Agronomical and Environmental Genomes

• Processo: 00/09058-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2000
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2006
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Marie-Anne Van Sluys
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 03/03305-5 - Agronomical & environmental genomes (AEG), BP.TT; 00/15014-7 - Agronomical & Environmental Genomes, BP.TT
• Assunto(s): Melhoramento genético Mapeamento genético Análise de sequência de DNA Genômica Genomas Agronômicos e Ambientais - AEG
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Analise Genomica | Mapeamento Genetico | Melhoramento Genetico | Sequenciamento

Resumo

O programa "Agronomical & Environmental Genomes" (AEG) está associado ao ONSA/F APESP e tem como objetivo geral contribuir com a caracterização física de diferentes genomas associados a área ambiental e agronômica. Dentro do programa foram elaborados o sequenciamento de 06 genomas (3 genomas completos bacterianos e 3 ESTs). Dentre os genomas bacterianos foram realizados o sequenciamento do genoma de uma segunda linhagem de Xylella fastidiosa causadora de "Pierce's disease"; Leifsonia xylii subsp xylii e uma linhagem de Leptospira interrogans. No caso do sequenciamento de ESTs (expressed sequence tags) gerados a partir da extremidade 5' de um cDNA, foram analisadas diferentes tecidos de eucalipto, café e boi. Além do sequenciamento, realizou-se também a caracterização do potencial das proteínas expressas propriamente dito de todos os genomas bacterianos e uma análise está em andamento no banco de EST de eucalipto (FORESTs), café (CAFESTs) e boi (BEST). A anotação dos bancos permite a caracterização de vias metabólicas potenciais inclusive de rotas ainda não estabelecidas e são hoje consideradas ferramentas essenciais para a reconstrução metabólica do organismo em estudo. O estudo comparativo entre os organismos plenamente sequenciados contribuem com o conhecimento de genes universais que garantem a vida, além da identificação daqueles que podem ser transferidos lateralmente entre espécies distantes evolutivamente porém que tenham um contato ambiental próximo. (AU)