Plataforma genômica aplicada ao melhoramento de citros

• Processo: 08/57909-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Acordo de Cooperação: CNPq - INCTs
• Pesquisador responsável: Marcos Antonio Machado
• Beneficiário: Marcos Antonio Machado
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Auxílio(s) vinculado(s): 16/09908-3 - Distribuição de toxin-Antitoxina tipo II e aspectos adaptativos nos genomas de Xanthomonas:foco em Xanthomonas citri., PUB.ART; 15/04776-9 - Transcriptional profile of sweet orange in response to chitosan and salicylic acid., PUB.ART; 14/07910-5 - XVI international Congress on molecular Plant-Microbe interactions, AR.EXT; + mais auxílios vinculados 13/20788-1 - RNA-Seq analysis of Citrus reticulata in the early stages of Xylella fastidiosa infection reveals auxin-related genes as a defense response, PUB.ART; 13/16823-6 - N-Acetylcysteine in agriculture, a novel use for an old molecule: focus on controlling the plant-pathogen Xylella fastidiosa, PUB.ART; 13/05626-5 - Candidatus Liberibacter americanus induces significant reprogramming of the transcriptome of the susceptible citrus genotype, PUB.ART - menos auxílios vinculados
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/13971-0 - Expressão global de genes de Candidatus Liberibacter asiaticus em diferentes fases do desenvolvimento do vetor (Diaphorina citri)., BP.DR; 15/14498-6 - Efetorômica: efetores como novas ferramentas para o controle de Phytophthora parasitica, agente da gomose e podridão de raízes dos citros., BP.PD; 14/00366-8 - Arabidopsis thaliana e Citrus leprosis virus-C: um modelo para o estudo da interação planta-patógeno, BP.DR; + mais bolsas vinculadas 13/08569-2 - Avaliação de citros transgênicos expressando fatores de transcrição em resposta a doenças., BP.MS; 12/18771-0 - Análise da expressão gênica de planta-modelo em resposta à leprose dos citros, BP.MS; 12/01917-2 - Genômica funcional e mapeamento genético de novos híbridos de citros tolerantes ao huanglongbing (HLB ou greening), BP.PD; 11/16518-3 - Expressão de genes da via do ácido salicílico em resposta à infecção por Candidatus Liberibacter spp., agente do Huanglongbing dos citros, BP.MS; 10/11072-4 - Prospecção e análise da atividade de peptídeos antimicrobianos no controle de patógenos de citros, BP.DR - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Genomas Citricultura Citrus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citrus | Genoma | Genoma Funcional | Melhoramento

Resumo

A citricultura brasileira se destaca como uma das mais importantes atividades do agronegócio, sendo o estado de São Paulo, Sergipe e Bahia os principais produtores de citros e o Brasil o maior exportador de sucos concentrado congelado (COJ) e suco não concentrado (NFC). A baixa produtividade agrícola brasileira (média de 2 caixas de 40,8 kg/planta/ano) está associada à expansão simultânea de pragas e doenças, com significativo reflexo nos custos de produção, ao plantio sem áreas irrigação e à estreita base genética da citricultura. Estima-se que mais de 60% dos custos de produção de citros no Brasil estejam relacionados ao controle fitossanitários de pragas e doenças. Entre as doenças destacam-se a clorose variegada dos citros, a leprose, a pinta preta, a mancha de alternaria, a morte súbita, o cancro cítrico, a gomose, a tristeza e, mais recentemente, o huanglongbing (greening). O esgotamento do modelo de convivência ou de controle químico de vetores de doenças com seus altos custos financeiros e ambientais têm destacado a importância dos trabalhos de melhoramento genético, como estratégia abrangente e duradoura de controle de doenças. O Centro de Citricultura Sylvio Moreira do Instituto Agronômico de Campinas e a Embrapa atuam há vários anos no melhoramento de citros, desenvolvendo trabalhos de produção e avaliação de novos materiais genéticos incorporando ferramentas de biotecnologia para acelerar ganhos genéticos. Como um dos institutos do milênio do CNPq/MCT (2002-2005) o Centro de Citricultura desenvolveu extenso banco de dados de genoma expresso de citros (CitEST), integrando melhoramento genético, genoma comparativo e funcional de citros e alguns de seus patógenos. Além de gerar o maior banco de dados de genoma de citros no mundo, esse projeto ampliou sobremaneira o número de novos híbridos de citros em avaliação de campo, além de marcadores moleculares para mapeamento genético e descobriu novos genes potencialmente associados a resistência a doenças. A presente proposta submetida ao edital 015/2008 dos Institutos Nacionais de Ciência, Tecnologia e Inovação representa a continuidade do programa do Instituto do Milênio, não só agregando as principais equipes que trabalham com citros no Brasil, mas focalizando os temas relacionados ao melhoramento genético e genoma funcional do grupo citros, procurando integrar três plataformas: Plataforma de Informação Genômica, onde o foco se concentrando nos estudos de genoma comparativo e funcional permitindo a ampliação da base de informações, incluindo genoma completo associado ao Consórcio Internacional do Genoma Citros, ampliação da base de dados de genoma expresso de citros, estudos de expressão gênica (micro arranjos) de citros e alguns de seus patógenos, suporte de bioinformática e transformação genética para produção de plantas geneticamente modificadas a partir de informações de genoma. Plataforma para Aplicação Genômica, na qual o foco são os estudos das interações planta-patógeno em patossistemas limitantes á citricultura brasileira e das interações planta-ambiente abiótico (estresse hídrico). Tais estudos permitirão ampliar a base de conhecimentos potencialmente aplicáveis nas fases seguintes do programa. Plataforma de Aplicação Genética, representando a interface avançada do melhoramento na quais muitas das informações geradas previamente (marcadores, mapas, genes, promotores), assim como material genético (híbridos de cruzamento controlado e eventos de transformação genética já obtida) serão validados em condições de campo, permitindo uma razoável aproximação da estratégia de melhoramento assistido por marcadores. Dessa plataforma derivarão novos materiais genéticos para a citricultura brasileira. A rede de multidisciplinar e multi-institucional do programa inclui, além do Centro de Citricultura na condição de coordenação, a Embrapa Mandioca e Fruticultura e sua rede de melhoramento de citros em outras unidades da empresa, a Embrapa Recursos Genético e Biotecnologia, a Escola Superior de Agricultura Luis de Queirós (ESALQ) e o Centro de Energia Nuclear na Agricultura (Cena), a Universidade Estadual de Campinas (Unicamp), o Instituto Biológico, a Universidade Federal de Campina Grande, a Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (Vitória da Conquista), a Universidade de Mogi das Cruzes (UMC) e a Universidade da Flórida. (AU)

Publicações científicas

(26)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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