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Caracterização biológica e molecular do HIV-1: identificação de epítopos relevantes ao controle da infecção e ao tropismo viral

Processo: 09/08215-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de março de 2010 - 29 de fevereiro de 2012
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Luís Fernando de Macedo Brígido
Beneficiário:Luís Fernando de Macedo Brígido
Instituição-sede: Instituto Adolfo Lutz (IAL). Coordenadoria de Controle de Doenças (CCD). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):11/12014-0 - Caracterização biológica e molecular do HIV-1: identificação de epítopos relevantes ao controle da infecção e ao tropismo viral, BP.TT
11/11502-1 - Caracterização biológica e molecular do HIV-1: identificação de epítopos relevantes ao controle da infecção e ao tropismo viral, BP.TT
10/17670-0 - Caracterização biológica e molecular do HIV-1: identificação de epítopos relevantes ao controle da infecção e ao tropismo viral, BP.TT
10/06794-0 - Caracterização biológica e molecular do HIV-1: identificação de epítopos relevantes ao controle da infecção e ao tropismo viral, BP.TT
Assunto(s):Doenças transmissíveis  HIV-1  Antirretrovirais  Agentes anti-HIV 

Resumo

O uso adequado de terapias antiretrovirais por pessoas vivendo com HIV/AIDS é uma questão estratégica em Saúde Pública, essencial ao controle da epidemia. Entre as inovações na área de medicamentos anti-HIV encontram-se novos agentes que inibem a entrada do HIV na célula hospedeira através da inibição da ligação do vírus ao co-receptor CCR5, um dos dois principais co-receptores virais. A eficácia destes medicamentos depende da capacidade do vírus HIV em utilizar o co-receptor CCR5, não atuando em variantes que utilizam co-receptores alternativos, como CXCR4. O uso pelo vírus de co-receptores CXCR4 está associado a variantes virais mais agressivas e a progressão clínica. Determinar o tropismo viral tem, portanto, implicações no entendimento da patogênese viral, no monitoramento epidemiológico da epidemia e é necessário para subsidiar a decisão clínica quanto ao uso desses novos medicamentos. Embora uma característica biológica, definida a partir de características de permissividade celular, o fenótipo de virions tem sido predito a partir do seqüênciamento genético de regiões do envelope viral envolvidas nesse tropismo, e diferentes ferramentas de bioinformática tem auxiliado nesse objetivo. A especificidade, e em especial a sensibilidade na detecção e variantes CXCR4 e variantes duotrópicas tem limitado sua aplicabilidade. O projeto prevê a caracterização molecular parcial do HIV-1 obtido de 270 voluntários em seguimento em serviços públicos do SUS com objetivo de melhorar a predição tropismo viral, e avaliar metodologias disponíveis em isolados circulantes em nosso meio. Esses métodos de predição genotípico, usualmente aplicados a vírions plasmáticos, serão adicionalmente avaliados em isolados obtidos de outros compartimentos biológicos, como sub-populações celulares. Este estudo propõe ainda avaliar dados moleculares e marcadores biológicos de progressão (e.g. TCD4) e de funcionalidade do co-receptor CCR5 (e.g. deleção 32 do gene e níveis séricos de ligantes). Os dados gerados serão avaliados individualmente e integrados em modelos matemáticos permitindo a associação ponderada de indicadores clínicos e laboratoriais como subsidio a predição e ao melhor entendimento da patogênese viral. Esta iniciativa favorece a implementação de infra-estrutura no Instituto Adolfo Lutz, e capacitação técnica-operacional e a condução de ações de suporte a Secretaria de Saúde Estado de São Paulo, contanto com o envolvimento de diferentes áreas do Instituto, a participação de Centros de Referência em Aids do Estado e do Programa Estadual de DST-Aids. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OZORIO COELHO, LUANA PORTES; DE PAULA FERREIRA, JOAO LEANDRO; CABRAL, GABRIELA BASTOS; DE SOUZA GUIMARAES, PAULA MORENA; DE MACEDO BRIGIDO, LUIS FERNANDO. Genotypic Tropism Prediction from Paired Cell and Plasma Using Single and Replicate Sequences. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 30, n. 7, p. 711-716, JUL 2014. Citações Web of Science: 0.
DE PAULA FERREIRA, JOAO LEANDRO; OZORIO COELHO, LUANA PORTES; RODRIGUES, ROSANGELA; CABRAL, GABRIELA BASTOS; CAVALCANTI, JAQUELINE DE SOUZA; DE SOUZA GUIMARAES, PAULA MORENA; DE MACEDO BRIGIDO, LUIS FERNANDO. Evaluation of genotypic prediction of HIV-1 tropism using population sequencing of replicates. Journal of Virological Methods, v. 179, n. 2, p. 325-329, FEB 2012. Citações Web of Science: 3.

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