a maior porcentagem de variância genética aditiva foram selecionados e usados para anotação de QTL e genes. As variantes identificadas em nosso trabalho se sobrepuseram a QTLs do banco de dados de QTL nos cromossomos 1 a 23, exceto no cromossomo 4. A raça Gir é menos estudada do que a raça Holstein e, portanto, o banco de dados de QTL é tendencioso para os resultados Holstein. Portanto, é digno de nota que nosso GWAS tinha semelhanças com QTLs descritos anteriormente. Esses QTLs previamente conhecidos estavam relacionados à produção de leite, altura do corpo, ângulo da garupa, largura do úbere e profundidade do úbere. No total, cinco genes foram anotados. Destes genes, FAM13A e CMSS1 foram anteriormente relacionados ao peso ósseo e da carcaça em bovinos. (AU)