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Do genoma à biologia de Leishmania: uma abordagem compreensiva

Processo: 99/12403-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de dezembro de 2000 - 31 de janeiro de 2006
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Angela Kaysel Cruz
Beneficiário:Angela Kaysel Cruz
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):04/00859-2 - Investigação sobre elementos envolvidos no controle de expressão gênica em Leishmania: os genes das fosfoglicerato-quinases como modelos, BP.DR
04/00613-3 - RNAs não-codificadores de leishmanias: análise fenotípica de linhagens superexpressoras, BP.IC
02/14163-4 - Estudo do embaralhamento de sequência e truncamento de genes nas extermidades de cromossomos de Leishmania major, BP.DR
+ mais bolsas vinculadas 02/02766-6 - Análise funcional de RNAs não codificadores em Leishmania, BP.PD
02/04153-1 - Do genoma a biologia de Leishmania: uma abordagem compreensiva, BP.TT
01/11351-1 - Caracterização de um gene preferencialmente expresso em amastigotas de Leishmania major, BP.IC
01/13461-9 - Abordagens de genômica comparativa através da utilização de GSSs e sequenciamento do cromossomo 2 de Leishmania major, BP.PD
01/09513-3 - Sequenciamento de uma extremidade do cromossomo 7 de Leishmania major e construção de vetores para estdos funcionais, BP.MS
01/08744-1 - Lmasf1: estudo de um gene de região telomérica de "Leishmania major" com potencial função anti-silenciadora, BP.PD
01/04808-5 - Do genoma à biologia de Leishmania: uma abordagem compreensiva, BP.TT
01/02007-5 - Do genoma a biologia de Leishmania: uma abordagem compreensiva, BP.TT
00/15061-5 - Avaliação funcional de transcritos de "Leishmania" com características não usuais, BP.PD
00/14480-4 - Localização e caracterização de sequências centroméricas em (Leishmania major), BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Virulência  Genomas  Centrômero  Proteínas  Leishmania 

Resumo

Os desenvolvimentos da pesquisa genômica revelam a importância da coordenação e análise da vasta informação acumulada com vistas à biologia e evolução dos organismos estudados. Em Leishmania o desenvolvimento da pesquisa genômica promete tomar-se um instrumento fundamental para a busca de métodos eficientes de tratamento e prevenção da leishmaniose, uma doença de importância epidemiológica indiscutível. O projeto genoma de Leishmania vem acumulando informações acerca da estrutura e organização deste genoma e se concentra agora no seqüenciamento. Os primeiros delineamentos de estratégias de análise funcional começam a aparecer. É importante ressaltar que os estudos de seqüências e estruturas do genoma e, mais recentemente, a tônica funcional devem estar permeados pela preocupação com as particularidades genéticas desse organismo. E sob este prisma que nasce a proposta temática aqui apresentada. A ênfase estará na determinação de seqüência e caracterização de estruturas do genoma ressaltando a relevância fenotípica da informação gerada. Os objetivos principais foram divididos em seis subprojetos. Em um deles, nossa proposta é a determinação da seqüência completa do cromossoma 2 deste parasita, corno parte do consórcio internacional de seqüenciamento do genoma de L. major. Nesta direção estaremos utilizando, como estratégia de apoio ao seqüenciamento, o sistema mariner de transposição in vitro. Além de contribuir no seqüenciamento, os transposons serão utilizados no desenvolvimento de uma estratégia de nocaute sistemático de genes neste mesmo cromossomo. Devido à características do sistema de transposição de que dispomos, os alvos para nocaute serão seqüências efetivamente expressas no parasita, portanto temos um sistema com dupla função: gerar fragmentos apropriados para nocautes aleatórios e funcionar como 'armadilha de genes'. A análise molecular das seqüências centroméricas de Leishmania é importante para entender a estrutura do centrômero enquanto elemento fundamental para a segregação dos cromossomos. A localização de seqüências que estabilizem e permitam a segregação durante o processo de mitose vem sendo conduzida em nosso laboratório através da transfecção de clones gênicos de bibliotecas construídas em vetores lineares. Selecionamos clones que apresentam dinâmica de manutenção sugestiva de presença de seqüências centroméricas, e estes clones serão analisados funcionalmente, procurando delimitar o elemento centromérico e estabelecer, a seguir, a distribuição destes elementos ao longo dos cromossomos em Leishmania. Em nossos estudos sobre a região telomérica selecionamos 3 clones provenientes de 3 extremidades cromossômicas distintas. O perfil de transcrição dessas regiões foi delineado através do uso de transfectantes contendo cada um dos clones teloméricos... (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AZEVEDO, ALINE; TOLEDO, JULIANO S.; DEFINA, TANIA; PEDROSA, ANDRE L.; CRUZ, ANGELA K. Leishmania major phosphoglycerate kinase transcript and protein stability contributes to differences in isoform expression levels. Experimental Parasitology, v. 159, p. 222-226, DEC 2015. Citações Web of Science: 1.
SCHER, RICARDO; FERREIRA GARCIA, JULIANA BORIO; PASCOALINO, BRUNO; SCHENKMAN, SERGIO; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Characterization of anti-silencing factor 1 in Leishmania major. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 107, n. 3, p. 377+, MAY 2012. Citações Web of Science: 5.
DE TOLEDO, JULIANO SIMOES; JUNQUEIRA DOS SANTOS, ANDRE F.; DE MOURA, TATIANA RODRIGUES; ANTONIAZI, SIMONE APARECIDA; BRODSKYN, CLAUDIA; DE OLIVEIRA, CAMILA INDIANI; BARRAL, ALDINA; CRUZ, ANGELA KAYSEL. Leishmania (Viannia) braziliensis transfectants overexpressing the miniexon gene lose virulence in vivo. Parasitology International, v. 58, n. 1, p. 45-50, Mar. 2009. Citações Web of Science: 6.
LAURENTINO, ELIANE C.; RUIZ, JERONIMO C.; BRITO, LOISLENE O.; FIANDT, MICHAEL; NICOLETTI, LILIANA M.; JAMUR, M. C.; OLIVER, C.; TOSI, LUIZ R. O.; CRUZ, ANGELA K. The use of Tn5 transposable elements in a gene trapping strategy for the protozoan Leishmania. International Journal for Parasitology, v. 37, n. 7, p. 735-742, June 2007.
SQUINA‚ F. M.; PEDROSA‚ A. L.; NUNES‚ V. S.; CRUZ‚ A. K.; TOSI‚ L. R. O. Shuttle mutagenesis and targeted disruption of a telomere-located essential gene of Leishmania. Parasitology, v. 134, n. 04, p. 511-522, Apr. 2007.

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