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Estudos estruturais da LGI1 humana

Processo: 05/03234-6
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de janeiro de 2006 - 30 de abril de 2009
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica
Pesquisador responsável:Ricardo Aparicio
Beneficiário:Ricardo Aparicio
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Epilepsia do lobo temporal  LGI1  Cristalografia de proteínas  Espalhamento de raios X a baixos ângulos 

Resumo

A epilepsia de lobo temporal é a mais frequente das epilepsias parciais. A proteína humana LGI1 está relacionada à epilepsia do lobo temporal com sintomas auditivos (ADLTE), uma das formas familiares de epilepsia de lobo temporal. As informações disponíveis sobre a estrutura da LGI1 são baseadas em análises in silico. Um maior conhecimento de sua função, ainda ignorada, é primordial para o entendimento da epileptogênese. Este projeto tem como objetivos a determinação da estrutura cristalográfica da LGI1 humana e a realização de estudos estruturais da proteína em solução. As informações obtidas da estrutura de alta resolução resolvida por Cristalografia serão complementadas com as da estrutura em solução determinada por SAXS. O uso combinado destas técnicas será de grande valia para uma compreensão mais profunda de características estruturais que podem ser indicativos da função da LGI1, ajudando na predição de sítios funcionais e de interação com ligantes e outras proteínas. A proteína será obtida por expressão recombinante em trabalho colaborativo com a Profa. Dra. Iscia Teresinha Lopes-Cendes, FCM/Unicamp, que coordena estudos de genética médica visando identificar proteínas com as quais a LGI1 interage. A proteína será submetida a estudos por Cristalografia e SAXS após análise prévia por CD (verificação de integridade estrutural) e DLS (verificação de agregados). Com exceção da coleta de dados de SAXS e Cristalografia, todas as etapas da análise estrutural serão realizadas no IQ/Unicamp. As investigações propostas podem contribuir de maneira significativa para o entendimento, em nível atômico e molecular, de interações relacionadas ao mecanismo da ADLTE e à epileptogênese. Em âmbito mais geral, o projeto é parte de uma iniciativa para estabelecer um grupo de Cristalografia de Proteínas no Instituto de Química da Unicamp. (AU)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PEREIRA MACHADO, AGNES THIANE; BARRETO FONSECA, EMANUELLA MARIA; DOS REIS, MARCELO AUGUSTO; SARAIVA, ANTONIO MARCOS; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; SZYMANSKI DE TOLEDO, MARCELO AUGUSTO; POLIKARPOV, IGOR; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; APARICIO, RICARDO; IULEK, JORGE. Conformational variability of the stationary phase survival protein E from Xylella fastidiosa revealed by X-ray crystallography, small-angle X ray scattering studies, and normal mode analysis. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 85, n. 10, p. 1931-1943, OCT 2017. Citações Web of Science: 0.
DOS REIS, MARCELO AUGUSTO; SARAIVA, ANTONIO MARCOS; DOS SANTOS, MARCELO LEITE; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; APARICIO, RICARDO. Crystallization and preliminary X-ray analysis of stationary phase survival protein E (SurE) from Xylella fastidiosa in two crystal forms. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 68, n. 4, p. 464-467, APR 2012. Citações Web of Science: 1.
SARAIVA, ANTONIO M.; REIS, MARCELO A.; TADA, SUSELY F.; ROSSELLI-MURAI, LUCIANA K.; SCHNEIDER, DILAINE R. S.; PELLOSO, ALEXANDRE C.; TOLEDO, MARCELO A. S.; GILES, CARLOS; APARICIO, RICARDO; DE SOUZA, ANETE P. Functional and small-angle X-ray scattering studies of a new stationary phase survival protein E (SurE) from Xylella fastidiosa - evidence of allosteric behaviour. FEBS Journal, v. 276, n. 22, p. 6751-6762, 2009. Citações Web of Science: 6.
MURAI, MARCELO J.; SASSONIA, ROGERIO C.; ZAMBONI, ANDRE H.; CONTE, FABIO F.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; APARICIO, RICARDO; DE OLIVEIRA, MARCELO G.; LOPES-CENDES, ISCIA. Characterization of the C-terminal half of human juvenile myoclonic epilepsy protein EFHC1: Dimer formation blocks Ca2+ and Mg2+ binding to its functional EF-hand. Archives of Biochemistry and Biophysics, v. 477, n. 1, p. 131-138, SEP 1 2008. Citações Web of Science: 5.

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