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Projeto VIRGEN - Viral Genetic Diversity Network (VGDN)

Processo: 00/04205-6
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de dezembro de 2000 - 31 de março de 2007
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Beneficiário:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):05/04054-1 - Análise de dados gerados pela Rede de Diversidade Genética Viral (VGDN), BP.TT
05/50070-9 - Rede de Diversidade Genética Viral RDGV, BP.TT
03/02293-3 - Rede de Diversidade Genética Viral RDGV, BP.TT
Assunto(s):Virologia molecular  Técnicas de genotipagem  Epidemiologia molecular 

Resumo

O Projeto VIRGEN colocará em operação uma rede de 20 laboratórios de biologia molecular de vírus e 4 unidades de apoio (laboratório de clonagen e sequenciamento central, unidade de bioinformática, laboratório de campo e unidade de epidemiologia) que irão desenvolver tarefas conjuntas e coordenadas visando a caracterização da diversidade genética viral no estado de São Paulo. Quatro tarefas coordenadas foram eleitas de comum acordo com a Secretaria da Saúde do Estado de São Paulo para investigar, 1200 amostras do vírus de imunodeficiência humana (HIV-1), 1200 de vírus da hepatite C (HCV), 200 de vírus respiratório sincicial (RSV) e 100 de hantavirus, gerando um total de 5 milhões de pares de base de seqüências virais. As duas primeiras tarefas coordenadas (HIV-1 e HCV) durarão 1 ano cada e as duas últimas tarefas (que dependem de isolamento e cultivo viral) serão concluídas no terceiro ano de funcionamento da rede. Seis meses adicionais serão necessários para a conclusão das tarefas, análise final dos dados e geração de publicações, etc. Vários cursos de treinamento para os grupos participantes estão previstos e em andamento. (AU)

Publicações científicas (10)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FAYE, OUMAR; FREIRE, CAIO C. M.; IAMARINO, ATILA; FAYE, OUSMANE; DE OLIVEIRA, JULIANA VELASCO C.; DIALLO, MAWLOUTH; ZANOTTO, PAOLO M. A.; SALL, AMADOU ALPHA. Molecular Evolution of Zika Virus during Its Emergence in the 20th Century. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 8, n. 1 JAN 2014. Citações Web of Science: 376.
MELO, FERNANDO LUCAS; JAMAL, LEDA FATIMA; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO. Characterization of Primary Isolates of HIV Type 1 CRF28_BF, CRF29_BF, and Unique BF Recombinants Circulating in Sao Paulo, Brazil. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 28, n. 9, p. 882-888, SEP 2012. Citações Web of Science: 1.
SOUMARE, P. O. LY; FREIRE, CAIO C. M.; FAYE, OUSMANE; DIALLO, MAWLOUTH; DE OLIVEIRA, JULIANA VELASCO C.; ZANOTTO, PAOLO M. A.; SALL, AMADOU ALPHA. Phylogeography of Rift Valley Fever Virus in Africa Reveals Multiple Introductions in Senegal and Mauritania. PLoS One, v. 7, n. 4 APR 23 2012. Citações Web of Science: 15.
IAMARINO, ATILA; DE MELO, FERNANDO LUCAS; BRACONI, CARLA TORRES; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO. BF Integrase Genes of HIV-1 Circulating in Sao Paulo, Brazil, with a Recurrent Recombination Region. PLoS One, v. 7, n. 4 APR 2 2012. Citações Web of Science: 3.
ROMANO, CAMILA MALTA; GUEDES DE CARVALHO-MELLO, ISABEL M. V.; JAMAL, LEDA F.; DE MELO, FERNANDO LUCAS; IAMARINO, ATILA; MOTOKI, MARCO; REBELLO PINHO, JOAO RENATO; HOLMES, EDWARD C.; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO; CONSORTIUM, VGDN. Social Networks Shape the Transmission Dynamics of Hepatitis C Virus. PLoS One, v. 5, n. 6, p. e11170, 2010. Citações Web of Science: 33.
BOTOSSO, VIVIANE F.; ZANOTTO, PAOLO M. DE A.; UEDA, MIRTHES; ARRUDA, EURICO; GILIO, ALFREDO E.; VIEIRA, SANDRA E.; STEWIEN, KLAUS E.; PERET, TERESA C. T.; JAMAL, LEDA F.; PARDINI, MARIA I. DE M. C.; PINHO, JOAO R. R.; MASSAD, EDUARDO; SANT'ANNA, OSVALDO A.; HOLMES, EDDIE C.; DURIGON, EDISON L.; CONSORTIUM, VGDN. Positive Selection Results in Frequent Reversible Amino Acid Replacements in the G Protein Gene of Human Respiratory Syncytial Virus. PLOS PATHOGENS, v. 5, n. 1, p. e1000254, 2009. Citações Web of Science: 84.
DE MELO‚ F.L.; ROMANO‚ C.M.; DE ANDRADE ZANOTTO‚ P.M. Introduction of dengue virus 4 (DENV-4) genotype I into Brazil from Asia?. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 3, n. 4, p. e390, 2009.
ROMANO, CAMILA M.; DE MELO, FERNANDO L.; CORSINI, MARCO AURELIO B.; HOLMES, EDWARD C.; ZANOTTO, PAOLO M. DE A. Demographic Histories of ERV-K in Humans, Chimpanzees and Rhesus Monkeys. PLoS One, v. 2, n. 10 OCT 10 2007. Citações Web of Science: 9.
ROMANO‚ C.M.; DE MELO‚ F.L.; CORSINI‚ M.A.B.; HOLMES‚ E.C.; PAOLO‚ M.A. Demographic histories of ERV-K in humans‚ chimpanzees and rhesus monkeys. PLoS One, v. 2, n. 10, p. e1026, 2007.
DE S LEAL‚ É.; HOLMES‚ E.C.; ZANOTTO‚ P.M.A. Distinct patterns of natural selection in the reverse transcriptase gene of HIV-1 in the presence and absence of antiretroviral therapy. VIROLOGY, v. 325, n. 2, p. 181-191, 2004.

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