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Aquisição de uma plataforma de alta performance para análises computacionais aplicadas à medicina

Processo: 09/53853-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
Vigência: 01 de agosto de 2010 - 31 de julho de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Wilson Araújo da Silva Junior
Beneficiário:Wilson Araújo da Silva Junior
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Genômica  Transcriptômica  Sequenciamento de nova geração  Processamento de dados  Biologia computacional 
Publicação FAPESP:http://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/emu_bio_61.pdf
As informações de acesso ao Equipamento Multiusuário são de responsabilidade do Pesquisador responsável
Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
Tipo de equipamento: Tipo de Equipamento Multiusuário não informado
Fabricante: Fabricante não informado
Modelo: Modelo não informado

Resumo

A proposta visa a aquisição e estabelecimento de uma plataforma de alta-performance voltada para análises computacionais aplicados à medicina, com ênfase em genômica. A disponibilidade de diversos sequenciadores de nova-geração tem produzido um grande volume de dados e há um evidente gargalo na capacidade de processamento e análise computacional dos dados gerados. Os grupos envolvidos nessa proposta tem muita experiência com dados de sequenciamento e estão (e estiveram) diretamente envolvidos em vários projetos na área de genômica. Os dados provenientes das plataformas genômicas vem também sendo usados em diversas análises incluindo, desenho de drogas e modelagem de sistemas biológicos. A plataforma aqui proposta visa também auxiliar projetos nessas áreas de conhecimento. Esperamos que a plataforma venha a ter um significativo impacto nos projetos dos grupos envolvidos. A proposta engloba também a execução de dois cursos sobre processamento e análise de dados genômicos, abertos à comunidade interessada. (AU)

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Sagres Online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
Cassilândia Notícias: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
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Marechal News: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
Página1 PB: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
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Recôncavo no Ar: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
JH Notícias: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
Mais Santos online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
Foco Amazônico: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
Time 24 News (EUA): Brazilian scientists seek molecules to fight covid-19 (01/Abr/2020)
Na Hora Online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
Jornal ZM Notícias online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (01/Abr/2020)
Bioserv SMO: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (01/Abr/2020)
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A Tarde (BA) online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Folha de Pernambuco online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Bem Paraná online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater o coronavírus (31/Mar/2020)
A Crítica (MS) online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Pernambuco.com: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a Covid-19 (31/Mar/2020)
Época Negócios online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Jornal Dia Dia: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Ariquemes : Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Planeta Osasco: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Folha Vitória online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Ternura FM: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Dinheiro Rural online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
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Informe Baiano: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Panorama Farmacêutico: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Catve: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
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Conexão Política: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Tangará em Foco: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Novo Cantu Notícias: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Time 24 News (EUA): Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Atual MT: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a Covid-19 (31/Mar/2020)
Portal Vilson Nunes: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Revista Viver Goiás online: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Yahoo! Esportes: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a Covid-19 (31/Mar/2020)
Tá Sabendo?: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus. (30/Mar/2020)
Digital Rádio e TV: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus. (30/Mar/2020)
Saense: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (30/Mar/2020)
Jornal da Cidade (Bauru, SP) online: Laboratório paulista busca novo tratamento para a Covid-19 (29/Mar/2020)
Cruzeiro do Sul online: Pesquisadores de Campinas testam medicamentos (29/Mar/2020)
Associação Paulista de Jornais : Contexto Paulista: Laboratório de Campinas busca novo tratamento para a covid-19 - (29/Mar/2020)
Jornal Primeira Página: Pesquisadores de São Paulo testam medicamentos contra novo coronavírus (29/Mar/2020)
Cruzeiro do Sul: Pesquisadores de Campinas testam medicamentos (29/Mar/2020)
Acontece Botucatu : Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (29/Mar/2020)
O Imparcial (São Luis, MA): Cientistas brasileiros estão desenvolvendo vacina (29/Mar/2020)
Pfarma: Brasileiros testam potencial de 5 medicamentos contra o coronavírus (29/Mar/2020)
Central das Notícias: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (29/Mar/2020)
Atibaia: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (29/Mar/2020)
Portal do Governo do Estado de São Paulo: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Região Noroeste : Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra Covid-19 (28/Mar/2020)
São Carlos em Rede: Cientistas das Universidades de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
O Imparcial (Presidente Prudente, SP) online: Laboratório paulista busca novo tratamento para a Covid-19 (28/Mar/2020)
DHoje Interior online: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
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Notícias de Campinas: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus em Campinas, SP (28/Mar/2020)
Primeira Edição: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
SP Repórter News online: São Paulo : Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Z1 Portal de Notícias: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
SBNotícias: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Mix Vale: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Tribuna de Jundiaí online: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Rápido no Ar: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Beto Ribeiro Repórter: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus em Campinas, SP (28/Mar/2020)
Comando Notícia: Grupos de pesquisadores de SP testam medicamentos para combater o coronavírus - Comando Notícia (28/Mar/2020)
Cidade Azul Notícias: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Bocaina Informa: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Acontece Agora Online: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
O Verídico: Pesquisadores de SP testam potencial de medicamentos contra novo coronavírus (28/Mar/2020)
Plurale online: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Investe São Paulo: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Esteta : Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Galileu online: Brasileiros testam potencial de 5 medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Jornal GGN: Pesquisadores brasileiro testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
LabNetwork: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
JC Notícias (São Paulo, SP): Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Blog Jornal da Mulher: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Biblioteca FMUSP: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Atemporal: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Agora RN online: Pesquisadores de São Paulo testam medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
2A+ Farma: Pesquisadores brasileiros testam potencial de 5 fármacos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Algomais online: Pesquisadores testam antivirais existentes para combater coronavírus (27/Mar/2020)
Fatos do Iguaçu online: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Pfarma: Estratégia usada em vacina contra o ebola pode ser aplicada para o coronavírus (27/Mar/2020)
Portal da Enfermagem: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Central das Notícias: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Programa InfoSalud (Argentina): Investigadores testean potencial de medicamentos contra el nuevo coronavirus (27/Mar/2020)
Refugo: Brasileiros testam potencial de 5 medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Brasil CT&I: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Blog A Crítica: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Mundo e Meio: Pesquisadores testam potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
A Rádio Rock 89,1 FM: Pesquisadores brasileiros testam o potencial de medicamentos contra o novo coronavírus (27/Mar/2020)
Sindetran/BA - Sindicato dos Servidores do Departamento de Trânsito do Estado da Bahia: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a Covid-19 (04/Mar/2020)
Jornal Floripa: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (04/Jan/2020)
MT HOJE: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (04/Jan/2020)
Cadê Campos: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a Covid-19 (04/Jan/2020)
Manaus Alerta: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Subúrbio News: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a covid-19 (31/Mar/2020)
Portal Fiocruz: Pesquisadores brasileiros buscam moléculas para combater a Covid-19 (04/Jan/2020)

Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MUYS, BRUNA RODRIGUES; SOUSA, JOSANE F.; PLACA, JESSICA RODRIGUES; DE ARAUJO, LUIZA FERREIRA; SARSHAD, AISHE A.; ANASTASAKIS, DIMITRIOS G.; WANG, XIANTAO; LI, XIAO LING; DE MOLFETTA, GREICE ANDREOTTI; RAMAO, ANELISA; LAL, ASHISH; VIDAL, DANIEL ONOFRE; HAFNER, MARKUS; SILVA, WILSON A. miR-450a Acts as a Tumor Suppressor in Ovarian Cancer by Regulating Energy Metabolism. Cancer Research, v. 79, n. 13, p. 3294-3305, JUL 1 2019. Citações Web of Science: 3.
ARAUJO, LUIZA FERREIRA; MOLFETTA, GREICE ANDREOTTI; VINCENZI, OTAVIO COSTA; HUBER, JAIR; TEIXEIRA, LORENA ALVES; FERRAZ, VICTOR EVANGELISTA; SILVA JR, WILSON ARAUJO. Molecular basis of familial adenomatous polyposis in the southeast of Brazil: identification of six novel mutations. International Journal of Biological Markers, v. 34, n. 1, p. 80-89, MAR 2019. Citações Web of Science: 1.
ARAUJO, L. F.; SIENA, A. D. D.; PLACA, J. R.; BROTTO, D. B.; BARROS, I. I.; MUYS, B. R.; BIAGI JR, C. A. O.; PERONNI, K. C.; SOUSA, J. F.; MOLFETTA, G. A.; WEST, L. C.; WEST, A. P.; LEOPOLDINO, A. M.; ESPREAFICO, E. M.; SILVA JR, W. A. Mitochondrial transcription factor A (TFAM) shapes metabolic and invasion gene signatures in melanoma. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, SEP 21 2018. Citações Web of Science: 3.
ARAUJO, L. F.; TERRA, JR., A. T.; SARES, C. T. G.; SOBREIRA, C. F. R.; FARIA, E. F.; MACHADO, R. D.; RODRIGUES, JR., A. A.; MUGLIA, V. F.; SILVA, JR., W. A.; REIS, R. B. Mitochondrial genome analysis in penile carcinoma. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, v. 45, n. 4, p. 591-600, AUG 2018. Citações Web of Science: 2.
QUINTERO, MELISSA; ADAMOSKI, DOUGLAS; DOS REIS, LARISSA MENEZES; RODRIGUES ASCENCAO, CAROLLINE FERNANDA; SOUSA DE OLIVEIRA, KRISHINA RATNA; GONCALVES, KALIANDRA DE ALMEIDA; DIAS, MARILIA MEIRA; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; GOMES DIAS, SANDRA MARTHA. Guanylate-binding protein-1 is a potential new therapeutic target for triple-negative breast cancer. BMC CANCER, v. 17, NOV 7 2017. Citações Web of Science: 8.
KROLL, JOSE EDUARDO; GALANTE, PEDRO A. F.; OHARA, DANIEL T.; NAVARRO, FABIO C. P.; OHNO-MACHADO, LUCILA; DE SOUZA, SANDRO J. A new portal for the analysis of human splicing variants. RNA BIOLOGY, v. 9, n. 11, p. 1339-1343, NOV 2012. Citações Web of Science: 8.
BATISTA, FERNANDA A. H.; TRIVELLA, DANIELA B. B.; BERNARDES, AMANDA; GRATIERI, JOYCE; OLIVEIRA, PAULO S. L.; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; WEBB, PAUL; POLIKARPOV, IGOR. Structural Insights into Human Peroxisome Proliferator Activated Receptor Delta (PPAR-Delta) Selective Ligand Binding. PLoS One, v. 7, n. 5 MAY 11 2012. Citações Web of Science: 25.

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