Identificação de transcritos de Eimeria maxima e de Eimeria tenella empregando ORESTES e SAGE

• Processo: 03/14031-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2004
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Patologia Animal
• Pesquisador responsável: Alda Maria Backx Noronha Madeira
• Beneficiário: Alda Maria Backx Noronha Madeira
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Parasitologia veterinária Coccidioses animal Eimeria Aves Transcriptoma Etiquetas de sequências expressas Técnica ORESTES Análise serial da expressão gênica (SAGE)
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coccidiose Aviaria | Est | Orestes | Parasitologia | Sage | Sequenciamento De Dna

Resumo

A coccidiose aviária é uma doença causada por protozoários do gênero Eimeria, sendo responsável por enormes prejuízos à indústria avícola. Apesar do parasita e seu ciclo de vida já serem conhecidos, aspectos básicos como o desenvolvimento da imunidade do hospedeiro e tropismo das diferentes espécies patogênicas por sítios distintos de infecção no intestino, ainda estão por ser elucidados. Da mesma forma, os mecanismos moleculares envolvidos na regulação das principais etapas do ciclo de vida do parasita continuam a ser pouco entendidos. Com a finalidade de se obter um maior conhecimento do transcriptoma desses parasitas e de realizar estudos comparativos, este projeto propõe o sequenciamento, análise, a montagem e anotação de 10.000 ESTs (Expressed Sequence Tags) de oocistos esporulados de Eimeria maxima gerados pela técnica ORESTES. Com a finalidade de quantificação e caracterização do transcriptoma de dois estágios de E. tenella, também é objetivo deste projeto o sequenciamento de 20.000 tags provenientes de bibliotecas SAGE (serial analysis of gene expression) de esporozoítos e merozoítos. A análise de Bioinformática das sequências geradas será feita por meio de um sistema de análise automática (pipeline) desenvolvido em nosso laboratório. Serão também utilizadas as bases de dados para busca de motivos protéicos como PFAM e InterPro. As proteínas serão categorizadas de acordo com o Gene Ontology (GO). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

NOVAES, JENIFFER; RANGEL, LUIZ THIBERIO L. D.; FERRO, MILENE; ABE, RICARDO Y.; MANHA, ALESSANDRA P. S.; DE MELLO, JOANA C. M.; VARUZZA, LEONARDO; DURHAM, ALAN M.; MADEIRA, ALDA MARIA B. N.; GRUBER, ARTHUR. A comparative transcriptome analysis reveals expression profiles conserved across three Eimeria spp. of domestic fowl and associated with multiple developmental stages. International Journal for Parasitology, v. 42, n. 1, p. 39-48, JAN 2012. (03/14031-3, 09/12643-8)

RANGEL, LUIZ THIBERIO; NOVAES, JENIFFER; DURHAM, ALAN M.; MADEIRA, ALDA MARIA B. N.; GRUBER, ARTHUR. The Eimeria Transcript DB: an integrated resource for annotated transcripts of protozoan parasites of the genus Eimeria. DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION, FEB 14 2013. (03/14031-3)

RANGEL, LUIZ THIBERIO; NOVAES, JENIFFER; DURHAM, ALAN M.; MADEIRA, ALDA MARIA B. N.; GRUBER, ARTHUR. The Eimeria Transcript DB: an integrated resource for annotated transcripts of protozoan parasites of the genus Eimeria. DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION, v. N/A, p. 8-pg., 2013-02-14. (03/14031-3)