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Instituto Nacional de Oncogenômica

Processo: 08/57887-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de março de 2009 - 28 de fevereiro de 2015
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina
Convênio/Acordo: CNPq - INCTs
Pesquisador responsável:Luiz Paulo Kowalski
Beneficiário:Luiz Paulo Kowalski
Instituição-sede: A C Camargo Cancer Center. Fundação Antonio Prudente (FAP). São Paulo , SP, Brasil
Auxílios(s) vinculado(s):13/02268-0 - Identificação de alterações genômicas associadas ao processo de metastização mamária axilar pelo sequenciamento do exoma, AV.EXT
Bolsa(s) vinculada(s):11/11085-1 - Biomarcadores preditivos em carcinomas epidermóides de orofaringe, BP.PD
11/07742-7 - Alterações genômicas em pacientes e seus familiares com a síndrome do câncer colorretal hereditário, BP.DR
10/15901-5 - Variação no número de cópias genômicas na avaliação de genes principais de predisposição em pacientes com síndrome de Mama-Cólon triados para mutações nos genes BRCA1, BRCA2, TP53 e CHEK2, BP.DD
09/08888-5 - Investigação genômica em famílias com síndromes de Li-Fraumeni e Li-Fraumeni like inexplicadas, BP.PD
09/02457-2 - Avaliação do papel das variantes de splicing dos genes TRIM37, BRRN1 e MK-STYX na gênese e progressão do câncer de mama, BP.PD
Assunto(s):Oncologia  Marcadores  Neoplasias  Marcador molecular  Genômica 

Resumo

A missão do Instituto Nacional de Oncogenômica (INOG) é prevenir e tratar o câncer por meio da aplicação de conceitos e tecnologias inovadoras. O principal objetivo é tornar o INOG o melhor centro integrado de pesquisa, tratamento e ensino oncológico da América Latina. Para tanto, pretende-se ampliar o entendimento dos cânceres mais frequentes em nossa população, tais como, próstata, mama e colorretal. As etapas deste estudo compreendem: (1) investigar as alterações germinativas no DNA (número de cópias de sequencias de DNA) no câncer familial, como um modelo de menor complexidade e heterogeneidade do que os tumores; (2) estender estes achados pela metodologia de sequenciamento em larga-escala em tumores familiais e esporádicos; (3) avaliar perfis de expressão intrônicos e exônicos nestes tumores; (4) testar novas abordagens para melhorar os métodos de imagem dos tumores; (5) identificar marcadores de resposta a quimioterapia neoadjuvante; e (6) avaliar o potencial da proteína F8 como um agente cicatrizante. O último editorial da Nature (Nature 455,138,11 de setembro, 2008) enfatiza a eficiência e a necessidade de abordagens mais compreensivas do que aquelas apresentadas em estudos prévios de genômica do câncer, incluindo as análises de sequencias genéticas simultâneas, as variações no número de cópias, os microarranjos de expressão e outras formas de análise dos dados. O editorial refere-se ao novo poder estatístico de três estudos publicados na semana anterior. Em conjunto, os resultados destes estudos mostraram que um único gene mutado não é a alteração principal em qualquer um dos tumores investigados, mas as análises baseadas no Genome Atlas revelaram um número bastante limitado de vias envolvidas (12 em cânceres pancreáticos e apenas 3 em glioblastomas). Assim, agentes terapêuticos que atuam nestas vias podem ser mais eficazes quando comparados com aqueles que atuam em apenas um dos componentes da via. O editorial também ressalta que as agências financiadoras precisam investir em um maior número de estudos em vários tipos de câncer. Considerando que o câncer é uma doença complexa, uma única definição não é suficiente, necessitando, portanto de um compromisso em longo prazo e análise de uma grande quantidade de dados para caracterizá-lo adequadamente. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Jovens se tornam os mais afetados por câncer de boca e garganta  

Publicações científicas (45)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DO CANTO, LUISA MATOS; CURY, SARAH SANTILONI; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; CATIN KUPPER, BRUNA ELISA; FERREIRA DE SOUZA BEGNAMI, MARIA DIRLEI; SCAPULATEMPO-NETO, CRISTOVAM; CARVALHO, ROBSON FRANCISCO; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; OLSEN, DORTE AALUND; MADSEN, JONNA SKOV; HAVELUND, BIRGITTE MAYLAND; AGUIAR, JR., SAMUEL; ROGATTO, SILVIA REGINA. Locally advanced rectal cancer transcriptomic-based secretome analysis reveals novel biomarkers useful to identify patients according to neoadjuvant chemoradiotherapy response. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, JUN 18 2019. Citações Web of Science: 0.
LOPEZ LAPA, RAINER MARCO; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; CUSTODIO DOMINGUES, MARIA APARECIDA; DE CARVALHO, GENIVAL BARBOSA; DRIGO, SANDRA APARECIDA; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA. Integrated miRNA and mRNA expression analysis uncovers drug targets in laryngeal squamous cell carcinoma patients. Oral Oncology, v. 93, p. 76-84, JUN 2019. Citações Web of Science: 0.
DO CANTO, LUISA MATOS; LARSEN, SIMON J.; CATIN KUPPER, BRUNA E.; FERREIRA DE SOUZA BEGNAMI, MARIA DIRLEI; SCAPULATEMPO-NETO, CRISTOVAM; PETERSEN, ANNABETH HOGH; AAGAARD, MADS M.; BAUMBACH, JAN; AGUIAR JR, SAMUEL; ROGATTO, SILVIA R. Increased Levels of Genomic Instability and Mutations in Homologous Recombination Genes in Locally Advanced Rectal Carcinomas. FRONTIERS IN ONCOLOGY, v. 9, MAY 14 2019. Citações Web of Science: 0.
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TORREZAN, GIOVANA T.; DE ALMEIDA, FERNANDA G. DOS SANTOS R.; FIGUEIREDO, MARCIA C. P.; DE FIGUEIREDO BARROS, BRUNA D.; DE PAULA, CLAUDIA A. A.; VALIERIS, RENAN; DE SOUZA, JORGE E. S.; RAMALHO, RODRIGO F.; DA SILVA, FELIPE C. C.; FERREIRA, ELISA N.; DE NOBREGA, AMANDA F.; FELICIO, PAULA S.; ACHATZ, MARIA I.; DE SOUZA, SANDRO J.; PALMERO, EDENIR I.; CARRARO, DIRCE M. Complex Landscape of Germline Variants in Brazilian Patients With Hereditary and Early Onset Breast Cancer. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, MAY 7 2018. Citações Web of Science: 1.
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DOS REIS, MARIANA BISARRO; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; BELTRAMI, CAROLINE MORAES; KUASNE, HELLEN; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; AMBATIPUDI, SRIKANT; HERCEG, ZDENKO; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA. Prognostic Classifier Based on Genome-Wide DNA Methylation Profiling in Well-Differentiated Thyroid Tumors. JOURNAL OF CLINICAL ENDOCRINOLOGY & METABOLISM, v. 102, n. 11, p. 4089-4099, NOV 1 2017. Citações Web of Science: 11.
DE SOUZA, MARILESIA FERREIRA; KUASNE, HELLEN; BARROS-FILHO, MATEUS DE CAMARGO; CILIAO, HELOISA LIZOTTI; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; FUGANTI, PAULO EMILIO; PASCHOAL, ALEXANDRE ROSSI; ROGATTO, SILVIA REGINA; DE SYLLOS COLUS, ILCE MARA. Circulating mRNAs and miRNAs as candidate markers for the diagnosis and prognosis of prostate cancer. PLoS One, v. 12, n. 9 SEP 14 2017. Citações Web of Science: 17.
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BELTRAMI, CAROLINE MORAES; DOS REIS, MARIANA BISARRO; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; KUASNE, HELLEN; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; AMBATIPUDI, SRIKANT; HERCEG, ZDENKO; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA. Integrated data analysis reveals potential drivers and pathways disrupted by DNA methylation in papillary thyroid carcinomas. CLINICAL EPIGENETICS, v. 9, MAY 2 2017. Citações Web of Science: 14.
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VILLACIS, ROLANDO A. R.; ABREU, FRANCINE B.; MIRANDA, PRISCILA M.; DOMINGUES, MARIA A. C.; CARRARO, DIRCE M.; SANTOS, ERIKA M. M.; ANDRADE, VICTOR P.; ROSSI, BENEDITO M.; ACHATZ, MARIA I.; ROGATTO, SILVIA R. ROBO1 deletion as a novel germline alteration in breast and colorectal cancer patients. TUMOR BIOLOGY, v. 37, n. 3, p. 3145-3153, MAR 2016. Citações Web of Science: 6.
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BERTONHA, FERNANDA BERNARDI; BARROS FILHO, MATEUS DE CAMARGO; KUASNE, HELLEN; DOS REIS, PATRICIA PINTOR; PRANDO, ERIKA DA COSTA; AUGUSTO MOYANO MUNOZ, JUAN JOSE; ROFFE, MARTIN; MAROSO HAJJ, GLAUCIA NOELI; KOWALSKI, LUIZ PAULO; RAINHO, CLAUDIA APARECIDA; ROGATTO, SILVIA REGINA. PHF21B as a candidate tumor suppressor gene in head and neck squamous cell carcinomas. MOLECULAR ONCOLOGY, v. 9, n. 2, p. 450-462, FEB 2015. Citações Web of Science: 5.
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CARRARO, DIRCE MARIA; AZEVEDO KOIKE FOLGUEIRA, MARIA APARECIDA; GARCIA LISBOA, BIANCA CRISTINA; RIBEIRO OLIVIERI, ELOISA HELENA; VITORINO KREPISCHI, ANA CRISTINA; DE CARVALHO, ALEX FIORINI; DE CARVALHO MOTA, LOUISE DANIELLE; PUGA, RENATO DAVID; MACIEL, MARIA DO SOCORRO; DEPIERI MICHELLI, RODRIGO AUGUSTO; DE LYRA, EDUARDO CARNEIRO; GIORGI GROSSO, STANA HELENA; SOARES, FERNANDO AUGUSTO; DE SOUZA WADDINGTON ACHATZ, MARIA ISABEL ALVES; BRENTANI, HELENA; MOREIRA-FILHO, CARLOS ALBERTO; BRENTANI, MARIA MITZI. Comprehensive Analysis of BRCA1, BRCA2 and TP53 Germline Mutation and Tumor Characterization: A Portrait of Early-Onset Breast Cancer in Brazil. PLoS One, v. 8, n. 3 MAR 1 2013. Citações Web of Science: 40.
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