EMU: aquisição de equipamentos para a estruturação de um laboratório multiusuário centralizado (facilities) para sequenciamento de DNA em larga escala e análise de expressão gênica

• Processo: 09/53984-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2012
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
• Beneficiário: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Assunto(s): Biogeoquímica Diversidade microbiana Expressão gênica Genômica funcional Polimorfismo genético Seleção genética Aquisição de materiais Laboratórios multiusuários Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ciclos Biogeoquimicos | Diversidade Microbiana | Expressao Genica | Genomica Funcional | Poliformismo | Selecao Genomica
• Publicação FAPESP: https://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/emu_av_19.pdf
• Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
• Tipo de equipamento: Tipo de Equipamento Multiusuário não informado
• Fabricante: Fabricante não informado
• Modelo: Modelo não informado

Resumo

O presente projeto, visa, através da aquisição de equipamentos para a estruturação de um laboratório centralizado (Facilitie), possibilitar aos pesquisadores dos Projetos Associados e dos Projetos Complementares, de forma otimizada e nacional, acesso às tecnologias moleculares de análise genômica de última geração para a agilização de suas pesquisas. Serão disponibilizadas as técnicas de sequenciamento em pequena e em larga escala, o desenvolvimento de painéis de SNP's de alta densidade, a genotipagem por SNP e por fragmentos de restrição e as várias maneiras de se abordar a análise da expressão gênica, seja por microarranjo ou por sequenciamento do transcriptoma ou regulação epigenética. Utilizarão estas metodologias 10 Projetos Associados e 18 Projetos Complementares, envolvendo as áreas de Melhoramento Animal e Vegetal, Conservação de Recursos Genéticos, Biotecnologia, Sequenciamento de Genomas. Metagenômica e Genômica Funcional de Fitopatógeno. A utilização destas metodologias possibilitará avanços qualitativos e quantitativos importantes nestes projetos, o que dará maior competitividade e inserção internacional das pesquisas. Além disso, aumentará a interação dos pesquisadores com outros grupos, tanto do Brasil como do exterior, tendo em vista que a adequação do parque de equipamentos com o que existe nos grandes centros de pesquisa permitirá o desenvolvimento de experimentos que antes não poderiam ser realizados. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

KISHI, LUCIANO T.; LOPES, ERICA M.; FERNANDES, CAMILA C.; FERNANDES, GABRIELA C.; SACCO, LAIS P.; CARARETO ALVES, LUCIA M.; LEMOS, ELIANA G. M.. Draft Genome Sequence of a Chitinophaga Strain Isolated from a Lignocellulose Biomass-Degrading Consortium. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 5, n. 3, JAN 2017. (10/17520-9, 09/53984-2)

KISHI, LUCIANO T.; LOPES, ERICA M.; FERNANDES, CAMILA C.; FERNANDES, GABRIELA C.; SACCO, LAIS P.; CARARETO ALVES, LUCIA M.; LEMOS, ELIANA G. M.. Draft Genome Sequence of a Chitinophaga Strain Isolated from a Lignocellulose Biomass-Degrading Consortium. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 5, n. 3, p. 2-pg., 2017-01-01. (09/53984-2, 10/17520-9)

LUZZI, MAYARA DE CASSIA; LOPES DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ; LIMA-DUARTE, LEIDIANE; CAMARGO, JAQUELINE VALERIA; KISHI, LUCIANO TAKESHI; FERNANDES, CAMILA CESARIO; MACHADO, ROSANGELA ZACARIAS; SOARES, JOAO FABIO; ANDRE, MARCOS ROGERIO; et al. Analysis on the prokaryotic microbiome in females and embryonic cell cultures of Rhipicephalus sanguineus tropical and temperate lineages from two specific localities in Brazil. REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINARIA, v. 30, n. 3, 2021. (07/57749-2, 09/53984-2, 15/26209-9, 20/03190-9)

OMORI, WELLINGTON P.; PINHEIRO, DANIEL G.; KISHI, LUCIANO T.; FERNANDES, CAMILA C.; FERANANDES, GABRIELA C.; GOMES-PEPE, ELISANGELA S.; PAVANI, CLAUDIO D.; LEMOS, ELIANA G. DE M.; DE SOUZA, JACKSON A. M.. Draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1 (Thermomonosporaceae) and in silico evidence of its functional role in filter cake biomass deconstruction. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 42, n. 1, p. 145-150, JAN-MAR 2019. (09/53984-2)

MATEUS-BARROS, ERICK; MENEGHINE, AYLAN K.; BAGATINI, INESSA LACATIVA; FERNANDES, CAMILA C.; KISHI, LUCIANO T.; VIEIRA, ARMANDO A. H.; SARMENTO, HUGO. Comparison of two DNA extraction methods widely used in aquatic microbial ecology. Journal of Microbiological Methods, v. 159, p. 12-17, APR 2019. (11/50054-4, 13/18083-0, 14/14139-3, 09/53984-2, 16/07679-7)