Caracterização de genes envolvidos no desenvolvimento floral de cana-de-açúcar

• Processo: 00/07432-3
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Vigência: 01 de agosto de 2000 - 31 de julho de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Marcelo Carnier Dornelas
• Beneficiário: Marcelo Carnier Dornelas
• Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética molecular Cana-de-açúcar Desenvolvimento vegetal Genoma Cana-de-Açúcar - SucEST

Resumo

Como um laboratório de "Data-Mining", nosso objetivo tem sido identificar e anotar genes de cana-de-açúcar relacionados ao desenvolvimento reprodutivo. Os dados disponíveis no banco de dados do Projeto SUCEST foram investigados quanto à sua similaridade, em termos de sequência de nucleotídeos e de aminoácidos, com genes já publicados e consistentemente relacionados com os processos de florescimento. Para tal utilizou-se o algoritmo BLAST, bem como buscas por palavras-chave. Foram caracterizados e anotados mais de 200 clusters de ESTs de cana-de-açúcar que mostraram similaridade significativa (e-value médio menor que e-50) com genes comprovadamente relacionados com o florescimento. Estas comparações de sequências permitiram a identificação de passos evolutivos conservados entre o desenvolvimento floral de mono- e dicotiledôneas, bem como o de diferentes espécies de gramíneas. As famílias multigênicas de fatores de transcrição que compreendem os MADS-box e APETALA2 (AP2) mereceram atenção especial, uma vez que estas representam elementos-chave dos circuitos de transcrição que controlam o desenvolvimento reprodutivo vegetal. Usando esta abordagem, foi possível a elaboração de considerações a respeito da genética evolutiva do desenvolvimento floral de gramíneas em geral e suas relações com o modelo ABC, proposto para o desenvolvimento de flores de dicotiledôneas. Em paralelo com as análises de sequências, foram testados protocolos para estudos da morfo-anatomia do desenvolvimento floral da cana-de-açúcar. Estes protocolos forneceram as bases técnicas que nos permitiram a proposição de um projeto recentemente aprovado pela F APESP (processo nº 00/15071-0) para o estudo da morfo-anatomia de todo o desenvolvimento da cana-de-açúcar. Eles permitirão também a continuidade de nossos estudos do padrão de expressão gênica por técnicas de hibridização in situ. (AU)