EMU: Aquisição de sequenciador Sanger e sistema para eletroforese capilar para apoio à pesquisa biológica e biomédica no Centro de Ciências Biológicas e da Saúde da UFSCar

• Processo: 23/17182-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Infraestrutura - Pequeno Médio Porte
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2027
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Flavio Henrique da Silva
• Beneficiário: Flavio Henrique da Silva
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Anderson Ferreira da Cunha ; André Rodrigues ; Anthony César de Souza Castilho ; Cláudia Lima Verde Leal ; Enilza Maria Espreafico ; Hugo Miguel Preto de Morais Sarmento ; João Carlos Pinheiro Ferreira ; Lawrence Charles Smith
• Assunto(s): Eletroforese capilar Genomas Sequenciador de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Eletroforese Capilar | Genoma | Sequenciador de DNA | Sequenciamento Automatico | sequenciamento pelo método de dideoxinucleotídeos | Sequenciamento de ácidos nucléicos

Resumo

Esta solicitação abrange dois equipamentos, um sequenciador de ácidos nucleicos do tipo Sanger e um sistema para eletroforese capilar. Ambos, se aprovados, irão compor Laboratório Multiusuário de Biologia Celular e Molecular (LMBCM) da UFSCar, instalado no prédio BioTrop do Centro de Ciências Biológicas e da Saúde desta universidade. O sequenciador Spectrum Compact CE System contém quatro capilares e é compatível com a análise simultânea de uma até 32 amostras por corrida. A função de sequenciamento é baseada no uso de didesoxinucleotídeos (ddNTPs) marcados com fluorescência, sendo compatível com a maioria dos reagentes disponíveis no mercado baseados no uso de dTAMRA, dROX, dR6G e dR110. O sequenciador permite a análise de fragmentos, sequenciamento de novo, confirmação de sequenciamento de última geração (NGS), detecção de mutação, sequenciamento de DNA mitocondrial, análise de metilação em DNA, identificação de microrganismos, validação de edição genética, sequenciamento de plasmídeos, dentre outras. O outro equipamento solicitado, o 4150 TapeStation é que possui menor custo e o mais utilizado por laboratórios na área. Por meio da eletroforese capilar automatizada, o sistema 4150 TapeStation é compatível com a análise de uma até 16 amostras de DNA ou RNA por corrida. Este equipamento é utilizado na rotina de laboratórios de biologia molecular e sequenciamento de ácidos nucleicos para realização de controle de qualidade e quantificação de amostras de DNA, RNA, bibliotecas de sequenciamento, entre outros. Comparado com outros sistemas de eletroforese capilar como o Bioanalyzer, o 4150 TapeStation apresenta sensibilidade de detecção bastante superior, além de custo da análise por amostra fixo, independente do número de amostras utilizadas na corrida. (AU)