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Estudos de associação genômica das características reprodutivas de touros zebuínos (Bos indicus) utilizando SNP chip de alta densidade

Processo: 10/52030-2
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2011 - 30 de setembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária
Pesquisador responsável:José Fernando Garcia
Beneficiário:José Fernando Garcia
Instituição-sede: Faculdade de Medicina Veterinária (FMVA). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araçatuba. Araçatuba , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):12/19570-9 - Estudo de associação genômica das carcterísticas reprodutivas de touros zebuínos (Bos indcus) utilizando SNP chip de alta densidade, BP.TT
Assunto(s):Genomas  Melhoramento genético animal  Bovinos 

Resumo

Diversos estudos realizados nas áreas de genética quantitativa e genômica funcional demonstraram que a Associação Genômica (do inglês: Genome Wide Association Study - GWAS) permite a identificação de marcadores moleculares passíveis de uso nos processos de seleção, potencializando o ganho genético dos programas de melhoramento genético. Essa técnica pode permitir a identificação de marcadores genéticos associados a fenótipos específicos, tais como qualidade do sêmen e criotolerância espermática, úteis na seleção precoce, eficiente e confiável de reprodutores, aumentando assim a produtividade e a rentabilidade da pecuária bovina. O emprego de ferramentas moleculares avançadas, como o chip de polimorfismo de sítio único (SNP chip), tem maximizado os benefícios da seleção assistida por marcadores, permitindo a varredura uniforme do genoma para milhares de marcadores simultaneamente e propiciando a obtenção de mapas genômicos densos extremamente informativos. Levando em consideração a necessidade atual da cadeia produtiva bovina em encurtar os ciclos de produção pela seleção de animais superiores com melhor desempenho reprodutivo em idades precoces, o presente projeto propõe a identificação de marcadores moleculares associados à qualidade do sêmen e criotolerância espermática em touros de raças zebuínas utilizando SNP chip de alta densidade. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Estudo compara genoma de bovinos taurinos com zebuínos 

Publicações científicas (13)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AGUIAR, TAMIRIS SAYURI; PINTOR TORRECILHA, RAFAELA BEATRIZ; MILANESI, MARCO; HARTH UTSUNOMIYA, ADAM TAITI; TRIGO, BEATRIZ BATISTA; TIJJANI, ABDULFATAI; MUSA, HASSAN HUSSEIN; LOPES, FLAVIA LOMBARDI; AJMONE-MARSAN, PAOLO; CARVALHEIRO, ROBERTO; DE REZENDE NEVES, HAROLDO HENRIQUE; DO CARMO, ADRIANA SANTANA; HANOTTE, OLIVIER; SONSTEGARD, TAD STEWART; GARCIA, JOSE FERNANDO; UTSUNOMIYA, YURI TANI. Association of Copy Number Variation at Intron 3 of HMGA2 With Navel Length in Bos indicus. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, DEC 7 2018. Citações Web of Science: 0.
UTSUNOMIYA, YURI TANI; MILANESI, MARCO; HARTH UTSUNOMIYA, ADAM TAITI; PINTOR TORRECILHA, RAFAELA BEATRIZ; KIM, EUI-SOO; COSTA, MARCIO SILVA; AGUIAR, TAMIRIS SAYURI; SCHROEDER, STEVEN; DO CARMO, ADRIANA SANTANA; CARVALHEIRO, ROBERTO; REZENDE NEVES, HAROLDO HENRIQUE; MOROZINI PADULA, ROMULO CLAUDIO; SUSSAI, THAYLA SOUZA; ZAVAREZ, LUDMILLA BALBO; CIPRIANO, RAFAEL SILVA; THEODORO CAMINHAS, MARIA MARGARETH; HAMBRECHT, GEORGE; COLLI, LICIA; EUFEMI, ELISA; AJMONE-MARSAN, PAOLO; CESANA, DENEB; SANNAZARO, MARCO; BUORA, MAURIZIO; MORGANTE, MICHELE; LIU, GEORGE; BICKHART, DEREK; VAN TASSELL, CURTIS PAUL; SOLKNER, JOHANN; SONSTEGARD, TAD STEWART; GARCIA, JOSE FERNANDO. A PLAG1 mutation contributed to stature recovery in modern cattle. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, DEC 7 2017. Citações Web of Science: 8.
UTSUNOMIYA, ADAM T. H.; SANTOS, DANIEL J. A.; BOISON, SOLOMON A.; UTSUNOMIYA, YURI T.; MILANESI, MARCO; BICKHART, DEREK M.; AJMONE-MARSAN, PAOLO; SOELKNER, JOHANN; GARCIA, JOSE F.; DA FONSECA, RICARDO; DA SILVA, MARCOS V. G. B. Revealing misassembled segments in the bovine reference genome by high resolution linkage disequilibrium scan. BMC Genomics, v. 17, SEP 5 2016. Citações Web of Science: 12.
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; HOELER, DANIELA; BOISON, SOLOMON A.; MILANESI, MARCO; BOMBA, LORENZO; UTSUNOMIYA, YURI T.; CARVALHEIRO, ROBERTO; NEVES, HAROLDO H. R.; DA SILVA, MARCOS V. B.; VANTASSELL, CURTIS P.; SONSTEGARD, TAD S.; MESZAROS, GABOR; AJMONE-MARSAN, PAOLO; GARCIA, FERNANDO; SOELKNER, JOHANN. Low levels of taurine introgression in the current Brazilian Nelore and Gir indicine cattle populations. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 47, APR 17 2015. Citações Web of Science: 12.
BOISON, S. A.; NEVES, H. H. R.; PEREZ O'BRIEN, A. M.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; DA SILVA, M. V. G. B.; SOELKNER, J.; GARCIA, J. F. Imputation of non-genotyped individuals using genotyped progeny in Nellore, a Bos indicus cattle breed. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, n. SI, p. 176-189, AUG 2014. Citações Web of Science: 5.
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; MESZAROS, GABOR; UTSUNOMIYA, YURI T.; SONSTEGARD, TAD S.; GARCIA, J. FERNANDO; VAN TASSELL, CURTIS P.; CARVALHEIRO, ROBERTO; DA SILVA, MARCOS V. B.; SOLKNER, JOHANN. Linkage disequilibrium levels in Bos indicus and Bos taurus cattle using medium and high density SNP chip data and different minor allele frequency distributions. LIVESTOCK SCIENCE, v. 166, n. SI, p. 121-132, AUG 2014. Citações Web of Science: 24.
O'BRIEN, ANA M. PEREZ; UTSUNOMIYA, YURI T.; MESZAROS, GABOR; BICKHART, DEREK M.; LIU, GEORGE E.; VAN TASSELL, CURTIS P.; SONSTEGARD, TAD S.; DA SILVA, MARCOS V. B.; GARCIA, JOSE FERNANDO; SOELKNER, JOHANN. Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 46, MAR 4 2014. Citações Web of Science: 32.
NEVES, HAROLDO H. R.; CARVALHEIRO, ROBERTO; PEREZ O'BRIEN, ANA M.; UTSUNOMIYA, YURI T.; DO CARMO, ADRIANA S.; SCHENKEL, FLAVIO S.; SOELKNER, JOHANN; MCEWAN, JOHN C.; VAN TASSELL, CURTIS P.; COLE, JOHN B.; DA SILVA, MARCOS V. G. B.; QUEIROZ, SANDRA A.; SONSTEGARD, TAD S.; GARCIA, JOSE FERNANDO. Accuracy of genomic predictions in Bos indicus (Nellore) cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 46, FEB 27 2014. Citações Web of Science: 39.
UTSUNOMIYA, YURI T.; CARMO, ADRIANA S.; NEVES, HAROLDO H. R.; CARVALHEIRO, ROBERTO; MATOS, MARCIA C.; ZAVAREZ, LUDMILLA B.; ITO, PIER K. R. K.; O'BRIEN, ANA M. PEREZ; SOELKNER, JOHANN; PORTO-NETO, LAERCIO R.; SCHENKEL, FLAVIO S.; MCEWAN, JOHN; COLE, JOHN B.; DA SILVA, MARCOS V. G. B.; VAN TASSELL, CURTIS P.; SONSTEGARD, TAD S.; GARCIA, JOSE FERNANDO. Genome-Wide Mapping of Loci Explaining Variance in Scrotal Circumference in Nellore Cattle. PLoS One, v. 9, n. 2 FEB 18 2014. Citações Web of Science: 24.
PORTO-NETO, LAERCIO R.; SONSTEGARD, TAD S.; LIU, GEORGE E.; BICKHART, DEREK M.; DA SILVA, MARCOS V. B.; MACHADO, MARCO A.; UTSUNOMIYA, YURI T.; GARCIA, JOSE F.; GONDRO, CEDRIC; VAN TASSELL, CURTIS P. Genomic divergence of zebu and taurine cattle identified through high-density SNP genotyping. BMC Genomics, v. 14, DEC 13 2013. Citações Web of Science: 55.
UTSUNOMIYA, YURI T.; DO CARMO, ADRIANA S.; CARVALHEIRO, ROBERTO; NEVES, HAROLDO H. R.; MATOS, MARCIA C.; ZAVAREZ, LUDMILLA B.; O'BRIEN, ANA M. PEREZ; SOELKNER, JOHANN; MCEWAN, JOHN C.; COLE, JOHN B.; VAN TASSELL, CURTIS P.; SCHENKEL, FLAVIO S.; DA SILVA, MARCOS V. G. B.; PORTO NETO, LAERCIO R.; SONSTEGARD, TAD S.; GARCIA, JOSE F. Genome-wide association study for birth weight in Nellore cattle points to previously described orthologous genes affecting human and bovine height. BMC GENETICS, v. 14, JUN 13 2013. Citações Web of Science: 59.
UTSUNOMIYA, YURI TANI; O'BRIEN, ANA MARIA PEREZ; SONSTEGARD, TAD STEWART; VAN TASSELL, CURTIS PAUL; DO CARMO, ADRIANA SANTANA; MESZAROS, GABOR; SOELKNER, JOHANN; GARCIA, JOSE FERNANDO. Detecting Loci under Recent Positive Selection in Dairy and Beef Cattle by Combining Different Genome-Wide Scan Methods. PLoS One, v. 8, n. 5 MAY 16 2013. Citações Web of Science: 50.
BARBOSA‚ D.S.; MARANHÃO‚ R.C.; ARAÚJO‚ F.B.; CHANG‚ Y.H.; HIRATA‚ M.H.; ABDALLA‚ D.S.P. Sialic acid and oxidizability of low density lipoprotein subfractions of hyperlipidemic patients. CLINICAL BIOCHEMISTRY, v. 28, n. 4, p. 435-441, 1995.

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