Aplicação de instrumentos de bioinformática na avaliação de novas classes de antiretrovirais: antagonistas de CCR5 e inibidores de integrase

• Processo: 08/58138-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de agosto de 2009 - 31 de outubro de 2011
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Jorge Simao do Rosario Casseb
• Beneficiário: Jorge Simao do Rosario Casseb
• Instituição Sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 11/01487-5 - Aplicação de instrumentos de bioinformática na avaliação de novas classes de antiretrovirais: antagonistas de ccr5 e inibidores de integrase, BP.TT; 09/14215-3 - Aplicação de instrumentos de bioinformática na avaliação de novas classes de antiretrovirais: antagonistas de ccr5 e inibidores de integrase, BP.TT
• Assunto(s): Biologia computacional HIV-1 Integrase de HIV Tropismo Antirretrovirais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Hiv-1 | Integrase | Tropismo

Resumo

A elucidação de muitas das etapas do ciclo de replicação do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) e o desenvolvimento de novas tecnologias aplicadas a saúde propiciaram o desenvolvimento de novas estratégias para contornar as falhas terapêuticas. A disponibilização de novas drogas anti-retrovirais como os antagonistas de co-receptor e inibidores de integrase implica na seleção dos candidatos a utilizarem essas novas estratégias terapêuticas. Instrumentos de bioinformática podem representar uma alternativa mais acessível para a triagem dos pacientes, quando comparada aos ensaios atualmente estabelecidos. A partir de amostras de PBMCs de 100 pacientes soropositivos para HIV-1 e em acompanhamento clínico no Ambulatório de Imunodeficiências Secundárias -Departamento de Dermatologia (ADEE 3002)/HC-FMUSP, nosso estudo se propõe a identificar o padrão de uso dos co-receptores CCR5 e CXCR4 pelas cepas do HIV-1 através da análise do seqüenciamento da região V3 da gp120 do envelope do HIV-1 pelo uso de ferramentas de bioinformática e a verificação da presença de mutações capazes de conferir resistência ao uso de inibidores de integrase, através a análise do seqüenciamento da região da integrase do HIV-1. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LIÃ BÁRBARA ARRUDA; MARILIA LADEIRA DE ARAÚJO; MAIRA LUCCIA MARTINEZ; CLAUDIO ROBERTO GONSALEZ; ALBERTO JOSÉ DA SILVA DUARTE; EOIN COAKLEY; YOLANDA LIE; JORGE CASSEB. Determinação do tropismo viral por ensaios genotípicos e fenotípicos em pacientes brasileiros infectados por HIV-1. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 56, n. 4, p. 287-290, 2014-07-00. (10/00222-5, 08/58138-0, 08/51265-6)

ARRUDA, LIA BARBARA; FONSECA, LUIZ AUGUSTO M.; DUARTE, ALBERTO J. S.; CASSEB, JORGE. Genetic Diversity on the Integrase Region of the pol Gene among HIV Type 1-Infected Patients Naive for Integrase Inhibitors in Sao Paulo City, Brazil. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 26, n. 1, p. 105-107, JAN 2010. (08/51265-6, 08/58138-0)