Estudo do controle da expressão gênica e plasticidade genética em Leishmania

• Processo: 06/50323-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de julho de 2006 - 30 de junho de 2011
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Angela Kaysel Cruz
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Luiz Ricardo Orsini Tosi
• Bolsa(s) vinculada(s): 09/01641-4 - Comparação do genoma expresso de isolados de Leishmania braziliensis responsáveis por manifestações clínicas distintas, BP.MS; 08/04969-8 - Investigação de mecanismos e elementos envolvidos no processo de regulação de expressão gênica em Leishmania, BP.DR; 08/53929-9 - Identificação in silico e caracterização funcional de potenciais sítios regulatórios em regiões não-traduzidas nos genomas de Leishmania spp, BP.DD; + mais bolsas vinculadas 07/55728-8 - Caracterizacao do gene lmhus1 e de sua participacao no fenomeno de amplificacao genica em leishmania spp., BP.DR; 07/54504-9 - Estudo da associação da proteína LmHus1 a extremidades cromossômicas de Leishmania major, BP.DD; 07/52867-7 - Investigacao de funcoes alternativas dos produtos dos genes triptofanil trna sintetase de leishmania major., BP.MS; 06/58894-3 - Estudo do contexto genômico como fator da expressão gênica no protozoário Leishmania, BP.DD; 06/59500-9 - Estudo do papel no contexto de alvos sub-telomericos na ruptura sitio-dirigida de genes de leishmania., BP.MS - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Leishmania Regulação da expressão gênica RNA Genômica comparativa Recombinação genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genomica Comparativa | Leishmania | Ncrna | Recombinacao Homologa
• Publicação FAPESP: https://www.fapesp.br/tematicos/saude_cruz.pdf

Resumo

Essa proposta está dirigida a estudos sobre processos e mecanismos de regulação da expressão gênica, recombinação e plasticidade genética, associados a abordagens de genômica comparativa in silico e laboratoriais no parasita Leishmania. Os estudos e abordagens propostos são uma continuação do trabalho que vimos desenvolvendo anteriormente (sob financiamento da FAPESP- 99112403-3). A investigação da presença e mecanismo de ação dos ncRNAs em Leishmania é um tópico que consideramos de alta relevância e os resultados acumulados com o trabalho que vimos desenvolvendo são encorajadores e trazem conceitos novos. As tentativas de demonstrar a existência de uma maquinaria de interferência de RNA similar à de T brucei em L. major não tiveram sucesso, pois é possível que as abordagens experimentais utilizadas sejam inadequadas em função de diferenças desconhecidas na maquinaria de cada organismo. Assim, nossa proposta é ir além da descrição de um fenômeno e investigar o modo de ação de um dos ncRNA, nomeado ODD3, que claramente exerce um efeito sobre a expressão de outros genes levando a alterações fenotípicas marcantes. Investigaremos a interação entre RNAs para entender o papel da seqüência primária e estrutura secundária no efeito observado e também eventual interações entre transcritos e proteínas que possam fazer parte da cascata de eventos desencadeada pela presença de transcrito de ODD3 em excesso. Um outro alvo de investigação sobre regulação de expressão gênica é a proteína ribossomal, L19, pois observamos alteração dos níveis de seu transcrito entre promastigotas e amastigotas de L.major. Some-se ainda a relevante observação de que o padrão de expressão de L19 é diferente em L.braziliensis, onde altos níveis de transcrito são observados em promastigotas, em qualquer fase da cultura. Assim, nossos resultados preliminares nos encorajam a investigar se essa proteína ribossomal tem papel extraribossomal relacionado com controle de expressão gênica, como descrito para outros organismos. Outros mecanismos de regulação de expressão gênica serão abordados e envolvem genes que vimos estudando anteriormente como os que codificam para as isoformas citosólica e glicossômica da fosfoglicerato quinase (PGK) em L. major. Já demonstramos o envolvimento da região 3' não traduzida (3 'UTR) no controle da expressão da isoforma glicossômica e pretendemos delimitar a região responsável pelo controle bem como estabelecer se a localização glicossômica da proteína exerce sobre ele algum efeito. Além disso, para ir além da descrição do fenômeno, e dependendo do estabelecimento das técnicas de investigação de interações proteína-RNA que empregaremos para estudar a L19, também vamos investigar proteínas que interajam com a região controladora da PGKC. O outro tema que vimos investigando engloba processos de recombinação genética observados em Leishmania e seu papel na plasticidade genética. Nas tentativas de disrupção de um gene essencial, de extremidade cromossômica, observamos mudanças genotípicas que não podem ser explicadas pelos modelos propostos de amplificação e rearranjo de DNA para Leishmania. Temos resultados preliminares que sugerem haver recombinação entre seqüências presentes nas extremidades dos cromossomos com elementos de epissomos circulares e não há qualquer relato anterior que descreva fenômeno semelhante em Leishmania. Assim sendo, toma-se importante utilizar os mutantes gerados para investigar o fenômeno de recombinação e definir eventuais fatores relacionados aos processos de recombinação observados...(AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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