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Projeto Genoma - FAPESP: laboratório de sequenciamento

Processo: 97/13466-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
Vigência: 01 de dezembro de 1997 - 31 de agosto de 2000
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Luis Eduardo Soares Netto
Beneficiário:Luis Eduardo Soares Netto
Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Clorose variegada dos citros  Análise de sequência de DNA  Xylella fastidiosa  Genoma Xylella fastidiosa 

Resumo

Xylella fastidiosa é uma bactéria que causa uma série de doenças em plantas, as quais podem estar relacionadas com o crescimento deste micro-organismo no xilema dos hospedeiros. O genoma completo do clone 9ª5c, conhecido por induzir Citrus Variegated Chlorosis (CVC), foi sequenciado pelo consórcio ONSA. A obtenção da sequência completa do genoma Xylella fastidiosa poderá contribuir para a solução para o CVC. Os materiais utilizados foram de maio pureza possível. As sequências foram analisadas no sequenciador ABI Prism 377 DNa Sequencer, Perkin-Elmer, utilizando o kit Big-Dye (Perkin-Elmer). Procedimentos gerais como criação de bibliotecas de cosmídeos e plasmídeos são descritos. O nosso grupo optou por subclonar insertos de plasmídeos utilizando sonicação e posterior clonagem em pUC18. Para as análises de Bioinformática utilizamos os softwares Phred/Phrap/Consed (através do sistema LINUX); Sequin (NCBI), Blast (NCBI) entre outros. (AU)