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Caracterização de novas proteínas envolvidas em processamento de RNA em Saccharomyces cerevisiae

Processo: 03/06031-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de novembro de 2003 - 30 de novembro de 2006
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Carla Columbano de Oliveira
Beneficiário:Carla Columbano de Oliveira
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Processamento de RNA  Interação proteína-proteína  Expressão gênica  Eucariotos  Mapeamento de interação de proteínas  Saccharomyces cerevisiae 

Resumo

O RNA tem um papel chave no controle de expressão gênica em eucariotos. Em eucariotos, três dos rRNAs são transcritos como um precursor único, de 35S, que é processado, originando os rRNAs de 18S, 5,8S e 35S/38S, que formarão as subunidades ribossomais maduras. Essas etapas envolvem interações RNA-proteínas específicas que vão determinar a eficiência e o tempo de tradução dos mRNAs, e portanto, são determinantes para o controle de expressão gênica. Vários dos fatores protéicos envolvidos nesses processos já foram identificados na levedura Saccharomyces cerevisiae e outros organismos, mas muitos fatores continuam não caracterizados. Este trabalho visa a caracterização da função de novas proteínas de S. cerevisiae identificadas em nosso laboratório e a determinação de seu papel no metabolismo de RNA. Como essas proteínas não têm função identificada, a sua caracterização em levedura gerará dados inéditos, com possíveis implicações na área de controle pós-transcricional de expressão gênica. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GRANATO‚ D.C.; MACHADO-SANTELLI‚ G.M.; OLIVEIRA‚ C.C. Nop53p interacts with 5.8 S rRNA co-transcriptionally‚ and regulates processing of pre-rRNA by the exosome. FEBS Journal, v. 275, n. 16, p. 4164-4178, 2008.
LUZ‚ JS; TAVARES‚ JR; GONZALES‚ FA; SANTOS‚ MCT; OLIVEIRA‚ CC. Analysis of the Saccharomyces cerevisiae exosome architecture and of the RNA binding activity of Rrp40p. Biochimie, v. 89, n. 5, p. 686-691, 2007.
GRANATO‚ D.C.; GONZALES‚ F.A.; LUZ‚ J.S.; CASSIOLA‚ F.; MACHADO-SANTELLI‚ G.M.; OLIVEIRA‚ C.C. Nop53p‚ an essential nucleolar protein that interacts with Nop17p and Nip7p‚ is required for pre-rRNA processing in Saccharomyces cerevisiae. FEBS Journal, v. 272, n. 17, p. 4450-4463, 2005.

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