Auxílio à pesquisa 07/53457-7 - Hepatite C, Filogenia - BV FAPESP
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Estudo da variabilidade genotípica dos vírus das Hepatites B e C na Colômbia

Processo: 07/53457-7
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2007
Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2011
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:João Renato Rebello Pinho
Beneficiário:João Renato Rebello Pinho
Instituição Sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Hepatite C  Filogenia  Técnicas de genotipagem  Doadores de sangue  Colômbia 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Colombia | Doadores De Sangue | Filogenia | Genotipagem | Hepatite C | Heptatite B

Resumo

As hepatites virais constituem um dos mais importantes problemas de saúde pública no mundo. Vários agentes podem causar estas patologias, dentre os quais se destacam os vírus das hepatites B (HBV) e C (HCV). Na Colômbia, poucos estudos epidemiológicos envolveram estes agentes, principalmente em relação à sua variabilidade genética. Considerando o importante impacto epidemiológico destes vírus ao redor do mundo, sua grande diversidade genética, a associação existente entre os tipos virais e diferentes formas da doença, as diferentes respostas dos genótipos aos fármacos e os poucos estudos realizados na Colômbia; este projeto propõe a realização de um estudo retrospectivo e prospectivo, com doadores de sangue voluntários em bancos de sangue de 7 regiões da Colômbia (Bogotá, Choco, Bucaramanga, Cartagena, Nariño, Letícia e San Andrés). As amostras com marcadores sorológicos positivos para HBV e HCV serão processadas para extração dos ácidos nucleicos virais, amplificação e seqüenciamento de certas regiões genômicas. Estas seqüências serão analisadas filogeneticamente visando avaliar a distribuição dos genótipos destes vírus nos doadores voluntários, a sua diversidade genética, a associação do genótipo viral com a região de origem da amostra e com algumas características dos doadores, como idade e gênero. A análise da distribuição dos genótipos destes vírus em diferentes localidades da Colômbia vai permitir inferir a história destas infecções na América do Sul, através da comparação das seqüências obtidas com outras previamente descritas, particularmente com as seqüências obtidas pelo nosso grupo de pesquisa em diferentes regiões do Brasil, como populações indígenas da Amazônia e populações urbanas dos estados de São Paulo, Paraná e Pará. (AU)

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CARVALHO ESPIRITO-SANTO, MARIA CRISTINA; ALVARADO-MORA, MONICA VIVIANA; SILVA PINTO, PEDRO LUIZ; ARROYO SANCHEZ, MARIA CARMEN; DIAS-NETO, EMMANUEL; PAGLIUSI CASTILHO, VERA LUCIA; DO NASCIMENTO GONCALVES, ELENICE MESSIAS; CHIEFFI, PEDRO PAULO; DE ALBUQUERQUE LUNA, EXPEDITO JOSE; REBELLO PINHO, JOAO RENATO; et al. Comparative Study of the Accuracy of Different Techniques for the Laboratory Diagnosis of Schistosomiasis Mansoni in Areas of Low Endemicity in Barra Mansa City, Rio de Janeiro State, Brazil. BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL, . (08/50461-6, 10/52615-0, 07/53457-7)
ESPIRITO-SANTO, M. C. C.; SANCHEZ, M. C. A.; SANCHEZ, A. R.; ALVARADO-MORA, M. V.; CASTILHO, V. L. P.; GONCALVES, E. M. N.; LUNA, E. J. A.; GRYSCHEK, R. C. B.. Evaluation of the sensitivity of IgG and IgM ELISA in detecting Schistosoma mansoni infections in a low endemicity setting. EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES, v. 33, n. 12, p. 2275-2284, . (08/50461-6, 10/52615-0, 07/53457-7)
LAUCK, MICHAEL; ALVARADO-MORA, MONICA V.; BECKER, ERICKA A.; BHATTACHARYA, DIPANKAR; STRIKER, ROB; HUGHES, AUSTIN L.; CARRILHO, FLAIR J.; O'CONNOR, DAVID H.; REBELLO PINHO, JOAO R.. Analysis of Hepatitis C Virus Intrahost Diversity across the Coding Region by Ultradeep Pyrosequencing. Journal of Virology, v. 86, n. 7, p. 3952-3960, . (08/50461-6, 07/53457-7)
VENEGAS, MAURICIO; ALVARADO-MORA, MONICA V.; VILLANUEVA, RODRIGO A.; REBELLO PINHO, JOAO R.; CARRILHO, FLAIR J.; LOCARNINI, STEPHEN; YUEN, LILLY; BRAHM, JAVIER. Phylogenetic Analysis of Hepatitis B Virus Genotype F Complete Genome Sequences From Chilean Patients With Chronic Infection. Journal of Medical Virology, v. 83, n. 9, p. 1530-1536, . (08/50461-6, 07/53457-7)
ALVARADO-MORA, MONICA V.; BOTELHO, LIVIA; GOMES-GOUVEA, MICHELE S.; DE SOUZA, VANDA F.; NASCIMENTO, MARIA C.; PANNUTI, CLAUDIO S.; CARRILHO, FLAIR J.; PINHO, JOAO R. R.. Detection of Hepatitis B virus subgenotype A1 in a Quilombo community from Maranhao, Brazil. VIROLOGY JOURNAL, v. 8, . (08/50461-6, 07/53457-7)
ALVARADO-MORA, MONICA VIVIANA; FERRAZ SANTANA, RUBIA ANITA; SITNIK, ROBERTA; ABRAO FERREIRA, PAULO ROBERTO; PITANGUEIRA MANGUEIRA, CRISTOVAO LUIS; CARRILHO, FLAIR JOSE; REBELLO PINHO, JOAO RENATO. Full-length genomic sequence of hepatitis B virus genotype C2 isolated from a native Brazilian patient. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 106, n. 4, p. 495-498, . (08/50461-6, 07/53457-7)
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ALVARADO MORA, MONICA VIVIANA; ROMANO, CAMILA MALTA; GOMES-GOUVEA, MICHELE SOARES; FERNANDA GUTIERREZ, MARIA; BOTELHO, LIVIA; CARRILHO, FLAIR JOSE; REBELLO PINHO, JOAO RENATO. Molecular characterization of the Hepatitis B virus genotypes in Colombia: A Bayesian inference on the genotype F. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 11, n. 1, p. 103-108, . (08/50461-6, 07/53457-7)
SANTOS, ALCIONE O.; ALVARADO-MORA, MONICA V.; BOTELHO, LIVIA; VIEIRA, DEUSILENE S.; REBELLO PINHO, JOAO R.; CARRILHO, FLAIR J.; HONDA, EDUARDO R.; SALCEDO, JUAN M.. Characterization of Hepatitis B virus (HBV) genotypes in patients from Rondonia, Brazil. VIROLOGY JOURNAL, v. 7, . (08/50461-6, 07/53457-7)
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CARVALHO ESPIRITO-SANTO, MARIA CRISTINA; ALVARADO-MORA, MONICA VIVIANA; SILVA PINTO, PEDRO LUIZ; ARROYO SANCHEZ, MARIA CARMEN; DIAS-NETO, EMMANUEL; PAGLIUSI CASTILHO, VERA LUCIA; DO NASCIMENTO GONCALVES, ELENICE MESSIAS; CHIEFFI, PEDRO PAULO; DE ALBUQUERQUE LUNA, EXPEDITO JOSE; REBELLO PINHO, JOAO RENATO; et al. Comparative Study of the Accuracy of Different Techniques for the Laboratory Diagnosis of Schistosomiasis Mansoni in Areas of Low Endemicity in Barra Mansa City, Rio de Janeiro State, Brazil. BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL, v. 2015, p. 16-pg., . (08/50461-6, 10/52615-0, 07/53457-7)
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CARVALHO ESPIRITO-SANTO, MARIA CRISTINA; ALVARADO-MORA, MONICA VIVIANA; DIAS-NETO, EMMANUEL; BOTELHO-LIMA, LIVIA SOUZA; MOREIRA, JOAO PAULO; AMORIM, MARIA; SILVA PINTO, PEDRO LUIZ; HEATH, ASHLEY R.; PAGLIUSI CASTILHO, VERA LUCIA; DO NASCIMENTO GONCALVES, ELENICE MESSIAS; et al. Evaluation of real-time PCR assay to detect Schistosoma mansoni infections in a low endemic setting. BMC INFECTIOUS DISEASES, v. 14, . (08/50461-6, 10/52615-0, 07/53457-7)
CARVALHO ESPIRITO-SANTO, MARIA CRISTINA; ALVARADO-MORA, MONICA VIVIANA; SILVA PINTO, PEDRO LUIZ; DE BRITO, THALES; BOTELHO-LIMA, LIVIA; HEATH, ASHLEY RICHARD; AMORIM, MARIA GALLI; DIAS-NETO, EMMANUEL; CHIEFFI, PEDRO PAULO; REBELLO PINHO, JOAO RENATO; et al. Detection of Schistosoma mansoni infection by TaqMan (R) Real-Time PCR in a hamster model. Experimental Parasitology, v. 143, p. 83-89, . (08/50461-6, 10/52615-0, 07/53457-7)
ALVARADO-MORA‚ M.V.; BOTELHO‚ L.; GOMES-GOUVÊA‚ M.S.; DE SOUZA‚ V.F.; NASCIMENTO‚ M.C.; PANNUTI‚ C.S.; CARRILHO‚ F.J.; PINHO‚ J.R.R.; OTHERS. Detection of Hepatitis B virus subgenotype A1 in a Quilombo community from Maranhão‚ Brazil. VIROLOGY JOURNAL, v. 8, n. 1, p. 1-6, . (07/53457-7, 08/50461-6)
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ALVARADO-MORA, MONICA V.; BOTELHO, LIVIA; NISHIYA, ANNA; NETO, RAYMUNDO A.; GOMES-GOUVEA, MICHELE S.; GUTIERREZ, MARIA F.; CARRILHO, FLAIR J.; PINHO, JOAO R. R.. Frequency and genotypic distribution of GB virus C (GBV-C) among Colombian population with Hepatitis B (HBV) or Hepatitis C (HCV) infection. VIROLOGY JOURNAL, v. 8, . (08/50461-6, 07/53457-7)
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CARVALHO DO ESPIRITO-SANTO, MARIA CRISTINA; ALVARADO-MORA, MONICA VIVIANA; SILVA PINTO, PEDRO LUIZ; CARRILHO, FLAIR JOSE; REBELLO PINHO, JOAO RENATO; BORGES GRYSCHEK, RONALDO CESAR. Duas amplificações sequenciais por PCR para detecção de Schistosoma mansoni em amostras de fezes com baixa carga parasitária. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 54, n. 5, p. 245-248, . (10/52615-0, 07/53457-7, 08/50461-6)
ALVARADO-MORA, MONICA VIVIANA; GUTIERREZ FERNANDEZ, MARIA FERNANDA; GOMES-GOUVEA, MICHELE SOARES; DE AZEVEDO NETO, RAYMUNDO SOARES; CARRILHO, FLAIR JOSE; REBELLO PINHO, JOAO RENATO. Hepatitis B (HBV), Hepatitis C (HCV) and Hepatitis Delta (HDV) Viruses in the Colombian Population-How Is the Epidemiological Situation?. PLoS One, v. 6, n. 4, . (08/50461-6, 07/53457-7)
VIEIRA, DEUSILENE S.; ALVARADO-MORA, MONICA V.; BOTELHO, LIVIA; CARRILHO, FLAIR J.; PINHO, JOAO R. R.; SALCEDO, JUAN M.. Distribution of hepatitis c virus (hcv) genotypes in patients with chronic infection from Rondonia, Brazil. VIROLOGY JOURNAL, v. 8, . (08/50461-6, 07/53457-7)
ALVARADO MORA, MONICA VIVIANA; ROMANO, CAMILA MALTA; GOMES-GOUVEA, MICHELE SCARES; GUTIERREZ, MARIA FERNANDA; CARRILHO, FLAIR JOSE; REBELLO PINHO, JOAO RENATO. Molecular epidemiology and genetic diversity of hepatitis B virus genotype E in an isolated Afro-Colombian community. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, v. 91, p. 8-pg., . (07/53457-7, 08/50461-6)