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Estudo prospectivo de ligantes do receptor PPAR gama

Processo: 10/15376-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de abril de 2011 - 31 de março de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Alessandro Silva Nascimento
Beneficiário:Alessandro Silva Nascimento
Instituição-sede: Centro de Engenharia, Modelagem e Ciências Sociais Aplicadas (CECS). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
Pesq. associados: Marie Togashi ; Paul Webb
Assunto(s):Receptores ativados por proliferador de peroxissomo  PPAR gama  Ligantes 

Resumo

O receptor PPAR gama é um fator de transcrição regulado por ligante que desempenha um papel importante na regulação de genes associados ao metabolismo de lipídeos e regulação da glicemia, com importantes consequências para o manejo do diabetes melito do tipo II. Dado o número de estruturas cristalográficas já determinadas para este receptor, propomos, neste projeto, o uso desta informação estrutural para a modelagem de ligantes agonistas deste receptor. Dentre os desafios a serem vencidos, visionamos a prospecção de ligantes através de docking molecular e a avaliação dos modelos para o tratamento do solvente em cálculo de docking, cálculos de variação da energia livre através do método da integração termodinâmica para a otimização de ligantes e, finalmente, medidas experimentais da interação entre ligante e receptor através de espectroscopia de fluorescência e ensaios celulares. Ao final do projeto, esperamos ser capazes de identificar ao menos um novo ligante agonista do receptor PPAR gama, bem como promover avanços na área de modelagem da interação ligante-receptor. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MUNIZ, HELOISA S.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S. Towards a critical evaluation of an empirical and volume-based solvation function for ligand docking. PLoS One, v. 12, n. 3 MAR 21 2017. Citações Web of Science: 1.
DA SILVA, FLAVIA M. C.; DOS SANTOS, JADEMILSON C.; CAMPOS, JESSICA L. O.; MAFUD, ANA CAROLINA; POLIKARPOV, IGOR; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S. Structure-based identification of novel PPAR gamma ligands. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, v. 23, n. 21, p. 5795-5802, NOV 1 2013. Citações Web of Science: 16.
VAZ DE LIMA, LUIS ANTONIO C.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S. MolShaCS: A free and open source tool for ligand similarity identification based on Gaussian descriptors. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY, v. 59, p. 296-303, JAN 2013. Citações Web of Science: 12.

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