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Metabolomics of sugarcane and discovery of new hydrolytic enzymes for biofuel production

Processo: 08/56100-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Temático
Vigência: 01 de novembro de 2010 - 31 de outubro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Convênio/Acordo: CNPq - Pronex
Pesquisador responsável:Carlos Alberto Labate
Beneficiário:Carlos Alberto Labate
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):12/22227-4 - Análise global dos mecanismos moleculares envolvidos na tolerância a seca e acúmulo de sacarose em duas variedades de cana-de-açúcar, BP.PD
12/12521-2 - Bioinformática aplicada à biologia sistêmica para a identificação dos fatores regulatórios do acúmulo de sacarose no colmo da cana-de-açúcar, BP.DR
12/04182-3 - Metabolômica do acúmulo de açúcares em cana-de-açúcar (Saccharum L.), BP.PD
11/13340-9 - Bioinformática aplicada à bioenergia: estudo probabilístico do metaboloma da cana-de-açúcar, BP.IC
10/15417-6 - Caracterização do proteoma e fosfoproteoma de cana-de-açúcar sob estresse hídrico, BP.PD
Assunto(s):Cana-de-açúcar  Bagaços 
Publicação FAPESP:http://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/pasta_bioen_jun2012_40.pdf

Resumo

Sugarcane bagasse and Eucalyptus are the main renewable feedstock available in Brazil for biofuel production. The project has two main lines of research: in the first part of we will characterize the metabolome of different tissues and organs of sugarcane varieties and, grown under different experimental conditions of biotic and abiotic stresses (drought, high and low temperature, pathogens, insects, high CO2, etc). The aim is to develop a data bank of metabolites and metabolic networks linking the transcriptomics information, already available, to identify new gene functions and phenotypes. All the information from sugarcane will be integrated into the bioinformatics server of SUCEST allowing the user to crosslink the data of experiments from transcriptomics, proteomics and metabolomics, molecular markers (such as QTLS and E-QTLS) or any other service available in the SUCEST server. The second part of the project will evaluate the potential to isolate new cellulases, hemicellulases and lignin degrading enzymes from microorganisms and insects occurring in areas of commercial plantations of eucalypts in Brazil, particularly in areas of reform. (AU)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CALDERAN-RODRIGUES, MARIA JULIANA; FONSECA, JULIANA GUIMARAES; DE MORAES, FABRICIO EDGAR; SETEM, LAIS VAZ; BEGOSSI, AMANDA CARMANHANIS; LABATE, CARLOS ALBERTO. Plant Cell Wall Proteomics: A Focus on Monocot Species, Brachypodium distachyon, Saccharum spp. and Oryza sativa. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 20, n. 8 APR 2 2019. Citações Web of Science: 3.
FONSECA, JULIANA G.; CALDERAN-RODRIGUES, MARIA J.; DE MORAES, FABRICIO E.; CATALDI, THAIS R.; JAMET, ELISABETH; LABATE, CARLOS A. Cell Wall Proteome of Sugarcane Young and Mature Leaves and Stems. PROTEOMICS, v. 18, n. 2 JAN 2018. Citações Web of Science: 6.
CALDERAN-RODRIGUES, MARIA JULIANA; JAMET, ELISABETH; DOUCHE, THIBAUT; RODRIGUES BONASSI, MARIA BEATRIZ; CATALDI, THAIS REGIANI; FONSECA, JULIANA GUIMARAES; SAN CLEMENTE, HELENE; PONT-LEZICA, RAFAEL; LABATE, CARLOS ALBERTO. Cell wall proteome of sugarcane stems: comparison of a destructive and a non-destructive extraction method showed differences in glycoside hydrolases and peroxidases. BMC PLANT BIOLOGY, v. 16, JAN 11 2016. Citações Web of Science: 14.
CALDERAN-RODRIGUES, MARIA JULIANA; JAMET, ELISABETH; CALDERAN RODRIGUES BONASSI, MARIA BEATRIZ; GUIDETTI-GONZALEZ, SIMONE; BEGOSSI, AMANDA CARMANHANIS; SETEM, LAIS VAZ; FRANCESCHINI, LIVIA MARIA; FONSECA, JULIANA GUIMARAES; LABATE, CARLOS ALBERTO. Cell wall proteomics of sugarcane cell suspension cultures. PROTEOMICS, v. 14, n. 6, p. 738-749, MAR 2014. Citações Web of Science: 25.

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