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Laboratório de sequenciamento no Programa Genoma Humano do Câncer

Resumo

Nosso laboratório (PM 1) foi um dos 5 laboratórios de sequenciamento selecionados para fazer parte do grupo da Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (grupo PM) no projeto Genoma-Câncer FAPESP-Instituto Ludwig, sob a coordenação do Dr. Marcelo Briones. Durante o primeiro ano do projeto concentramo-nos no desenvolvimento e ação das técnicas de clonagem e sequenciamento; durante o segundo e terceiro, dedicamo-nos à produção das sequências propriamente ditas, atingindo o total 2.209 (conforme especificado no Anexo 1). Este total supera a meta estipulada pelo contrato inicial de 25.000 sequências. Durante a fase final do projeto tivemos algumas dificuldades, pois o material encaminhado para clonagem não apresentava a mesma qualidade das amostras anteriores. Anexamos, também, exemplos de placas submetidas e que foram abortadas pelo programa em decorrência de sequências com qualidade inadequada. Apesar das inúmeras tentativas de melhorar a qualidade das sequências, não fomos bem sucedidos. O projeto resultou em duas publicações em revista de circulação internacional, com co-autoria dos membros do laboratório e que estão incluídas neste relatório. Além disso, o Laboratório de Endocrinologia Molecular, por meio do conhecimento adquirido no desenvolvimento deste projeto e da infraestrutura recebida, está desenvolvendo diversos outros projetos de pesquisa na área de endocrinologia molecular, alguns deles já concluídos e aguardando publicação e outros submetidos a revistas de circulação internacional. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ARNALDI‚ LAT; BORRA‚ RC; MACIEL‚ RMB; CERUTTI‚ JM. Gene expression profiles reveal that DCN‚ DIO1‚ and DIO2 are underexpressed in benign and malignant thyroid tumors. THYROID, v. 15, n. 3, p. 210-221, . (01/00246-2, 00/12514-9, 99/03688-4)
DIAS DA SILVA‚ M.R.; CERUTTI‚ J.M.; TENGAN‚ C.H.; FURUZAWA‚ G.K.; VIEIRA‚ T.C.A.; GABBAI‚ A.A.; MACIEL‚ R.. Mutations linked to familial hypokalaemic periodic paralysis in the calcium channel α1 subunit gene (Cav1{\textperiodcentered} 1) are not associated with thyrotoxic hypokalaemic periodic paralysis. Clinical Endocrinology, v. 56, n. 3, p. 367-375, . (99/03688-4, 97/14182-9, 97/00145-4, 00/03442-4)
RYAN, DEVON P.; DA SILVA, MAGNUS R. DIAS; SOONG, TUCK WAH; FONTAINE, BERTRAND; DONALDSON, MATT R.; KUNG, ANNIE W. C.; JONGJAROENPRASERT, WALLAYA; LIANG, MUI CHENG; KHOO, DAPHNE H. C.; CHEAH, JIN SENG; et al. Mutations in Potassium Channel Kir2.6 Cause Susceptibility to Thyrotoxic Hypokalemic Periodic Paralysis. Cell, v. 140, n. 1, p. 88-98, . (99/03688-4, 00/03442-4)
MAGNUS R. DIAS DA SILVA; MARIA IZABEL CHIAMOLERA; TERESA S. KASAMATSU; JANETE M. CERUTTI; RUI M.B. MACIEL. Paralisia periódica hipocalêmica tirotóxica, uma urgência endócrina: revisão do quadro clínico e genético de 25 pacientes. Arquivos Brasileiros de Endocrinologia e Metabologia, v. 48, n. 1, p. 196-215, . (99/03688-4)

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