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Redes regulatórias da cana-de-açúcar

Processo: 07/58860-4
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de agosto de 2008 - 31 de outubro de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Glaucia Mendes Souza
Beneficiário:Glaucia Mendes Souza
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores principais:Helaine Carrer ; Hermann Paulo Hoffmann ; Marcelo Menossi Teixeira
Assunto(s):Cana-de-açúcar  Melhoramento genético vegetal  Fator de transcrição AP-1  Plantas geneticamente modificadas  Proteínas quinases 

Resumo

Este projeto foca estudos de regulação gênica e visa a geração de ferramentas que permitam abordagens da Biologia Sistêmica em cana-de-açúcar e a identificação de redes regulatórias. Como ponto de partida escolhemos caracterizar dois tratos agronômicos de interesse desta cultura: o teor de sacarose e a resposta a seca. Pretendemos estudar categorias gênicas com conhecido papel regulatório (Fatores de Transcrição, Proteínas Quinases e Fosfatases), aprofundar estudos do Transcriptoma, produzir plantas transgênicas para genes de interesse e desenvolver ferramentas de bioinformática e bancos de dados integrando os varies níveis de informação. Identificaremos os alvos de TFs utilizando a técnica de ChIP-HTS e clonando promotores. Os resultados terão consequências diretas múltiplas nos programas de melhoramento que frequentemente selecionam mudanças nos CREs e TFs na busca de genótipos mais adaptados ao ambiente e com maior performance agronômica. As proteínas quinases atuam em cascatas de sinalização de respostas a estímulos ambientais e nossos dados apontam para um papel predominante das PKs na regulação do teor de sacarose e resposta a seca. Para identificar novos genes associados à brix e seca caracterizaremos o transcriptoma de genótipos e cultivares contrastantes para estes tratos utilizando chips de oligonucleotídeos. Genes de interesse serão então avaliados quanta a sua função pela geração e análise de plantas transgênicas. Para integrar o grande conjunto de dados públicos e gerados pelo projeto uma infraestrutura computacional robusta será desenvolvida. O banco de dados SUCEST-FUN integrara dados do SUCEST, promotores, CREs, dados de expressão e a caracterização agronômica, fisiológica e bioquímica de cultivares da cana. Em paralelo também desenvolveremos o banco de dado GRASSIUS para o estabelecimento das redes regulatórias de cana, arroz, milho e sorgo. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Biotecnologia para a cana 
Biotecnologia para a cana 
Patente(s) depositada(s) como resultado deste projeto de pesquisa

POLINUCLEOTÍDEO DE CANA-DE-AÇÚCAR QUE CONFERE TOLERÂNCIA A ESTRESSES ABIÓTICOS PI1105303-8 - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) . Glaucia Mendes de Souza; Marcelo Menossi Teixeira; Cesar Bueno de Souza; Andrea Akemi Hoshino; Éder Bedani Ruis Chagas - 22 de novembro de 2011

METHOD FOR PRODUCING GENETICALLY MODIFIED PLANTS WITH INCREASED RESISTANCE TO SALT STRESS AND DROUGHT PCT/BR2012/000499 - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) . Marcelo M. Teixeira; Glaucia M. Souza; Éder B. R. Chagas; Andrea A. Hoshino; Cesar B. de Souza - 06 de dezembro de 2012