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Mapeamento de marcadores SSR EST-derivados e AFLP em feijão (Phaseolus Vulgaris L.)

Processo: 04/13547-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de maio de 2005 - 31 de março de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Maria Lúcia Carneiro Vieira
Beneficiário:Maria Lúcia Carneiro Vieira
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Mapeamento genético  Etiquetas de sequências expressas  Repetições de microssatélites  Locos de características quantitativas  Análise do polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados 

Resumo

Mapas de ligação têm sido estabelecidos para Paseolus vulgaris com base em marcas de RFLP, RAPE), SCAR, isoenzímas, e locos fenotípicos, sendo que alguns deles foram reunidos em um mapa mais denso e completo do genoma do feijão, chamado mapa núcleo. No entanto, para o uso efetivo de mapas de ligação em programas de melhoramento estes devem ser suficientemente saturados. Visando estabelecer um corpo de conhecimento e gerar produtos foi criado o consórcio internacional 'Phaseomis', no qual um grupo brasileiro (ESALQ/USP) através do projeto BEST (Bean EST project) gerou mais de 5.000 ESTs a partir do seqüenciamento de clones c-DNA de tecidos foliares da linhagem de feijão preto, SEL 1308, onde foram encontradas 240 seqüências candidatas a microssatélites (http://lgm.esalq.usp.br/BEST). Assim, este projeto visa saturar o mapa núcleo de P. vulgaris a partir do desenvolvimento de novos marcadores moleculares como AFLP e SSR baseados nas seqüências de ESTs e, testar a transferibilidade destes para outros cultivares e espécies relacionadas. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
HANAI, LUIZ RICARDO; SANTINI, LUCIANE; ARANHA CAMARGO, LUIS EDUARDO; PELEGRINELLI FUNGARO, MARIA HELENA; GEPTS, PAUL; TSAI, SIU MUI; CARNEIRO VIEIRA, MARIA LUCIA. Extension of the core map of common bean with EST-SSR, RGA, AFLP, and putative functional markers. MOLECULAR BREEDING, v. 25, n. 1, p. 25-45, JAN 2010. Citações Web of Science: 54.
HANAI‚ L.R.; DE CAMPOS‚ T.; CAMARGO‚ L.E.A.; BENCHIMOL‚ L.L.; DE SOUZA‚ A.P.; MELOTTO‚ M.; CARBONELL‚ S.A.M.; CHIORATTO‚ A.F.; CONSOLI‚ L.; FORMIGHIERI‚ E.F.; OTHERS. Development‚ characterization‚ and comparative analysis of polymorphism at common bean SSR loci isolated from genic and genomic sources. GENOME, v. 50, n. 3, p. 266-277, 2007.

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