Mecanismos moleculars fundamentais responsaveis pela complexacao de proteinas. de parametros fisico-quimicos as aplicacoes em tecnologia de alimentos e farmaceutica.

• Processo: 10/50425-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2013
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Fernando Luis Barroso da Silva
• Beneficiário: Fernando Luis Barroso da Silva
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Método de Monte Carlo Interações eletrostáticas Moléculas bioativas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biomoleculas | Debye-Huckel | Interacao Ligante-Proteina | Interacoes Eletrostaticas | Modelo Continuo | Monte Carlo

Resumo

As interações eletrostáticas em e entre biomoléculas desempenham um importante papel no entendimento e no controle do comportamento de proteínas e de misturas de biopolímeros, incluindo vários sistemas de considerável relevância, tanto nas ciências da vida, como em (bio)tecnologia. Nesta proposta, pretendemos estudar (a) o efeito do mecanismo da regulação de cargas no aumento das demais interações eletrostáticas responsáveis pela complexação de proteínas, (b) aspectos eletrostaticos da interação proteína-polieletrólitos (e.g. interação caseina-pectina) e proteína-proteína (e.g. b-LG-b-LG). Nossa ferramenta básica de trabalho será a Mecânica Estatística (simulações moleculares), complementada com investigações em colaboração com grupos experimentais. O principal resultado final será a energia livre das interações (e suas derivadas). A modelagem dos sistemas será baseada em modelos contínuos anteriormente desenvolvidos por nós, cujas Hamiltonianas efetivas serão solucionadas por simulações com o método Monte Cario em conjunto com técnicas de perturbação termodinâmicas e algoritmos que serão desenvolvidos para facilitar a amostragem do espaço de fases. Pretende-se também revisar aspectos metodológicos, aprimorar e desenvolver novas ferramentas computacionais. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; PASQUALI, SAMUELA; DERREUMAUX, PHILIPPE; DIAS, LUIS GUSTAVO. Electrostatics analysis of the mutational and pH effects of the N-terminal domain self-association of the major ampullate spidroin. SOFT MATTER, v. 12, n. 25, p. 5600-5612, 2016. (10/50425-0, 13/08166-5)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; DERREUMAUX, PHILIPPE; PASQUALI, SAMUELA. Fast coarse-grained model for RNA titration. Journal of Chemical Physics, v. 146, n. 3, JAN 21 2017. (10/50425-0, 15/16116-3)

DELBONI, LARIANI APARECIDA; BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS. On the complexation of whey proteins. FOOD HYDROCOLLOIDS, v. 55, p. 89-99, APR 2016. (10/50425-0)

BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; BOSTROM, MATHIAS; PERSSON, CLAS. Effect of Charge Regulation and Ion-Dipole Interactions on the Selectivity of Protein-Nanoparticle Binding. Langmuir, v. 30, n. 14, p. 4078-4083, APR 15 2014. (10/50425-0)