Analise genomica comparativa de isolados de xylella fastidiosa obtidos de cafeeiros

• Processo: 09/50114-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de maio de 2009 - 30 de abril de 2011
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Regina Lucia Batista da Costa de Oliveira
• Beneficiário: Regina Lucia Batista da Costa de Oliveira
• Instituição Sede: Pró-Reitoria de Pesquisa, Pós-Graduação e Extensão e Assuntos Comunitários. Universidade de Mogi das Cruzes (UMC). Mogi das Cruzes , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 09/09651-9 - Análise genômica comparativa entre isolados de Xylella fastidiosa associados à CLS, BP.TT
• Assunto(s): Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Xylella fastidiosa Genômica comparativa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cvc E Cls | Genomica Comparativa | Hibridacao Subrativa Supressiv | Microarranjos De Dna | Xylella Fastidiosa

Resumo

Xylella fastidiosa (Xf) é um bacilo que se desenvolve no interior dos vasos xilemáticos de diversas espécies vegetais, associado ao desenvolvimento de patogenias em espécies de significativa importância econômica. Além da CVC, que acomete citros, outra fitopatogenia associada à Xf afeta um importante cultivar do agronegócio brasileiro: a Requeima Foliar do Cafeeiro (Coffee Leaf Scorch, ou CLS), cujos sintomas incluem seca de ramos, encurtamento de internódios, folhas cloróticas pequenas e deformadas, queima de bordos, abscisão foliar e rosetas agrupadas com frutos de menor tamanho. A doença foi descrita em 1997, em pomares dos estados de São Paulo e Minas Gerais e as relações evolutivas existentes entre os isolados de Xf obtidos de citros e café, associados à CVC e à CLS, são controversas: embora extremamente semelhantes, estudos evolutivos vêm resultando em filogenias que apresentam variações, dependendo do número de isolados testados e da metodologia utilizada. Estudos recentes sugerem que, embora representem grupos geneticamente distintos, os isolados de Xf associados à CVC e à CLS estão em constante recombinação, talvez representando um patossistema conjunto. Portanto, dada a coexistência de culturas de café e laranja no interior paulista, é possível que o pool gênico dos isolados de Xf-CLS sirva como um importante reservatório gênico potencial, podendo contribuir para a evolução dos isolados de Xf-CVC (e vice versa). O projeto aqui apresentado procurará ampliar nosso conhecimento sobre a estrutura genômica dos isolados de Xf obtidos de cafeeiros nos estados de São Paulo e Minas Gerais, representativos de diferentes grupos haplotípicos identificados nos pomares destas regiões. Uma abordagem, através de hibridações com microarranjos de DNA e de experimentos de hibridação subtrativa supressiva, será utilizada para a avaliação genômica de isolados de citros. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BARBOSA, DEIBS; ALENCAR, VALGUIRIA CAMPOS; SANTOS, DAIENE SOUZA; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA; DE SOUZA, ALESSANDRA A.; COLETTA-FILHO, HELVECIO D.; DE OLIVEIRA, REGINA COSTA; NUNES, LUIZ R.. Comparative genomic analysis of coffee-infecting Xylella fastidiosa strains isolated from Brazil. MICROBIOLOGY-SGM, v. 161, n. 5, p. 1018-1033, MAY 2015. (09/50114-7, 08/53231-1, 09/50115-3)

BARBOSA, DEIBS; ALENCAR, VALGUIRIA CAMPOS; SANTOS, DAIENE SOUZA; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA; DE SOUZA, ALESSANDRA A.; COLETTA-FILHO, HELVECIO D.; DE OLIVEIRA, REGINA COSTA; NUNES, LUIZ R.. Comparative genomic analysis of coffee-infecting Xylella fastidiosa strains isolated from Brazil. MICROBIOLOGY-SGM, v. 161, p. 16-pg., 2015-05-01. (08/53231-1, 09/50115-3, 09/50114-7)

JABES, DANIELA LEITE; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA; ALENCAR, VALQUIRIA CAMPOS; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA; SOUZA RENO, DEBORA LILIANE; SANTOS, DAIENE SOUZA; BARBOSA, DAVID ACIOLE; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI; DE OLIVEIRA RODRIGUES CUNHA, RODRIGO LUIZ; RODRIGUES, TIAGO; et al. Thioridazine inhibits gene expression control of the cell wall signaling pathway (CWI) in the human pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis. Molecular Genetics and Genomics, v. 291, n. 3, p. 1347-1362, JUN 2016. (09/50114-7, 12/12247-8, 09/50115-3)

ALENCAR, VALQURIA C.; BARBOSA, DEIBS; SANTOS, DAIENE S.; OLIVEIRA, ANA CLAUDIA F.; DE OLIVEIRA, REGINA C.; NUNES, LUIZ R.. Genomic Sequencing of Two Coffee-Infecting Strains of Xylella fastidiosa Isolated from Brazil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 2, n. 1, p. 2-pg., 2014-01-01. (08/53231-1, 09/50115-3, 09/50114-7)