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Caracterização citomolecular de indivíduos com alterações cromossômicas e genômicas: busca por genes relevantes para as implicações clínicas

Processo: 10/50737-1
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2010 - 28 de fevereiro de 2013
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
Beneficiário:Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Fenótipo  Peixes  Epigênese genética 

Resumo

O aprimoramento das técnicas citogenéticas e moleculares, entre elas a técnica de hibridação in situ por fluorescência (FISH) e as técnicas baseadas em arrays, tem permitido uma caracterização das alterações cromossômicas com um grau de resolução cada vez maior, possibilitando um maior conhecimento do papel da arquitetura genômica na formação dos rearranjos, dos genes envolvidos na produção da variabilidade fenotípica, bem como uma correlação genótipo-fenótipo mais precisa. O presente projeto propõe o estudo de grupos de pacientes portadores de diferentes alterações cromossômicas e genômicas com o intuito de se entender os mecanismos que resultam em rearranjos e se delinear um perfil de genes candidatos ao fenótipo dos pacientes. Serão investigados pacientes portadores de cromossomos em anel, de cromossomos marcadores extra, de cromossomos com deleção 22qll.2, com deleção 18p e de pacientes com rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados associados a fenótipo anormal, cada grupo desses consistindo da amostra de pacientes de três teses de mestrado e duas de doutorado. Serão utilizadas técnicas de citogenética clássica e de FISH, array de alta resolução, sequenciamento, RT-PCR quantitativa e de avaliação do padrão de metilação de genes de forma a: 1) determinar a extensão do desequilíbrio genômico e dos pontos de quebra; 2) determinar o mecanismo molecular de formação da alteração; 3) avaliar a expressão de genes potencialmente relevantes para o fenótipo; 4) avaliar o estado de metilação de genes e; 5) correlacionar os achados com as alterações fenotípicas. Os resultados dos estudos genéticos e epigenéticos nestes pacientes permitirão um melhor delineamento do papel dos genes na variabilidade fenotípica e um maior conhecimento dos mecanismos de formação dos desequilíbrios cromossômicos e genômicos. Além disso, a caracterização molecular das alterações encontradas fornecerá subsídios para um melhor seguimento dos pacientes e para o aconselhamento genético familiar. (AU)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SPREIZ, ANA; GUILHERME, ROBERTA S.; CASTELLAN, CLAUDIO; GREEN, ANDREW; RITTINGER, OLAF; WELLEK, BRIGITTE; UTERMANN, BARBARA; ERDEL, MARTIN; FAUTH, CHRISTINE; HABERLANDT, EDDA; KIM, CHONG A.; KULIKOWSKI, LESLIE D.; MELONI, VERA A.; UTERMANN, GERD; ZSCHOCKE, JOHANNES; MELARAGNO, MARIA I.; KOTZOT, DIETER. Single-Nucleotide Polymorphism Array-Based Characterization of Ring Chromosome 18. JOURNAL OF PEDIATRICS, v. 163, n. 4, p. 1174+, OCT 2013. Citações Web of Science: 4.
GUILHERME, R. S.; CERNACH, M. C. S. P.; SFAKIANAKIS, T. E.; TAKENO, S. S.; NARDOZZA, L. M. M.; ROSSI, C.; BHATT, S. S.; LIEHR, T.; MELARAGNO, M. I. A Complex Chromosome Rearrangement Involving Four Chromosomes, Nine Breakpoints and a Cryptic 0.6-Mb Deletion in a Boy with Cerebellar Hypoplasia and Defects in Skull Ossification. Cytogenetic and Genome Research, v. 141, n. 4, p. 317-323, 2013. Citações Web of Science: 4.
AYRES MELONI, VERA DE FREITAS; PIAZZON, FLAVIA BALBO; DE FARIA SOARES, MARIA DE FATIMA; TAKENO, SYLVIA SATOMI; CHRISTOFOLINI, DENISE MARIA; KULIKOWSKI, LESLIE DOMENICI; BRUNONI, DECIO; MELARAGNO, MARIA ISABEL. Cytogenomic characterization of an unexpected 17.6 Mb 9p deletion associated to a 14.8 Mb 20p duplication in a dysmorphic patient with multiple congenital anomalies presenting a normal G-banding karyotype. Gene, v. 496, n. 1, p. 59-62, MAR 15 2012. Citações Web of Science: 2.
NORONHA DUTRA, A. R.; MANCINI, T. I.; SATOMI TAKENO, S.; MOYSES OLIVEIRA, M.; KIM, C. A.; ALVAREZ PEREZ, A. B.; DOMENICI KULIKOWSKI, L.; MELARAGNO, M. I. Different Conformation of Two Supernumerary 18p Isochromosomes, One with a Concomitant Partial 18q Trisomy. Cytogenetic and Genome Research, v. 138, n. 1, p. 1-4, 2012. Citações Web of Science: 1.

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