Validação de transcritos humanos

• Processo: 00/12502-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2000
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2003
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sandro Roberto Valentini
• Beneficiário: Sandro Roberto Valentini
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCFAR). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Genomas Etiquetas de sequências expressas Técnica ORESTES
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ests | Genoma | Orestes | Sequenciamento

Resumo

Uma tarefa fundamental na análise de genomas é a identificação dos genes. Esta tarefa é relativamente simples no caso de genomas compactos, mas se toma complexa quando se trata de genomas complexos. A Importância informacional dos cDNAs foi reconhecida desde o início do Projeto Genoma Humano. Entretanto, o sequenciamento completo de cDNAs é dispendioso e a geração de sequências em larga escala ainda necessita de avanços tecnológicos, tais como, preparo de bibliotecas de cDNA obtidas a partir de transcritos grandes e raros. O sequenciamento parcial de cDNAs (expressed sequence tags - ESTs) foi desenvolvido na tentativa de gerar sequências de cDNAs em larga escala, mostrando-se bastante útil na geração de sequências. O objetivo deste projeto será validar a estrutura e definir a sequência completa de genes humanos. Sequências gênicas serão extraídas dos bancos de dados do Projeto Genoma Humano. Estas sequências serão utilizadas como pontos de apoio para o mapeamento de ESTs (obtidas pela metodologia convencional ou por ORESTES) e para a predição de genes através da análise computacional. A validação será realizada principalmente por RT-PCT, subclonagem de fragmentos e sequenciamento. Espera-se que a estrutura e a sequência de 2.000 genes sejam definidas num período de dois anos. (AU)