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Genotipagem dos polimorfismos de base única do gene da IL-28 em indivíduos infectados pelo vírus da hepatite C

Processo: 10/10549-1
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2010 - 31 de agosto de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:João Renato Rebello Pinho
Beneficiário:João Renato Rebello Pinho
Instituição-sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados: Ana Catharina de Seixas Santos Nastri ; Esper Georges Kallás
Bolsa(s) vinculada(s):11/02327-1 - Genotipagem dos polimorfismos de base única do gene da IL-28 em indivíduos infectados pelo Vírus da Hepatite C, BP.TT
Assunto(s):Vírus da hepatite C  Variação genética  Citocinas  Interferon tipo I  Polimorfismo de um único nucleotídeo  RNA viral 

Resumo

A infecção pelo vírus da Hepatite C (HCV) é a principal causa de doença hepática no mundo, com prevalência global estimada em 3%. Aproximadamente 30% dos indivíduos infectados pelo HCV eliminam-no espontaneamente, mas a grande maioria dos indivíduos evolui para uma infecção crônica que pode progredir para cirrose e hepatocarcinoma. Cinco estudos recentes do tipo Genome-Wide Association (GWAS) apontaram variações genéticas no gene da IL28B como preditores de resposta ao tratamento com interferon peguilado e ribavirina, bem como forte associação entre o polimorfismo no gene IL28B e o clareamento viral espontâneo. O gene IL28B, localizado no cromossomo 19q13, codifica uma proteína conhecida como interferon l (IFN tipo III). Este IFN é estruturalmente relacionado à superfamília de citocinas tipo IL-10, mas compartilha características funcionais com os interferons tipo I (IFN-a e IFN-b), que são estimulados por infecções virais. Nosso objetivo será verificar a freqüência dos polimorfismos de base única (SNP) rs12979860 e rs8099917 (localizados no cromossomo 19q13) de indivíduos infectados pelo HCV genótipo 1 com diferentes cursos clínicos e em um grupo controle de indivíduos não infectados pelo HCV.Não existem dados sobre a frequência dos diferentes SNPs na população brasileira e este trabalho será o primeiro a lidar com a sua frequência em pacientes brasileiros, bem como em um grupo controle de indivíduos não infectados pelo HCV.Serão admitidos pacientes com história de infecção atual ou anterior pelo HCV encaminhados aos Ambulatórios de Hepatologia do Departamento de Gastroenterologia do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo e ao Ambulatório de Hepatites do Centro de Referência e Treinamento DST/AIDS, subdivididos nos seguintes grupos: A) 50 pacientes com resolução espontânea da infecção pelo HCV - definida pela ausência de RNA viral detectável por PCR, simultaneamente à detecção de anticorpos anti - HCV em ao menos dois momentos distintos segundo a rotina laboratorial dos serviços envolvidos. Serão excluídos os pacientes com sorologia positiva para HIV e/ou HBsAg. Os resultados positivos obtidos para anti- HCV com o teste ELISA serão confirmados pelo teste de immunoblot (RIBA). Aqueles que apresentarem resultado indeterminado, serão ainda submetidos ao imunoensaio ELISpot para comprovar ou descartar a presença de infecção prévia pelo HCV. Será também realizado neste grupo o teste de sorotipagem para se determinar se quais foram previamente infectados pelo genótipo 1.B) 50 pacientes com infecção crônica pelo HCV e resposta virológica sustentada (SVR) ao tratamento com interferon peguilado e ribavirina - os pacientes com infecção crônica são caracterizados por sorologia positiva para HCV e pela detecção de RNA viral por PCR. A resposta virológica sustentada é definida pela ausência de RNA viral detectável por PCR seis meses após o término do tratamento. Serão excluídos pacientes com sorologia positiva para HIV e/ou HBsAg.C) 50 pacientes não respondedores ao tratamento, isto é, com RNA viral detectável ao término do tratamento com interferon peguilado e ribavirina, ou seja, o melhor tratamento disponível no momento. Serão excluídos pacientes com sorologia positiva para HIV e/ou HBsAg, bem como pacientes com diagnóstico de cirrose hepática.D) Grupo controle com 100 indivíduos da população geral sem infecção prévia pelo HCV. Serão determinados dois polimorfismos de base única (SNPs) ocalizados na região do gene da IL28B (rs12979860 e rs8099917). Para tanto, utilizaremos a técnica de PCR em tempo real.A análise estatística será realizada (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GONZALEZ-ALDACO, KARINA; PANDURO, ARTURO; PINHO, JOAO R. REBELLO; MARTINEZ-LOPEZ, ERIKA; GLEYZER, KETTI; FIERRO, NORA A.; ROMAN, SONIA. High Prevalence of ITPA Alleles Associated with Ribavirin-Induced Hemolytic Anemia Among Mexican Population. ANNALS OF HEPATOLOGY, v. 16, n. 2, p. 221-229, MAR-APR 2017. Citações Web of Science: 4.
GONZALEZ-ALDACO, KARINA; REBELLO PINHO, JOAO R.; ROMAN, SONIA; GLEYZER, KETTI; FIERRO, NORA A.; OYAKAWA, LETICIA; RAMOS-LOPEZ, OMAR; SANTANA, RUBIA A. FERRAZ; SITNIK, ROBERTA; PANDURO, ARTURO. Association with Spontaneous Hepatitis C Viral Clearance and Genetic Differentiation of IL28B/IFNL4 Haplotypes in Populations from Mexico. PLoS One, v. 11, n. 1 JAN 7 2016. Citações Web of Science: 15.
DIAS ANGELO, ANA LUIZA; CAVALCANTE, LOURIANNE NASCIMENTO; ABE-SANDES, KIYOKO; MACHADO, TAISA BONFIM; LEMAIRE, DENISE CARNEIRO; MALTA, FERNANDA; PINHO, JOAO RENATO; COSTA LYRA, LUIZ GUILHERME; LYRA, ANDRE CASTRO. Myxovirus resistance, osteopontin and suppressor of cytokine signaling 3 polymorphisms predict hepatitis C virus therapy response in an admixed patient population: comparison with IL28B. Clinics, v. 68, n. 10, p. 1325-1332, Out. 2013. Citações Web of Science: 4.

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