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EMU: aquisição de um espectrômetro de massas acoplado a cromatografia líquida para permitir ampliar a capacidade de atendimento de usuários e disponibilizar novas tecnologias no Laboratório de Espectrometria de Massas do Centro de Biologia Molecular Estrutural (ABTLUS)

Processo: 09/54067-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
Vigência: 01 de agosto de 2010 - 31 de julho de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Adriana Franco Paes Leme
Beneficiário:Adriana Franco Paes Leme
Instituição-sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Espectrometria de massas  Cromatografia líquida  Proteômica 
Publicação FAPESP:http://media.fapesp.br/bv/uploads/publicacoes/emu_bio_17.pdf
Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
Agendamento de uso: E-mail de agendamento não informado

Resumo

O equipamento solicitado é um espectrômetro de massas Synapt G2 (Waters) acoplado a um sistema de cromatografia líquida (nanoUPLC, Waters), em que se destacam como características resolução de 40.000 (FWHM), mantendo as especificações de resolução e exatidão de massas independente da velocidade de aquisição. Além disso, deve ser capaz de fazer quantificação absoluta e relativa sem marcação (label free), capaz de separar de íons por mobilidade iônica de acordo com conformação, bem como realizar experimentos de MSE que tem se mostrado uma estratégia fundamental para estudos de metabolômica. O equipamento solicitado permite colocar a comunidade científica dentro de um panorama internacional de competitividade na área de espectrometria de massas/proteômica, possibilita dar continuidade ao processo de formação, desenvolvimento e capacitação de usuários, além de permitir aumento de atendimento, e realizar experimentos em um equipamento mais robusto em termos de capacidade de análise. O espectrômetro de massas será disponibilizado como outros equipamentos multiusuários oferecidos pelo Laboratório de Espectrometria de Massas, que atualmente funciona como um dos três laboratórios centrais da Rede Proteoma, atendendo usuários de diversas áreas do conhecimento. A partir de julho de 2009 o laboratório passou a operar em modo contínuo de submissão de propostas permitindo atender a grande demanda de usuários, porém com restrição a experimentos específicos em função dos equipamentos disponíveis na instalação e maior demanda do que a capacidade do laboratório. Entre as características desse laboratório, o usuário conta com apoio técnico na operação dos espectrômetros e os softwares de análise, obtendo treinamento na área de proteômica/espectrometria de massas que são fundamentais para o desenvolvimento da pesquisa individual, refletindo no avanço do conhecimento nessa área em todo Brasil, aumentando a competitividade internacional. A necessidade de expansão do laboratório para atender um maior número de usuários e buscar aprimoramento para avançar com novas possibilidades de análise justifica a aquisição desse espectrômetro de massas. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio:
Prêmio destaca produção científica na área de oncologia no Brasil 

Publicações científicas (22)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CARNIELLI, CAROLINA MORETTO; SOARES MACEDO, CAROLINA CARNEIRO; DE ROSSI, TATIANE; GRANATO, DANIELA CAMPOS; RIVERA, CESAR; DOMINGUES, ROMENIA RAMOS; PAULETTI, BIANCA ALVES; YOKOO, SAMI; HEBERLE, HENRY; BUSSO-LOPES, ARIANE FIDELIS; CERVIGNE, NILVA KARLA; SAWAZAKI-CALONE, IRIS; MEIRELLES, GABRIELA VAZ; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; TELLES, GUILHERME PIMENTEL; MINGHIM, ROSANE; PRADO RIBEIRO, ANA CAROLINA; BRANDAO, THAIS BIANCA; CASTRO, JR., GILBERTO DE; ALEJANDRO GONZALEZ-ARRIAGADA, WILFREDO; GOMES, ALEXANDRE; PENTEADO, FABIO; SANTOS-SILVA, ALAN ROGER; LOPES, MARCIO AJUDARTE; RODRIGUES, PRISCILA CAMPIONI; SUNDQUIST, ELIAS; SALO, TUULA; DA SILVA, SABRINA DANIELA; ALAOUI-JAMALI, MOULAY A.; GRANER, EDGARD; FOX, JAY W.; DELLA COLETTA, RICARDO; PAES LEME, ADRIANA FRANCO. Combining discovery and targeted proteomics reveals a prognostic signature in oral cancer. NATURE COMMUNICATIONS, v. 9, SEP 5 2018. Citações Web of Science: 5.
RIVERA, CESAR; ZANDONADI, FLAVIA SILVA; SANCHEZ-ROMERO, CELESTE; SOARES, CIRO DANTAS; GRANATO, DANIELA CAMPOS; ALEJANDRO GONZALEZ-ARRIAGADA, WILFREDO; PAES LEME, ADRIANA FRANCO. Agrin has a pathological role in the progression of oral cancer. BRITISH JOURNAL OF CANCER, v. 118, n. 12, p. 1628-1638, JUN 2018. Citações Web of Science: 1.
GRANATO, DANIELA C.; P. E COSTA, RUTE A.; KAWAHARA, REBECA; YOKOO, SAMI; ARAGAO, ANNELIZE Z.; DOMINGUES, ROMENIA R.; PAULETTI, BIANCA A.; HONORATO, RODRIGO V.; FATTORI, JULIANA; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; CONSONNI, SILVIO R.; FERNANDES, DENISE; LAURINDO, FRANCISCO; HANSEN, HINRICH P.; LEME, ADRIANA F. PAES. Thioredoxin-1 Negatively Modulates ADAM17 Activity Through Direct Binding and Indirect Reductive Activity. Antioxidants & Redox Signaling, v. 29, n. 8 FEB 2018. Citações Web of Science: 0.
CAJADO-CARVALHO, DANIELA; GALVAO, JULIANA; KUNIYOSHI, ALEXANDRE K.; CARNEIRO, PATRICIA DOS SANTOS; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; PAULETTI, BIANCA ALVES; MARENGO, ELIANA BLINI; PORTARO, FERNANDA V. Tityus serrulatus Scorpion Venom: In Vitro Tests and Their Correlation with In Vivo Lethal Dose Assay. TOXINS, v. 9, n. 12 DEC 2017. Citações Web of Science: 2.
SCHAEFER, MIRIAM; GRANATO, DANIELA C.; KROSSA, SEBASTIAN; BARTELS, ANNE-KATHRIN; YOKOO, SAMI; DUSTERHOFT, STEFAN; KOUDELKA, TOMAS; SCHEIDIG, AXEL J.; THOLEY, ANDREAS; PAES LEME, ADRIANA F.; GROETZINGER, JOACHIM; LORENZEN, INKEN. GRP78 protects a disintegrin and metalloprotease 17 against protein-disulfide isomerase A6 catalyzed inactivation. FEBS Letters, v. 591, n. 21, p. 3567-3587, NOV 2017. Citações Web of Science: 3.
KAWAHARA, REBECA; GRANATO, DANIELA CAMPOS; YOKOO, SAMI; DOMINGUES, ROMENIA RAMOS; TRINDADE, DANIEL MARAGNO; PAES LEME, ADRIANA FRANCO. Mass spectrometry-based proteomics revealed Glypican-1 as a novel ADAM17 substrate. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 151, n. SI, p. 53-65, JAN 16 2017. Citações Web of Science: 2.
TAVARES, RAPHAEL; WAJNBERG, GABRIEL; SCHERER, NICOLE DE MIRANDA; PAULETTI, BIANCA ALVES; CASSOLI, JULIANA S.; FERREIRA, CARLOS GIL; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; DE ARAUJO-SOUZA, PATRICIA SAVIO; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; PASSETTI, FABIO. Unveiling alterative splice diversity from human oligodendrocyte proteome data. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 151, n. SI, p. 293-301, JAN 16 2017. Citações Web of Science: 1.
KORVALA, JOHANNA; MOSAKHANI, NEDA; ZANDONADI, FLAVIA S.; MEIRELLES, GABRIELA V.; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; COLETTA, RICARDO D.; LEIVO, ILMO; SALO, TUULA. . Experimental Cell Research, v. 350, n. 1, p. 9-18, JAN 1 2017. Citações Web of Science: 8.
RUBIO, MARCELO VENTURA; ZUBIETA, MARIANE PALUDETTI; LOURENO FRANCO CAIRO, JOAO PAULO; CALZADO, FELIPE; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; SQUINA, FABIO MARCIO; PRADE, ROLF ALEXANDER; DE LIMA DAMASIO, ANDRE RICARDO. Mapping N-linked glycosylation of carbohydrate-active enzymes in the secretome of Aspergillus nidulans grown on lignocellulose. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 9, AUG 8 2016. Citações Web of Science: 6.
HANSEN, HINRICH P.; TRAD, AHMAD; DAMS, MARIA; ZIGRINO, PAOLA; MOSS, MARCIA; TATOR, MAXIMILIAN; SCHOEN, GISELA; GRENZI, PATRICIA C.; BACHURSKI, DANIEL; AQUINO, BRUNO; DUERKOP, HORST; REINERS, KATRIN S.; VON BERGWELT-BAILDON, MICHAEL; HALLEK, MICHAEL; GROETZINGER, JOACHIM; ENGERT, ANDREAS; PAES LEME, ADRIANA F.; VON STRANDMANN, ELKE POGGE. CD30 on extracellular vesicles from malignant Hodgkin cells supports damaging of CD30 ligand-expressing bystander cells with Brentuximab-Vedotin, in vitro. ONCOTARGET, v. 7, n. 21, p. 30523-30535, MAY 24 2016. Citações Web of Science: 9.
FLORES, ISADORA L.; KAWAHARA, REBECA; MIGUEL, MARCIA C. C.; GRANATO, DANIELA C.; DOMINGUES, ROMENIA R.; MACEDO, CAROLINA C. S.; CARNIELLI, CAROLINA M.; YOKOO, SAMI; RODRIGUES, PRISCILA C.; MONTEIRO, BARBARA V. B.; OLIVEIRA, CARINE E.; SALMON, CRISTIANE R.; NOCITI, FRANCISCO H.; LOPES, MARCIO A.; SANTOS-SILVA, ALAN; WINCK, FLAVIA V.; COLETTA, RICARDO D.; PAES LEME, ADRIANA F. EEF1D modulates proliferation and epithelial-mesenchymal transition in oral squamous cell carcinoma. Clinical Science, v. 130, n. 10, p. 785-799, MAY 1 2016. Citações Web of Science: 11.
KAWAHARA, REBECA; MEIRELLES, GABRIELA V.; HEBERLE, HENRY; DOMINGUES, ROMENIA R.; GRANATO, DANIELA C.; YOKOO, SAMI; CANEVAROLO, RAFAEL R.; WINCK, FLAVIAV.; RIBEIRO, ANA CAROLINA P.; BRANDAO, THAIS BIANCA; FILGUEIRAS, PAULO R.; CRUZ, KAREN S. P.; BARBUTO, JOSE ALEXANDRE; POPPI, RONEI J.; MINGHIM, ROSANE; TELLES, GUILHERME P.; FONSECA, FELIPE PAIVA; FOX, JAY W.; SANTOS-SILVA, ALAN R.; COLETTA, RICARDO D.; SHERMAN, NICHOLAS E.; PAES LEME, ADRIANA F. Integrative analysis to select cancer candidate biomarkers to targeted validation. ONCOTARGET, v. 6, n. 41, p. 43635-43652, DEC 22 2015. Citações Web of Science: 4.
WINCK, FLAVIA V.; PRADO RIBEIRO, ANA CAROLINA; DOMINGUES, ROMENIA RAMOS; LING, LIU YI; RIANO-PACHON, DIEGO MAURICIO; RIVERA, CESAR; BRANDAO, THAIS BIANCA; GOUVEA, ADRIELE FERREIRA; SANTOS-SILVA, ALAN ROGER; COLETTA, RICARDO D.; PAES LEME, ADRIANA F. Insights into immune responses in oral cancer through proteomic analysis of saliva and salivary extracellular vesicles. SCIENTIFIC REPORTS, v. 5, NOV 5 2015. Citações Web of Science: 23.
CARNIELLI, CAROLINA M.; WINCK, FLAVIA V.; LEME, ADRIANA F. PAES. Functional annotation and biological interpretation of proteomics data. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1854, n. 1, p. 46-54, JAN 2015. Citações Web of Science: 17.
KAWAHARA, REBECA; GRANATO, DANIELA C.; CARNIELLI, CAROLINA M.; CERVIGNE, NILVA K.; OLIVERIA, CARINE E.; MARTINEZ, CESAR A. R.; YOKOO, SAMI; FONSECA, FELIPE P.; LOPES, MARCIO; SANTOS-SILVA, ALAN R.; GRANER, EDGARD; COLETTA, RICARDO D.; PAES LEME, ADRIANA FRANCO. Agrin and Perlecan Mediate Tumorigenic Processes in Oral Squamous Cell Carcinoma. PLoS One, v. 9, n. 12 DEC 15 2014. Citações Web of Science: 21.
GRANATO, DANIELA C.; ZANETTI, MARIANA R.; KAWAHARA, REBECA; YOKOO, SAMI; DOMINGUES, ROMENIA R.; ARAGAO, ANNELIZE Z.; AGOSTINI, MICHELLE; CARAZZOLLE, MARCELO F.; VIDAL, RAMON O.; FLORES, ISADORA L.; KORVALA, JOHANNA; CERVIGNE, NILVA K.; SILVA, ALAN R. S.; COLETTA, RICARDO D.; GRANER, EDGARD; SHERMAN, NICHOLAS E.; PAES LEME, ADRIANA F. Integrated Proteomics Identified Up-Regulated Focal Adhesion-Mediated Proteins in Human Squamous Cell Carcinoma in an Orthotopic Murine Model. PLoS One, v. 9, n. 5 MAY 23 2014. Citações Web of Science: 5.
KAWAHARA, REBECA; LIMA, RENATO NIYAMA; DOMINGUES, ROMENIA R.; PAULETTI, BIANCA ALVES; MEIRELLES, GABRIELA V.; ASSIS, MICHELLE; MIGLIORINI FIGUEIRA, ANA CAROLINA; PAES LEME, ADRIANA FRANCO. Deciphering the Role of the ADAM17-Dependent Secretome in Cell Signaling. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 13, n. 4, p. 2080-2093, APR 2014. Citações Web of Science: 19.
HANSEN, HINRICH P.; ENGELS, HANNA-MAREIKE; DAMS, MARIA; PAES LEME, ADRIANA F.; PAULETTI, BIANCA ALVES; SIMHADRI, VIJAYA LAKSHMI; DUERKOP, HORST; REINERS, KATRIN S.; BARNERT, SABINE; ENGERT, ANDREAS; SCHUBERT, ROLF; QUONDAMATTEO, FABIO; HALLEK, MICHAEL; VON STRANDMANN, ELKE POGGE. Protrusion-guided extracellular vesicles mediate CD30 trans-signalling in the microenvironment of Hodgkin's lymphoma. JOURNAL OF PATHOLOGY, v. 232, n. 4, p. 405-414, MAR 2014. Citações Web of Science: 12.
SIMABUCO, FERNANDO MOREIRA; KAWAHARA, REBECA; YOKOO, SAMI; GRANATO, DANIELA C.; MIGUEL, LUCAS; AGOSTINI, MICHELLE; ARAGAO, ANNELIZE Z. B.; DOMINGUES, ROMENIA R.; FLORES, ISADORA L.; MACEDO, CAROLINA C. S.; DELLA COLETTA, RICARDO; GRANER, EDGARD; PAES LEME, ADRIANA FRANCO. ADAM17 mediates OSCC development in an orthotopic murine model. Molecular Cancer, v. 13, FEB 5 2014. Citações Web of Science: 8.
WINCK, FLAVIA V.; BELLONI, MARILIA; PAULETTI, BIANCA A.; ZANELLA, JACKELINE DE LIMA; DOMINGUES, ROMENIA R.; SHERMAN, NICHOLAS E.; PAES LEME, ADRIANA F. Phosphoproteome analysis reveals differences in phosphosite profiles between tumorigenic and non-tumorigenic epithelial cells. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 96, p. 67-81, JAN 16 2014. Citações Web of Science: 8.
SCOTA FERREIRA, AMANDA PETRINA; CASSAGO, ALEXANDRE; GONCALVES, KALIANDRA DE ALMEIDA; DIAS, MARILIA MEIRA; ADAMOSKI, DOUGLAS; RODRIGUES ASCENCAO, CAROLLINE FERNANDA; HONORATO, RODRIGO VARGAS; DE OLIVEIRA, JULIANA FERREIRA; FERREIRA, IGOR MONTEZE; FORNEZARI, CAMILA; BETTINI, JEFFERSON; LOPES OLIVEIRA, PAULO SERGIO; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; PORTUGAL, RODRIGO VILLARES; BERTELI AMBROSIO, ANDRE LUIS; GOMES DIAS, SANDRA MARTHA. Active Glutaminase C Self-assembles into a Supratetrameric Oligomer That Can Be Disrupted by an Allosteric Inhibitor. Journal of Biological Chemistry, v. 288, n. 39, p. 28009-28020, SEP 27 2013. Citações Web of Science: 27.
ARAGAO, ANNELIZE Z. B.; NOGUEIRA, MARIA LUIZA C.; GRANATO, DANIELA C.; SIMABUCO, FERNANDO M.; HONORATO, RODRIGO V.; HOFFMAN, ZAIRA; YOKOO, SAMI; LAURINDO, FRANCISCO R. M.; SQUINA, FABIO M.; ZERI, ANA CAROLINA M.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; SHERMAN, NICHOLAS E.; PAES LEME, ADRIANA F. Identification of Novel Interaction between ADAM17 (a Disintegrin and Metalloprotease 17) and Thioredoxin-1. Journal of Biological Chemistry, v. 287, n. 51, p. 43071-43082, DEC 14 2012. Citações Web of Science: 22.

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