Estudos funcionais e estruturais de proteínas humanas reguladoras envolvidas em câncer

• Processo: 08/04849-2
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de outubro de 2008 - 30 de setembro de 2010
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Jörg Kobarg
• Beneficiário: Jörg Kobarg
• Instituição-sede: Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS). Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): RNA mensageiro Mapeamento de interação de proteínas Regulação da expressão gênica

Resumo

Pretendemos estudar a função e estrutura de proteínas humanas reguladoras envolvidas em câncer. As funções e as estruturas das proteínas Ki-1/57, CGI-55, Fez1 e Nek (1,6,8,9) ainda não são conhecidas. Através de estudos feitos anteriormente no nosso grupo identificamos várias proteínas envolvidas em processos de sinalização e regulação que interagem com essas proteínas e estudos de microarray de DNA e outras análises tanto do nosso grupo como de outros da literatura demonstraram que os níveis de expressão dos mRNAs destas proteínas estão aumentadas (ou alteradas) em alguns tipos de câncer. O mRNA da stanniocalcina 1 (STC1) também é sete vezes mais expresso em células de estroma que foram colocadas em contato com células leucêmicas sugerindo que ela possa ser uma proteína candidata de marcador do microambiente tumoral. STC1 é uma proteína secretada, mas tanto sua função quanto seu receptor são ainda desconhecidos. Neste projeto pretendemos estudar a estrutura dessas proteínas ou de seus domínios através de métodos espectroscópicos e cristalograficas. Ainda analisaremos suas funções usando várias técnicas de biologia molecular, incluindo entre outras: 'silenciamento gênico' (método de RNAi), identificação de modificações pós-traducionais (espectrometria de massa), identificação de proteínas que interagem in vitro (sistema duplo híbrido em levedura) e in vivo (espectrometria de massa), SELEX ("Systematic Evolution of Ligands by eXponential Enrichment"), microarrays de DNA, análises da localização sub-celular (super-expressão de proteínas em fusão com GFP) e de função e interação em células humanas (sistema duplo híbrido em células de mamíferos), ensaios de quinases e testes de seus inibidores in vitro, entre outros. Com o conjunto de resultados esperamos de entender melhor a função e regulação destas proteínas no contexto do câncer e de obter novas pistas de tratamento de câncer (inibidores de quinases para Neks) e novos insumos no diagnóstico do mesmo (STC1, ELISA kit, RT-PCR). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

COSTA, FERNANDA C.; SAITO, ANGELA; GONCALVES, KALIANDRA A.; VIDIGAL, PEDRO M.; MEIRELLES, GABRIELA V.; BRESSAN, GUSTAVO C.; KOBARG, JOERG. Ki-1/57 and CGI-55 ectopic expression impact cellular pathways involved in proliferation and stress response regulation. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH, v. 1843, n. 12, p. 2944-2956, DEC 2014. Citações Web of Science: 3.

BRESSAN, GUSTAVO COSTA; KOBARG, JOERG. From protein interaction profile to functional assignment The human protein Ki-1/57 is associated with pre-mRNA splicing events. RNA BIOLOGY, v. 7, n. 3, p. 268-271, MAY-JUN 2010. Citações Web of Science: 3.